19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0565 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0565  4-vinyl reductase 4VR  100 
 
 
147 aa  298  2e-80  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0954628  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0460  4-vinyl reductase 4VR  33.55 
 
 
162 aa  84.7  4e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000553545  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0960  4-vinyl reductase 4VR  36.36 
 
 
197 aa  76.6  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0431  4-vinyl reductase, 4VR  25.38 
 
 
272 aa  66.6  0.00000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.958265  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1154  4-vinyl reductase, 4VR  29.03 
 
 
267 aa  66.6  0.0000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0567258  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2264  transcriptional regulator, MarR family  23.64 
 
 
259 aa  61.6  0.000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.989074 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0419  4-vinyl reductase 4VR  27.81 
 
 
181 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0328  4-vinyl reductase, 4VR  26.49 
 
 
177 aa  57.8  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1603  4-vinyl reductase 4VR  27.92 
 
 
173 aa  53.9  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0428  4-vinyl reductase, 4VR  29.93 
 
 
176 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.458206  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1553  ArsR family transcriptional regulator  25.47 
 
 
278 aa  52.8  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.088698  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0934  4-vinyl reductase, 4VR  27.81 
 
 
176 aa  51.6  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.00682831 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0656  4-vinyl reductase, 4VR  30.12 
 
 
244 aa  51.2  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3609  4-vinyl reductase 4VR  25.5 
 
 
175 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2966  4-vinyl reductase, 4VR  32.47 
 
 
178 aa  45.1  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1095  4-vinyl reductase 4VR  29.31 
 
 
241 aa  43.5  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1366  ArsR family transcriptional regulator  29.63 
 
 
252 aa  43.5  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00019196  hitchhiker  0.000000026398 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0755  4-vinyl reductase 4VR  25.81 
 
 
182 aa  43.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1913  4-vinyl reductase, 4VR  26 
 
 
369 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.15999  normal  0.993099 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>