29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_1913 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_1913  4-vinyl reductase, 4VR  100 
 
 		 369 aa  766    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.15999  normal  0.993099 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1866  V4R domain-containing protein  26.01 
 
 		 177 aa  53.9  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.46764  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1082  4-vinyl reductase 4VR  22.35 
 
 		 241 aa  53.5  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.123219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1053  4-vinyl reductase 4VR  22.35 
 
 		 241 aa  53.1  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0742  hypothetical protein  26.29 
 
 		 177 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1430  4-vinyl reductase 4VR  29.3 
 
 		 181 aa  50.8  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.354809  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3301  4-vinyl reductase 4VR  27.62 
 
 		 177 aa  50.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1977  hypothetical protein  26.29 
 
 		 177 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0830  hypothetical protein  26.29 
 
 		 177 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1004  hypothetical protein  26.29 
 
 		 177 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0708  hypothetical protein  26.29 
 
 		 177 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0473  hypothetical protein  26.29 
 
 		 177 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.712475  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2109  V4R domain-containing protein  26.29 
 
 		 220 aa  50.4  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5258  V4R domain-containing protein  25.99 
 
 		 174 aa  48.1  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.253966  normal  0.169978 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0934  4-vinyl reductase, 4VR  25 
 
 		 176 aa  47.8  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00682831 
 
 
-
 
NC_003296  RS02032  hypothetical protein  23.08 
 
 		 177 aa  46.6  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.198538 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1095  4-vinyl reductase 4VR  22.29 
 
 		 241 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3548  4-vinyl reductase 4VR  24.43 
 
 		 177 aa  46.2  0.0009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4820  4-vinyl reductase, 4VR  25 
 
 		 177 aa  46.2  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3173  4-vinyl reductase 4VR  32.26 
 
 		 241 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0115584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0888  putative sigma54 specific transcriptional regulator  28.42 
 
 		 543 aa  44.3  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3285  4-vinyl reductase, 4VR  24.86 
 
 		 177 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0573  4-vinyl reductase, 4VR  24.86 
 
 		 177 aa  43.9  0.005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5202  4-vinyl reductase 4VR  24.86 
 
 		 177 aa  43.5  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5020  4-vinyl reductase 4VR  24.86 
 
 		 177 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.856161 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4495  4-vinyl reductase, 4VR  24.86 
 
 		 177 aa  43.9  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132465  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5083  4-vinyl reductase, 4VR  24.86 
 
 		 177 aa  43.9  0.005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0677  4-vinyl reductase 4VR  25.69 
 
 		 245 aa  43.1  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.151462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0539  hypothetical protein  21.57 
 
 		 269 aa  43.1  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>