39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_3548 on replicon NC_010086
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010086  Bmul_3548  4-vinyl reductase 4VR  100 
 
 
177 aa  372  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5202  4-vinyl reductase 4VR  94.35 
 
 
177 aa  357  4e-98  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5020  4-vinyl reductase 4VR  94.35 
 
 
177 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.856161 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3285  4-vinyl reductase, 4VR  93.79 
 
 
177 aa  355  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4495  4-vinyl reductase, 4VR  94.35 
 
 
177 aa  356  9.999999999999999e-98  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132465  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5083  4-vinyl reductase, 4VR  93.79 
 
 
177 aa  355  9.999999999999999e-98  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0573  4-vinyl reductase, 4VR  93.22 
 
 
177 aa  353  5.999999999999999e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3301  4-vinyl reductase 4VR  89.27 
 
 
177 aa  341  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382929  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2109  V4R domain-containing protein  90.34 
 
 
220 aa  340  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0473  hypothetical protein  90.34 
 
 
177 aa  340  7e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.712475  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1977  hypothetical protein  90.34 
 
 
177 aa  340  7e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0742  hypothetical protein  90.34 
 
 
177 aa  340  7e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0830  hypothetical protein  90.34 
 
 
177 aa  340  7e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1004  hypothetical protein  90.34 
 
 
177 aa  340  7e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0708  hypothetical protein  90.34 
 
 
177 aa  340  7e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02032  hypothetical protein  90.96 
 
 
177 aa  340  8e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.198538 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1866  V4R domain-containing protein  90.34 
 
 
177 aa  339  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.46764  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4820  4-vinyl reductase, 4VR  86.93 
 
 
177 aa  324  4.0000000000000003e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5065  4-vinyl reductase 4VR  82.49 
 
 
178 aa  315  3e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.899756  normal  0.0144061 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1583  hypothetical protein  80.23 
 
 
178 aa  306  9e-83  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00919835  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5258  V4R domain-containing protein  81.03 
 
 
174 aa  297  7e-80  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.253966  normal  0.169978 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71250  hypothetical protein  58.38 
 
 
176 aa  207  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6184  hypothetical protein  58.38 
 
 
176 aa  207  6e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5224  hypothetical protein  57.71 
 
 
176 aa  207  8e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.483414  normal  0.0264656 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4052  V4R domain-containing protein  56.02 
 
 
200 aa  205  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.194533 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0395  hypothetical protein  57.14 
 
 
176 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4783  hypothetical protein  58.19 
 
 
176 aa  206  2e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0904638 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0989  hypothetical protein  59.66 
 
 
181 aa  204  8e-52  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0330  hypothetical protein  56 
 
 
176 aa  203  1e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.531959  normal  0.713784 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0332  hypothetical protein  56 
 
 
176 aa  202  2e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.946324  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4018  hypothetical protein  56.9 
 
 
184 aa  202  2e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4898  hypothetical protein  56 
 
 
176 aa  202  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49525  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0309  hypothetical protein  56 
 
 
176 aa  201  4e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715579  hitchhiker  0.00244357 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0496  hypothetical protein  56.9 
 
 
176 aa  198  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7507  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0862  4-vinyl reductase 4VR  54.29 
 
 
175 aa  193  9e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2725  hypothetical protein  54.44 
 
 
181 aa  186  2e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0761566  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1104  4-vinyl reductase, 4VR  45.4 
 
 
177 aa  156  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0067  4-vinyl reductase 4VR  33.14 
 
 
182 aa  100  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1913  4-vinyl reductase, 4VR  24.43 
 
 
369 aa  46.2  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.15999  normal  0.993099 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>