21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan7425_3173 on replicon NC_011884
Organism: Cyanothece sp. PCC 7425



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_3173  4-vinyl reductase 4VR  100 
 
 
241 aa  507  1e-143  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0115584  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1082  4-vinyl reductase 4VR  68.75 
 
 
241 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.123219  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1053  4-vinyl reductase 4VR  68.33 
 
 
241 aa  374  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1095  4-vinyl reductase 4VR  70.35 
 
 
241 aa  360  1e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0677  4-vinyl reductase 4VR  71.82 
 
 
245 aa  347  9e-95  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.151462  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1092  4-vinyl reductase 4VR  30 
 
 
224 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.66255 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3170  4-vinyl reductase 4VR  29.47 
 
 
226 aa  99.4  5e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0331787  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1056  4-vinyl reductase 4VR  27.48 
 
 
224 aa  95.9  5e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1085  4-vinyl reductase 4VR  27.35 
 
 
224 aa  93.6  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.812953  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0067  4-vinyl reductase 4VR  25.5 
 
 
182 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1154  4-vinyl reductase, 4VR  26.97 
 
 
267 aa  49.7  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0567258  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0692  4-vinyl reductase 4VR  36.84 
 
 
241 aa  48.1  0.0001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446111  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0539  hypothetical protein  23.26 
 
 
269 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1104  4-vinyl reductase, 4VR  25.81 
 
 
177 aa  46.2  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1553  ArsR family transcriptional regulator  32 
 
 
278 aa  45.4  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.088698  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1913  4-vinyl reductase, 4VR  32.26 
 
 
369 aa  45.4  0.0008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.15999  normal  0.993099 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0523  4-vinyl reductase 4VR  32.31 
 
 
162 aa  45.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00266951  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1430  4-vinyl reductase 4VR  25.48 
 
 
181 aa  43.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.354809  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3221  ArsR family transcriptional regulator  32.14 
 
 
245 aa  42.7  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0279242 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1844  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.16 
 
 
714 aa  42.7  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.257508  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2264  transcriptional regulator, MarR family  30.36 
 
 
259 aa  42  0.009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.989074 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>