19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_1082 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1082  4-vinyl reductase 4VR  100 
 
 		 241 aa  499  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.123219  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1053  4-vinyl reductase 4VR  99.59 
 
 		 241 aa  498  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3173  4-vinyl reductase 4VR  68.75 
 
 		 241 aa  375  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0115584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1095  4-vinyl reductase 4VR  70.83 
 
 		 241 aa  371  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0677  4-vinyl reductase 4VR  63.29 
 
 		 245 aa  333  1e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.151462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3170  4-vinyl reductase 4VR  32.12 
 
 		 226 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0331787  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1092  4-vinyl reductase 4VR  28.64 
 
 		 224 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.66255 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1056  4-vinyl reductase 4VR  28.84 
 
 		 224 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1085  4-vinyl reductase 4VR  27.85 
 
 		 224 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.812953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1913  4-vinyl reductase, 4VR  22.35 
 
 		 369 aa  53.5  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.15999  normal  0.993099 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0692  4-vinyl reductase 4VR  36.49 
 
 		 241 aa  53.1  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446111  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1430  4-vinyl reductase 4VR  26.62 
 
 		 181 aa  52.8  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.354809  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1154  4-vinyl reductase, 4VR  28.57 
 
 		 267 aa  50.1  0.00003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0567258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0539  hypothetical protein  24.68 
 
 		 269 aa  48.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0523  4-vinyl reductase 4VR  30.77 
 
 		 162 aa  46.6  0.0003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00266951  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1844  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.58 
 
 		 714 aa  43.9  0.002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.257508  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2264  transcriptional regulator, MarR family  34.04 
 
 		 259 aa  43.5  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.989074 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3221  ArsR family transcriptional regulator  31.03 
 
 		 245 aa  42  0.008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0279242 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1553  ArsR family transcriptional regulator  31.48 
 
 		 278 aa  42  0.009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.088698  normal  0.342387 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>