43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1104 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1104  4-vinyl reductase, 4VR  100 
 
 		 177 aa  366  1e-100  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4820  4-vinyl reductase, 4VR  47.16 
 
 		 177 aa  166  1e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02032  hypothetical protein  45.2 
 
 		 177 aa  160  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.198538 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1866  V4R domain-containing protein  45.45 
 
 		 177 aa  160  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.46764  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5020  4-vinyl reductase 4VR  45.4 
 
 		 177 aa  157  7e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.856161 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4495  4-vinyl reductase, 4VR  45.4 
 
 		 177 aa  157  7e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0862  4-vinyl reductase 4VR  45.61 
 
 		 175 aa  157  8e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3548  4-vinyl reductase 4VR  45.4 
 
 		 177 aa  156  2e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1977  hypothetical protein  46.07 
 
 		 177 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0742  hypothetical protein  46.07 
 
 		 177 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0830  hypothetical protein  46.07 
 
 		 177 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1004  hypothetical protein  46.07 
 
 		 177 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0708  hypothetical protein  46.07 
 
 		 177 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1583  hypothetical protein  44.63 
 
 		 178 aa  155  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00919835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0573  4-vinyl reductase, 4VR  44.32 
 
 		 177 aa  155  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0473  hypothetical protein  46.07 
 
 		 177 aa  156  2e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.712475  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2109  V4R domain-containing protein  46.07 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5065  4-vinyl reductase 4VR  44.63 
 
 		 178 aa  155  4e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.899756  normal  0.0144061 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3285  4-vinyl reductase, 4VR  43.75 
 
 		 177 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5202  4-vinyl reductase 4VR  43.75 
 
 		 177 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5083  4-vinyl reductase, 4VR  43.75 
 
 		 177 aa  153  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3301  4-vinyl reductase 4VR  43.75 
 
 		 177 aa  152  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382929  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5258  V4R domain-containing protein  43.43 
 
 		 174 aa  147  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.253966  normal  0.169978 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4018  hypothetical protein  42.77 
 
 		 184 aa  140  9e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0989  hypothetical protein  41.52 
 
 		 181 aa  140  9.999999999999999e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71250  hypothetical protein  46.53 
 
 		 176 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6184  hypothetical protein  46.53 
 
 		 176 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5224  hypothetical protein  45.21 
 
 		 176 aa  138  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.483414  normal  0.0264656 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0309  hypothetical protein  44.52 
 
 		 176 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715579  hitchhiker  0.00244357 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0330  hypothetical protein  42.76 
 
 		 176 aa  137  1e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.531959  normal  0.713784 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4898  hypothetical protein  44.52 
 
 		 176 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49525  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0332  hypothetical protein  44.52 
 
 		 176 aa  136  1e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.946324  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4052  V4R domain-containing protein  43.29 
 
 		 200 aa  136  2e-31  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.194533 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2725  hypothetical protein  37.93 
 
 		 181 aa  132  1.9999999999999998e-30  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0761566  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4783  hypothetical protein  43.15 
 
 		 176 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0904638 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0395  hypothetical protein  43.15 
 
 		 176 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0496  hypothetical protein  43.75 
 
 		 176 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0067  4-vinyl reductase 4VR  33.73 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3173  4-vinyl reductase 4VR  25.81 
 
 		 241 aa  46.2  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0115584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0677  4-vinyl reductase 4VR  22.81 
 
 		 245 aa  44.7  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.151462  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0539  hypothetical protein  25.36 
 
 		 269 aa  42  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1603  4-vinyl reductase 4VR  26.67 
 
 		 173 aa  41.2  0.007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1913  4-vinyl reductase, 4VR  22.41 
 
 		 369 aa  41.2  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.15999  normal  0.993099 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>