38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5224 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5224  hypothetical protein  100 
 
 		 176 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.483414  normal  0.0264656 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0309  hypothetical protein  95.45 
 
 		 176 aa  352  1e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.715579  hitchhiker  0.00244357 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4898  hypothetical protein  95.45 
 
 		 176 aa  352  1e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.49525  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4783  hypothetical protein  94.89 
 
 		 176 aa  351  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0904638 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0332  hypothetical protein  94.89 
 
 		 176 aa  351  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.946324  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0330  hypothetical protein  94.89 
 
 		 176 aa  351  4e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.531959  normal  0.713784 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0395  hypothetical protein  93.75 
 
 		 176 aa  350  8e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6184  hypothetical protein  89.2 
 
 		 176 aa  334  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71250  hypothetical protein  89.2 
 
 		 176 aa  334  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0496  hypothetical protein  85.23 
 
 		 176 aa  318  3e-86  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.7507  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0989  hypothetical protein  77.14 
 
 		 181 aa  290  6e-78  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4018  hypothetical protein  68.97 
 
 		 184 aa  258  4e-68  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2725  hypothetical protein  64.64 
 
 		 181 aa  247  6e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0761566  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02032  hypothetical protein  58.29 
 
 		 177 aa  210  5.999999999999999e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.198538 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4495  4-vinyl reductase, 4VR  58.29 
 
 		 177 aa  210  9e-54  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132465  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5020  4-vinyl reductase 4VR  58.29 
 
 		 177 aa  210  9e-54  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.856161 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3301  4-vinyl reductase 4VR  57.95 
 
 		 177 aa  209  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.382929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4820  4-vinyl reductase, 4VR  57.63 
 
 		 177 aa  210  1e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0573  4-vinyl reductase, 4VR  57.14 
 
 		 177 aa  207  6e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3548  4-vinyl reductase 4VR  57.71 
 
 		 177 aa  207  8e-53  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3285  4-vinyl reductase, 4VR  57.63 
 
 		 177 aa  206  1e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5083  4-vinyl reductase, 4VR  57.63 
 
 		 177 aa  206  1e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1866  V4R domain-containing protein  56 
 
 		 177 aa  206  1e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.46764  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2109  V4R domain-containing protein  57.54 
 
 		 220 aa  206  1e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5065  4-vinyl reductase 4VR  57.78 
 
 		 178 aa  206  1e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.899756  normal  0.0144061 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0708  hypothetical protein  56.18 
 
 		 177 aa  205  2e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1977  hypothetical protein  56.18 
 
 		 177 aa  205  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0742  hypothetical protein  56.18 
 
 		 177 aa  205  2e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0830  hypothetical protein  56.18 
 
 		 177 aa  205  2e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1004  hypothetical protein  56.18 
 
 		 177 aa  205  2e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0473  hypothetical protein  56.18 
 
 		 177 aa  205  2e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.712475  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5202  4-vinyl reductase 4VR  57.06 
 
 		 177 aa  205  3e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5258  V4R domain-containing protein  58.05 
 
 		 174 aa  205  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.253966  normal  0.169978 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1583  hypothetical protein  55.31 
 
 		 178 aa  204  5e-52  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00919835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4052  V4R domain-containing protein  55.35 
 
 		 200 aa  187  5.999999999999999e-47  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.194533 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0862  4-vinyl reductase 4VR  50 
 
 		 175 aa  170  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1104  4-vinyl reductase, 4VR  45.21 
 
 		 177 aa  138  3.9999999999999997e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0067  4-vinyl reductase 4VR  35.12 
 
 		 182 aa  105  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>