28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0431 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009051  Memar_0431  4-vinyl reductase, 4VR  100 
 
 		 272 aa  549  1e-155  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.958265  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1154  4-vinyl reductase, 4VR  50.2 
 
 		 267 aa  243  1.9999999999999999e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0567258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2264  transcriptional regulator, MarR family  46.12 
 
 		 259 aa  233  3e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.989074 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1553  ArsR family transcriptional regulator  38.68 
 
 		 278 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.088698  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1366  ArsR family transcriptional regulator  29.03 
 
 		 252 aa  138  7.999999999999999e-32  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00019196  hitchhiker  0.000000026398 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0656  4-vinyl reductase, 4VR  27.66 
 
 		 244 aa  125  9e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3221  ArsR family transcriptional regulator  27.24 
 
 		 245 aa  108  8.000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0279242 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0565  4-vinyl reductase 4VR  25.38 
 
 		 147 aa  66.6  0.0000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0954628  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2966  4-vinyl reductase, 4VR  30.26 
 
 		 178 aa  53.5  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0934  4-vinyl reductase, 4VR  31.16 
 
 		 176 aa  53.1  0.000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00682831 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0428  4-vinyl reductase, 4VR  28.95 
 
 		 176 aa  52.8  0.000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.458206  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0328  4-vinyl reductase, 4VR  28.57 
 
 		 177 aa  51.6  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3609  4-vinyl reductase 4VR  25.93 
 
 		 175 aa  50.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1603  4-vinyl reductase 4VR  27.34 
 
 		 173 aa  48.9  0.00009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3286  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.65 
 
 		 106 aa  47.4  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0960  4-vinyl reductase 4VR  26.25 
 
 		 197 aa  47  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0460  4-vinyl reductase 4VR  22.73 
 
 		 162 aa  47.4  0.0003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000553545  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2022  transcriptional regulator, ArsR family  29.87 
 
 		 111 aa  45.8  0.0007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0419  4-vinyl reductase 4VR  27.63 
 
 		 181 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2351  transcriptional regulator, ArsR family  31.17 
 
 		 109 aa  45.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000226954  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2395  ArsR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 109 aa  44.7  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0610  ArsR family transcriptional regulator  33.82 
 
 		 98 aa  44.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1095  4-vinyl reductase 4VR  32.35 
 
 		 241 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0425  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 127 aa  43.1  0.005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1476  transcriptional regulator, ArsR family  39.06 
 
 		 111 aa  42.7  0.007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.381385  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06338  hypothetical protein  40.32 
 
 		 113 aa  42.4  0.009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0554  regulatory protein ArsR  36.71 
 
 		 114 aa  42.4  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0432  ArsR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 111 aa  42  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.714368 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>