19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0460 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0460  4-vinyl reductase 4VR  100 
 
 		 162 aa  327  4e-89  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000553545  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0565  4-vinyl reductase 4VR  33.55 
 
 		 147 aa  84.7  5e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0954628  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1603  4-vinyl reductase 4VR  27.15 
 
 		 173 aa  73.9  0.0000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0419  4-vinyl reductase 4VR  22.7 
 
 		 181 aa  58.2  0.00000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0328  4-vinyl reductase, 4VR  22.97 
 
 		 177 aa  57.8  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0428  4-vinyl reductase, 4VR  25 
 
 		 176 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.458206  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3609  4-vinyl reductase 4VR  25.32 
 
 		 175 aa  55.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2264  transcriptional regulator, MarR family  24.27 
 
 		 259 aa  53.5  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.989074 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0755  4-vinyl reductase 4VR  20.69 
 
 		 182 aa  52.8  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2966  4-vinyl reductase, 4VR  21.43 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0934  4-vinyl reductase, 4VR  24.34 
 
 		 176 aa  52.4  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00682831 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1553  ArsR family transcriptional regulator  24.11 
 
 		 278 aa  51.6  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.088698  normal  0.342387 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1154  4-vinyl reductase, 4VR  25.95 
 
 		 267 aa  51.6  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0567258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0656  4-vinyl reductase, 4VR  24.53 
 
 		 244 aa  52  0.000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0960  4-vinyl reductase 4VR  27.35 
 
 		 197 aa  48.5  0.00004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1366  ArsR family transcriptional regulator  26.5 
 
 		 252 aa  47.4  0.00008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00019196  hitchhiker  0.000000026398 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0431  4-vinyl reductase, 4VR  22.73 
 
 		 272 aa  47.4  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.958265  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1913  4-vinyl reductase, 4VR  23.56 
 
 		 369 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.15999  normal  0.993099 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3221  ArsR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 245 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0279242 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>