174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0378 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0378  transcriptional regulator, MarR family  100 
 
 		 154 aa  290  6e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.190004  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5811  transcriptional regulator, MarR family  36.05 
 
 		 150 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.212082  normal  0.294475 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4072  MarR family transcriptional regulator  38.82 
 
 		 147 aa  77  0.00000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5018  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0874  transcriptional regulator, MarR family  38.62 
 
 		 158 aa  72.4  0.000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.211566  normal  0.0694607 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4000  MarR family transcriptional regulator  36.42 
 
 		 151 aa  72  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4463  MarR family transcriptional regulator  36.91 
 
 		 151 aa  72  0.000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0490827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2020  MarR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 150 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.412827  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1650  MarR family transcriptional regulator  38.81 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103704 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4713  MarR family transcriptional regulator  39.1 
 
 		 150 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2817  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 150 aa  69.3  0.00000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.90591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5003  MarR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 150 aa  66.6  0.0000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.263591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5432  transcriptional regulator, MarR family  32.65 
 
 		 157 aa  64.3  0.0000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.933752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0278  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 		 175 aa  63.5  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3726  MarR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 156 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0914883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3217  MarR family transcriptional regulator  33.58 
 
 		 150 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0836001  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2949  MarR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 150 aa  60.8  0.000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1589  transcriptional regulator, MarR family  34.86 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1702  MarR family transcriptional regulator  37.04 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7223  MarR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 141 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.648034  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4297  MarR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 159 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447261  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1273  MarR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 151 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.270736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0086  MarR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 143 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0606  MarR family transcriptional regulator  38.35 
 
 		 151 aa  58.2  0.00000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0747738  normal  0.0914644 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2402  transcriptional regulator, MarR family  36.73 
 
 		 150 aa  58.2  0.00000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3587  transcriptional regulator, MarR family  28.8 
 
 		 161 aa  56.6  0.0000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.84675  normal  0.423141 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1297  regulatory protein, MarR  38.3 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2282  transcriptional regulator, MarR family  35.79 
 
 		 152 aa  55.8  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000450533 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3797  MarR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.624987  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4571  MarR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.565054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5734  MarR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7164  transcriptional regulator, MarR family  30.83 
 
 		 144 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.194557  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0728  transcriptional regulator, MarR family  41.74 
 
 		 142 aa  55.1  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1004  MarR family transcriptional regulator  33.08 
 
 		 161 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4057  MarR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4309  MarR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 162 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.993253 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3208  MarR family transcriptional regulator  34.46 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.12726  normal  0.713181 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0762  MarR family transcriptional regulator  32.19 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.967077  normal  0.4484 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7239  transcriptional regulator, MarR family  34.44 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1564  transcriptional regulator, MarR family  36.11 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2307  transcriptional regulator, MarR family  29.33 
 
 		 149 aa  54.3  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.581889 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30420  transcriptional regulator  40 
 
 		 159 aa  54.3  0.0000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.147448  normal  0.274535 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4796  regulatory protein MarR  38.83 
 
 		 157 aa  53.9  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1992  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.4979  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0181  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 161 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1354  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 161 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1549  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 161 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2731  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 161 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2588  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 161 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0209  MarR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 161 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.143126  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0489  transcriptional regulator, MarR family  29.32 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2849  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 		 143 aa  53.5  0.000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2732  hypothetical protein  31.41 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6119  transcriptional regulator  38.83 
 
 		 138 aa  52.4  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.375256  normal  0.316478 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0468  MarR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 173 aa  52.4  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2068  MarR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 142 aa  52  0.000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1713  MarR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 159 aa  51.6  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33960  transcriptional regulator  29.32 
 
 		 144 aa  51.6  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.064506  normal  0.816591 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0833  transcriptional regulator, MarR family  32.35 
 
 		 151 aa  50.4  0.000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.119984  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4725  transcriptional regulator, MarR family  31.72 
 
 		 163 aa  50.1  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6078  transcriptional regulator, MarR family  39.45 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2060  MarR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 156 aa  49.7  0.00001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1031  transcriptional regulator, MarR family  33.94 
 
 		 152 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0417  MarR family transcriptional regulator  33.09 
 
 		 144 aa  48.9  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.644689 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10897  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0767  transcriptional regulator, MarR family  36.27 
 
 		 150 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3272  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0822  transcriptional regulator, MarR family  27.74 
 
 		 162 aa  48.1  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1269  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  42.19 
 
 		 338 aa  48.1  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955314 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0241  regulatory protein, MarR  30.77 
 
 		 151 aa  47.8  0.00006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.41283  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0505  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 149 aa  47.8  0.00006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.477244  hitchhiker  0.00736962 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4006  transcriptional regulator, MarR family  35 
 
 		 145 aa  47.4  0.00008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.769794  normal  0.0504485 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0411  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 		 139 aa  47  0.00009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418684  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4001  MarR family transcriptional regulator  29.5 
 
 		 149 aa  47  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34620  transcriptional regulator  33.93 
 
 		 149 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.106002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4960  MarR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 167 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0298636  normal  0.832443 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0015  transcriptional regulator, TrmB  19.44 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0473427  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3382  transcriptional regulator, MarR family  36.36 
 
 		 170 aa  47  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.180661 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2106  transcriptional regulator, MarR family  41.38 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0650489  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1249  transcriptional regulator, MarR family  35.63 
 
 		 155 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.193511  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6019  transcriptional regulator, MarR family  34.23 
 
 		 149 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.107791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1985  MarR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 154 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0411716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3119  MarR family transcriptional regulator  28.33 
 
 		 151 aa  45.4  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal  0.174429 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6009  transcriptional regulator, MarR family  31.43 
 
 		 190 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3680  transcriptional regulator, MarR family  35.35 
 
 		 170 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.359333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4315  hypothetical protein  32.74 
 
 		 171 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.285013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15420  transcriptional regulator  40.98 
 
 		 158 aa  45.4  0.0003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.481321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2156  MarR family transcriptional regulator  29.81 
 
 		 149 aa  45.1  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.309687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2545  MarR family transcriptional regulator  38.75 
 
 		 163 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00936337  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7675  transcriptional regulator, MarR family  37.31 
 
 		 157 aa  45.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3615  transcriptional regulator, MarR family  37.86 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.210335  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1979  MarR family transcriptional regulator  28 
 
 		 140 aa  44.7  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.105372  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2137  MarR family transcriptional regulator  34.34 
 
 		 158 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0755454 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5379  Transcriptional regulators-like protein  30.34 
 
 		 162 aa  44.7  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0410393  normal  0.0934088 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2352  transcriptional regulator, MarR family  31.34 
 
 		 173 aa  44.7  0.0005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1570  iron (metal) dependent repressor, DtxR family  36.45 
 
 		 229 aa  44.7  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.567097  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0330  MarR family transcriptional regulator  34.44 
 
 		 173 aa  44.3  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3376  transcriptional regulator, TrmB  30.61 
 
 		 141 aa  44.3  0.0006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000866739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3057  MarR family transcriptional regulator  34.74 
 
 		 161 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.407625 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1619  transcriptional regulator  30 
 
 		 158 aa  43.5  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00285215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>