More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_1092 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_1092  ROK family protein  100 
 
 		 391 aa  752    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0163084  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1200  ROK family protein  89.74 
 
 		 391 aa  621  1e-177  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.680343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1101  ROK family protein  57.18 
 
 		 392 aa  408  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1932  ROK family protein  55.81 
 
 		 390 aa  383  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2180  transcriptional regulator ROK family  57.95 
 
 		 392 aa  373  1e-102  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2195  transcriptional regulator ROK family  54.92 
 
 		 386 aa  368  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0660  ROK family protein  52.61 
 
 		 404 aa  348  7e-95  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546685  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7348  ROK family protein  48.19 
 
 		 393 aa  280  3e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5819  putative transcriptional regulator protein, ROK family  44.64 
 
 		 398 aa  260  3e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4952  ROK family protein  38.34 
 
 		 417 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7622  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  38.55 
 
 		 380 aa  211  2e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5531  transcriptional regulator ROK family  39.4 
 
 		 402 aa  205  1e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1939  ROK family protein  38.34 
 
 		 398 aa  170  4e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  35.7 
 
 		 420 aa  168  1e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  35.06 
 
 		 399 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  32.47 
 
 		 396 aa  158  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  31.3 
 
 		 393 aa  150  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  31.12 
 
 		 393 aa  146  5e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  32.35 
 
 		 393 aa  146  7.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0868  ROK family protein  31.12 
 
 		 400 aa  137  2e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.826865  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0880  ROK  33.93 
 
 		 403 aa  122  8e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185175  normal  0.0528281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4991  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  30.99 
 
 		 388 aa  121  1.9999999999999998e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0774439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1583  ROK protein  30.77 
 
 		 387 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  25.9 
 
 		 387 aa  117  3.9999999999999997e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  34.29 
 
 		 391 aa  116  7.999999999999999e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  30.57 
 
 		 389 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  30.43 
 
 		 396 aa  113  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0065  ROK family protein  28.95 
 
 		 373 aa  112  1.0000000000000001e-23  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.600972  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  26.12 
 
 		 391 aa  110  6e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  26.03 
 
 		 395 aa  109  8.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1925  ROK family protein  24.2 
 
 		 388 aa  108  2e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.300813  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  30.67 
 
 		 401 aa  107  3e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  31.62 
 
 		 383 aa  107  4e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  30.73 
 
 		 387 aa  106  7e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2018  ROK family protein  28.13 
 
 		 391 aa  106  7e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.812225  normal  0.981457 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  25.65 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  25.65 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  25.65 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4687  ROK family protein  30.27 
 
 		 391 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.70275 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  25.65 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7454  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  28.76 
 
 		 380 aa  105  1e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.361463 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  25.65 
 
 		 406 aa  105  1e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  25.12 
 
 		 397 aa  105  2e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  25.87 
 
 		 406 aa  104  3e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  25.65 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  25.65 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  25.65 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  25.65 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  25.65 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  25.65 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  25.65 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  25.65 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  25.65 
 
 		 406 aa  102  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0509  ROK family protein  25.41 
 
 		 363 aa  100  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0922541  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  28.24 
 
 		 399 aa  100  4e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0064  ROK family protein  26.82 
 
 		 399 aa  100  5e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.370021  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  25.87 
 
 		 406 aa  99.8  7e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  27.5 
 
 		 400 aa  99.8  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3264  ROK domain-containing protein  31.2 
 
 		 404 aa  99.4  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  28.57 
 
 		 418 aa  98.6  2e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  32.03 
 
 		 342 aa  98.6  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  29.06 
 
 		 384 aa  97.8  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  27.65 
 
 		 414 aa  97.8  3e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  30.89 
 
 		 396 aa  97.4  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  29.13 
 
 		 390 aa  97.4  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  31.5 
 
 		 403 aa  97.1  5e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  26.67 
 
 		 407 aa  96.7  6e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  23.72 
 
 		 378 aa  96.3  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  37.54 
 
 		 473 aa  96.3  8e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  27.02 
 
 		 400 aa  95.5  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  27.22 
 
 		 315 aa  95.9  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  27.22 
 
 		 315 aa  95.9  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2620  ROK family protein  33.47 
 
 		 379 aa  95.9  1e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  29.85 
 
 		 410 aa  95.1  2e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  28.74 
 
 		 417 aa  94.4  3e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  24.35 
 
 		 404 aa  94.4  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  26.12 
 
 		 428 aa  94  5e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  30.72 
 
 		 403 aa  93.6  6e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  29.56 
 
 		 395 aa  93.2  7e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  30.1 
 
 		 410 aa  91.7  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3042  ROK family protein  28.43 
 
 		 400 aa  92  2e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.274143  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  22.06 
 
 		 381 aa  91.7  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  32.95 
 
 		 401 aa  92  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  28.32 
 
 		 406 aa  90.9  3e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  31.89 
 
 		 389 aa  90.9  3e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3041  ROK family protein  25.21 
 
 		 410 aa  91.3  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0418823 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3299  ROK family protein  32.45 
 
 		 428 aa  91.3  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233562  normal  0.194548 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  28.92 
 
 		 410 aa  90.5  4e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5256  ROK family protein  33.88 
 
 		 415 aa  90.5  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.516106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  22.11 
 
 		 404 aa  90.5  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  24.36 
 
 		 396 aa  90.1  6e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  30.45 
 
 		 396 aa  90.1  6e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0961  ROK family protein  24.26 
 
 		 298 aa  89.7  7e-17  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  25.43 
 
 		 407 aa  89.7  8e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  31.29 
 
 		 389 aa  89  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04820  transcriptional regulator/sugar kinase  30.16 
 
 		 403 aa  89.4  1e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5514  transcriptional regulator ROK family  30.6 
 
 		 332 aa  89  1e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1654  ROK family protein  30.87 
 
 		 406 aa  89  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7907  ROK family protein  31.27 
 
 		 398 aa  88.6  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  29.46 
 
 		 397 aa  87.8  3e-16  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>