More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1101 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014165  Tbis_1101  ROK family protein  100 
 
 		 392 aa  763    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2180  transcriptional regulator ROK family  79.8 
 
 		 392 aa  580  1e-164  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2195  transcriptional regulator ROK family  63.17 
 
 		 386 aa  456  1e-127  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0660  ROK family protein  55.86 
 
 		 404 aa  416  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546685  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1932  ROK family protein  52.67 
 
 		 390 aa  379  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472567  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1200  ROK family protein  55.1 
 
 		 391 aa  373  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.680343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1092  ROK family protein  57.03 
 
 		 391 aa  364  2e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0163084  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7348  ROK family protein  45.92 
 
 		 393 aa  270  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5819  putative transcriptional regulator protein, ROK family  45.11 
 
 		 398 aa  263  3e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4952  ROK family protein  37.76 
 
 		 417 aa  236  6e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5531  transcriptional regulator ROK family  42.04 
 
 		 402 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7622  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  35.87 
 
 		 380 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1939  ROK family protein  40.46 
 
 		 398 aa  186  4e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  36.46 
 
 		 420 aa  186  7e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  34.19 
 
 		 396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  36.27 
 
 		 399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  31.44 
 
 		 393 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  31.44 
 
 		 393 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0868  ROK family protein  32.62 
 
 		 400 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.826865  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  30.42 
 
 		 393 aa  138  2e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0880  ROK  31.2 
 
 		 403 aa  131  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185175  normal  0.0528281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1583  ROK protein  31.89 
 
 		 387 aa  131  2.0000000000000002e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3264  ROK domain-containing protein  30.18 
 
 		 404 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  30.72 
 
 		 389 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4991  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  31.98 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0774439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  26.1 
 
 		 387 aa  119  7.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7454  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  29.28 
 
 		 380 aa  119  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.361463 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  31.67 
 
 		 387 aa  117  5e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0064  ROK family protein  29.74 
 
 		 399 aa  114  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.370021  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  32.2 
 
 		 401 aa  114  3e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4687  ROK family protein  32.8 
 
 		 391 aa  112  8.000000000000001e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.70275 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  25.21 
 
 		 399 aa  112  9e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  28.37 
 
 		 428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  27.46 
 
 		 395 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  28.11 
 
 		 414 aa  109  8.000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  26.84 
 
 		 397 aa  107  5e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  32.88 
 
 		 389 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  27.01 
 
 		 406 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1654  ROK family protein  31.39 
 
 		 406 aa  104  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2018  ROK family protein  29.08 
 
 		 391 aa  103  4e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.812225  normal  0.981457 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  26.8 
 
 		 406 aa  102  8e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1925  ROK family protein  24.62 
 
 		 388 aa  102  9e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.300813  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  28.05 
 
 		 398 aa  102  9e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0509  ROK family protein  27.67 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0922541  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  29.67 
 
 		 400 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0961  ROK family protein  27.8 
 
 		 298 aa  101  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  28.64 
 
 		 400 aa  101  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7907  ROK family protein  30.52 
 
 		 398 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  30.41 
 
 		 401 aa  100  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  26.39 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2620  ROK family protein  30.4 
 
 		 379 aa  100  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.467563  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  26.39 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  26.39 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  26.39 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  26.39 
 
 		 406 aa  100  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  26.76 
 
 		 406 aa  100  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  28.57 
 
 		 383 aa  99.8  8e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  26.1 
 
 		 406 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  26.1 
 
 		 406 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  26.1 
 
 		 406 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  26.1 
 
 		 406 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  26.1 
 
 		 406 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  32.27 
 
 		 404 aa  99.4  9e-20  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  26.1 
 
 		 406 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  26.1 
 
 		 406 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  26.1 
 
 		 406 aa  99.4  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  26.1 
 
 		 406 aa  99.4  9e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1078  ROK family protein  30.37 
 
 		 318 aa  99.4  1e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2951  ROK family protein  28.14 
 
 		 401 aa  99.4  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  29.15 
 
 		 396 aa  98.6  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3560  ROK domain-containing protein  30.54 
 
 		 374 aa  97.8  3e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5514  transcriptional regulator ROK family  31.6 
 
 		 332 aa  97.8  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  26.47 
 
 		 410 aa  97.4  4e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  29.58 
 
 		 418 aa  96.7  7e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  25.33 
 
 		 315 aa  96.3  8e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  25.33 
 
 		 315 aa  96.3  8e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  28.12 
 
 		 407 aa  95.9  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  25.37 
 
 		 407 aa  94.4  3e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  31.56 
 
 		 410 aa  94.4  3e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3120  ROK family protein  29.48 
 
 		 401 aa  93.2  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  31.29 
 
 		 342 aa  93.6  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  23.22 
 
 		 381 aa  93.2  8e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  26.91 
 
 		 407 aa  92.8  8e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  24.36 
 
 		 408 aa  92.8  9e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  23.1 
 
 		 391 aa  92.8  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  25.57 
 
 		 396 aa  92  1e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1656  ROK family transcriptional regulator  26.94 
 
 		 416 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  29.91 
 
 		 417 aa  91.7  2e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0065  ROK family protein  28.94 
 
 		 373 aa  91.7  2e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.600972  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0287  transcription regulator ROK family protein  26.94 
 
 		 416 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0198  ROK family protein  26.94 
 
 		 416 aa  92  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  30.06 
 
 		 393 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  23.77 
 
 		 402 aa  90.9  4e-17  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4684  ROK family protein  27.53 
 
 		 415 aa  90.5  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00733962  normal  0.0776986 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  25.24 
 
 		 405 aa  90.5  4e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  31.44 
 
 		 390 aa  90.9  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  32.11 
 
 		 409 aa  90.9  4e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5256  ROK family protein  31.69 
 
 		 415 aa  90.1  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.516106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1441  GntR family regulatory protein  30 
 
 		 382 aa  90.5  5e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  29.91 
 
 		 391 aa  90.1  6e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>