More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_1112 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  85.71 
 
 
407 aa  710    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  100 
 
 
407 aa  824    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  78.62 
 
 
408 aa  660    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  86.98 
 
 
407 aa  724    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  78.87 
 
 
408 aa  663    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  78.87 
 
 
408 aa  663    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  80.05 
 
 
406 aa  669    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1201  ROK family protein  85.47 
 
 
407 aa  706    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0872056  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  74.63 
 
 
406 aa  632  1e-180  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  74.63 
 
 
406 aa  632  1e-180  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  74.63 
 
 
406 aa  632  1e-180  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  74.63 
 
 
406 aa  632  1e-180  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  74.63 
 
 
406 aa  632  1e-180  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  74.63 
 
 
406 aa  632  1e-180  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  74.63 
 
 
406 aa  632  1e-180  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  74.63 
 
 
406 aa  632  1e-180  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  74.63 
 
 
406 aa  632  1e-180  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  74.88 
 
 
406 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  74.88 
 
 
406 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  74.88 
 
 
406 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  74.88 
 
 
406 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  74.88 
 
 
406 aa  630  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  75.13 
 
 
406 aa  617  1e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  61.1 
 
 
404 aa  510  1e-143  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  60.35 
 
 
404 aa  496  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  60.59 
 
 
404 aa  498  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  60.1 
 
 
404 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  44.05 
 
 
408 aa  363  3e-99  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  44.25 
 
 
416 aa  335  1e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  42.39 
 
 
405 aa  329  7e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  42.14 
 
 
434 aa  322  5e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  42.14 
 
 
405 aa  320  3e-86  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1919  ROK family protein  40.15 
 
 
407 aa  308  1.0000000000000001e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2044  ROK family protein  38.42 
 
 
405 aa  299  5e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463852  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1896  ROK family protein  38.31 
 
 
405 aa  298  8e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1658  transcriptional regulator Mic  38.9 
 
 
406 aa  296  4e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2133  ROK family protein  37.75 
 
 
405 aa  296  5e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1684  transcriptional regulator Mic  38.9 
 
 
406 aa  296  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.886112  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1599  transcriptional regulator Mic  38.9 
 
 
406 aa  296  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.510024  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1590  transcriptional regulator Mic  38.9 
 
 
406 aa  296  6e-79  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0384401 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2345  ROK family protein  37.84 
 
 
405 aa  295  8e-79  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1801  transcriptional regulator Mic  39 
 
 
406 aa  294  2e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2304  transcriptional regulator Mic  39 
 
 
406 aa  294  2e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0485397 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1606  transcriptional regulator Mic  39 
 
 
406 aa  293  3e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1851  transcriptional regulator Mic  38.65 
 
 
406 aa  293  3e-78  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1780  transcriptional regulator Mic  39 
 
 
406 aa  293  5e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01563  DNA-binding transcriptional repressor  39 
 
 
406 aa  292  7e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2049  ROK familiy protein  39 
 
 
406 aa  292  7e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.688141  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01553  hypothetical protein  39 
 
 
406 aa  292  7e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2036  ROK family protein  39 
 
 
406 aa  292  7e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1668  transcriptional regulator Mic  39 
 
 
406 aa  292  7e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1981  ROK family protein  37.84 
 
 
405 aa  288  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1869  Mlc protein  37.84 
 
 
405 aa  288  2e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472832  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2283  ROK family protein  38.81 
 
 
405 aa  286  4e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.060664 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3041  ROK family protein  30.86 
 
 
410 aa  188  2e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0418823 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  25.85 
 
 
391 aa  186  7e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  29.68 
 
 
400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  29.37 
 
 
408 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  28.47 
 
 
410 aa  177  3e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  33 
 
 
389 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  28.85 
 
 
396 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  28.53 
 
 
396 aa  172  6.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  26.97 
 
 
407 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  28.5 
 
 
383 aa  159  9e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  27.35 
 
 
388 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  29.44 
 
 
398 aa  156  7e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  29.21 
 
 
409 aa  156  7e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  29.67 
 
 
395 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  31.76 
 
 
405 aa  151  2e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  29.28 
 
 
403 aa  150  3e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  29.48 
 
 
386 aa  150  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  25.13 
 
 
385 aa  149  6e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  31.25 
 
 
396 aa  149  8e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  26.42 
 
 
399 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  29.78 
 
 
390 aa  147  3e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  29.4 
 
 
393 aa  147  4.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  29.49 
 
 
401 aa  145  2e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  30.4 
 
 
408 aa  143  5e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  27.61 
 
 
364 aa  143  6e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  25.98 
 
 
404 aa  142  8e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0316  ROK family protein  24.81 
 
 
388 aa  142  8e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  23.94 
 
 
378 aa  142  9.999999999999999e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  24.44 
 
 
428 aa  140  3e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  29.9 
 
 
397 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  26.37 
 
 
399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  29.77 
 
 
315 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  29.77 
 
 
315 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  27.19 
 
 
390 aa  138  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  29.92 
 
 
401 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  27.92 
 
 
399 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0206  NagC family transcriptional regulator  29.86 
 
 
404 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.520067  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  29.61 
 
 
402 aa  134  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  29.79 
 
 
414 aa  134  3e-30  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0837  ROK family protein  25.2 
 
 
378 aa  134  3e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  28.07 
 
 
408 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  32.08 
 
 
408 aa  133  6.999999999999999e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  29.85 
 
 
420 aa  132  7.999999999999999e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  28.71 
 
 
320 aa  130  3e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  27.39 
 
 
389 aa  130  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  26.89 
 
 
435 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>