More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2656 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



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Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  100 
 
 
418 aa  829    Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  41.5 
 
 
409 aa  280  4e-74  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  36.93 
 
 
400 aa  260  4e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  37.12 
 
 
399 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  36.02 
 
 
395 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  34.61 
 
 
397 aa  234  3e-60  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  31.57 
 
 
408 aa  228  1e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  37 
 
 
448 aa  229  1e-58  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  32.74 
 
 
396 aa  224  2e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  30.07 
 
 
410 aa  223  4.9999999999999996e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  31.62 
 
 
399 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  30.36 
 
 
391 aa  212  7.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  33.84 
 
 
396 aa  212  1e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  33.33 
 
 
398 aa  208  1e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  36.99 
 
 
417 aa  206  7e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  33.42 
 
 
414 aa  199  1.0000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  31.73 
 
 
383 aa  197  3e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3783  ROK family protein  37.65 
 
 
457 aa  197  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00347065  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  32.11 
 
 
364 aa  196  7e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  37.4 
 
 
403 aa  195  1e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  33.68 
 
 
389 aa  195  1e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  34.89 
 
 
400 aa  194  2e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  34.95 
 
 
401 aa  194  2e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  35.84 
 
 
416 aa  193  5e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  30.29 
 
 
400 aa  193  6e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  35.45 
 
 
417 aa  192  8e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  33.33 
 
 
401 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  33.5 
 
 
402 aa  190  5e-47  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  35.22 
 
 
404 aa  189  9e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  33.87 
 
 
503 aa  188  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  37.74 
 
 
401 aa  187  4e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  34.29 
 
 
392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  34.29 
 
 
418 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  35.48 
 
 
382 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  35.11 
 
 
400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  35.01 
 
 
410 aa  184  2.0000000000000003e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  33.33 
 
 
389 aa  183  4.0000000000000006e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  34.29 
 
 
397 aa  183  5.0000000000000004e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  41.04 
 
 
473 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  32.9 
 
 
427 aa  181  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  30.02 
 
 
428 aa  181  2.9999999999999997e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  35.13 
 
 
391 aa  180  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  34.58 
 
 
322 aa  180  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  33.42 
 
 
395 aa  179  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  34.01 
 
 
422 aa  179  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  26.27 
 
 
404 aa  179  9e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  32.62 
 
 
408 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1129  ROK family protein  33.92 
 
 
436 aa  178  2e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0571556 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2379  ROK family protein  34.71 
 
 
395 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  32.22 
 
 
387 aa  177  2e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  33 
 
 
408 aa  178  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0180  ROK family protein  35.91 
 
 
404 aa  177  4e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  34.98 
 
 
315 aa  176  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  33.08 
 
 
398 aa  176  6e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2271  ROK family protein  35.28 
 
 
401 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0826731 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  29.14 
 
 
404 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  31.41 
 
 
395 aa  175  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  33.68 
 
 
410 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  30.67 
 
 
393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  29.8 
 
 
399 aa  175  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  40.14 
 
 
352 aa  173  5.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  32.13 
 
 
410 aa  172  6.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  32.49 
 
 
402 aa  171  2e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  30.85 
 
 
404 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  29.24 
 
 
407 aa  171  2e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  29.69 
 
 
396 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  26.7 
 
 
404 aa  171  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  26.45 
 
 
404 aa  170  3e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  30.74 
 
 
315 aa  170  5e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  30.74 
 
 
315 aa  170  5e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  33.33 
 
 
405 aa  169  6e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28270  transcriptional regulator/sugar kinase  34.46 
 
 
434 aa  169  9e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  33.87 
 
 
313 aa  169  9e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  30.1 
 
 
389 aa  169  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  31.12 
 
 
443 aa  169  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  31.81 
 
 
395 aa  168  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  35.99 
 
 
389 aa  168  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  38.73 
 
 
315 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  27.93 
 
 
402 aa  168  2e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2670  ROK family protein  34.33 
 
 
408 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000218357  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22700  transcriptional regulator/sugar kinase  35.17 
 
 
413 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  32.29 
 
 
406 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4239  ROK family protein  33.17 
 
 
393 aa  167  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0397832  normal  0.0388456 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  30.25 
 
 
386 aa  166  5.9999999999999996e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6738  ROK family protein  35.48 
 
 
413 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.193033 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  27.66 
 
 
378 aa  166  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
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NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  33.07 
 
 
403 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.763813 
 
 
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NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  27.45 
 
 
416 aa  165  1.0000000000000001e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
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NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  33.1 
 
 
347 aa  165  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  30.03 
 
 
405 aa  164  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal 
 
 
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NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  27.49 
 
 
404 aa  164  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
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NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  31.55 
 
 
396 aa  164  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
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NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  36.31 
 
 
342 aa  164  4.0000000000000004e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
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NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  25.98 
 
 
405 aa  163  5.0000000000000005e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009380  Strop_3849  ROK family protein  33.67 
 
 
393 aa  163  5.0000000000000005e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  33.44 
 
 
321 aa  163  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
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NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  30.66 
 
 
389 aa  163  7e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  33.44 
 
 
327 aa  162  7e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  33.44 
 
 
327 aa  162  7e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  27.81 
 
 
406 aa  162  8.000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
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