More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_1939 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



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Replicon accession
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Alignment on homolog gene
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E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_1939  ROK family protein  100 
 
 		 398 aa  761    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1101  ROK family protein  40.46 
 
 		 392 aa  199  6e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2180  transcriptional regulator ROK family  40.2 
 
 		 392 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2195  transcriptional regulator ROK family  39.12 
 
 		 386 aa  179  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5819  putative transcriptional regulator protein, ROK family  38.56 
 
 		 398 aa  168  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0660  ROK family protein  35.98 
 
 		 404 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546685  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1932  ROK family protein  35.2 
 
 		 390 aa  165  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472567  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7348  ROK family protein  37.11 
 
 		 393 aa  163  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5531  transcriptional regulator ROK family  36.57 
 
 		 402 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.199786 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1200  ROK family protein  37.56 
 
 		 391 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.680343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1092  ROK family protein  38.34 
 
 		 391 aa  150  3e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0163084  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4952  ROK family protein  34.01 
 
 		 417 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7622  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  31.88 
 
 		 380 aa  122  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  32.34 
 
 		 393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  30.72 
 
 		 393 aa  111  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  35.78 
 
 		 420 aa  109  7.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  32.4 
 
 		 393 aa  103  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  26.17 
 
 		 414 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  32.34 
 
 		 396 aa  100  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  34.76 
 
 		 417 aa  97.8  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3264  ROK domain-containing protein  30.54 
 
 		 404 aa  95.9  1e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  32.72 
 
 		 399 aa  93.6  6e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0868  ROK family protein  30.86 
 
 		 400 aa  90.5  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.826865  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2379  ROK family protein  33.91 
 
 		 417 aa  90.1  5e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.257768  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  26.41 
 
 		 381 aa  88.6  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0880  ROK  28.79 
 
 		 403 aa  88.2  2e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185175  normal  0.0528281 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  30.03 
 
 		 389 aa  87  6e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2018  ROK family protein  33.47 
 
 		 391 aa  84.3  0.000000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.812225  normal  0.981457 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0149  ROK family protein  27.35 
 
 		 418 aa  79  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.421428 
 
 
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NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  29.29 
 
 		 395 aa  79  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  31.33 
 
 		 389 aa  77.8  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  33.98 
 
 		 396 aa  77.4  0.0000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
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NC_014158  Tpau_4206  ROK family protein  29.75 
 
 		 395 aa  77.4  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0181  ROK family protein  36.75 
 
 		 295 aa  77  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0065  ROK family protein  31.87 
 
 		 373 aa  77  0.0000000000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.600972  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1441  GntR family regulatory protein  33.76 
 
 		 382 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.973861  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0208  NagC family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_5256  ROK family protein  34 
 
 		 415 aa  75.5  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.516106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3560  ROK domain-containing protein  33.05 
 
 		 374 aa  75.1  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5295  ROK family protein  29.91 
 
 		 404 aa  75.1  0.000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.101654  normal  0.123744 
 
 
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NC_009049  Rsph17029_0090  ROK family protein  33.33 
 
 		 377 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  31.46 
 
 		 390 aa  74.7  0.000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  33.47 
 
 		 390 aa  73.9  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
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NC_009832  Spro_2298  ROK family protein  28.57 
 
 		 391 aa  73.9  0.000000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.193884  normal  1 
 
 
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NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  32.4 
 
 		 402 aa  73.6  0.000000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
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NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  30.81 
 
 		 401 aa  73.2  0.000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0178  ROK family protein  36.14 
 
 		 295 aa  73.2  0.000000000008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.744342  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  23.99 
 
 		 391 aa  72.8  0.000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  24 
 
 		 399 aa  72.8  0.000000000009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  28.16 
 
 		 405 aa  73.2  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
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NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  25.51 
 
 		 381 aa  72.8  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  30.25 
 
 		 410 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  27.93 
 
 		 396 aa  72.8  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  26.1 
 
 		 379 aa  72.4  0.00000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  28.79 
 
 		 398 aa  72.4  0.00000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  29.13 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
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NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  30.79 
 
 		 384 aa  72  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  29.94 
 
 		 406 aa  72  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1583  ROK protein  29.63 
 
 		 387 aa  71.2  0.00000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0064  ROK family protein  30.11 
 
 		 399 aa  70.9  0.00000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.370021  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  30.63 
 
 		 408 aa  70.9  0.00000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  35.52 
 
 		 448 aa  70.1  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  27.54 
 
 		 409 aa  69.7  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2135  ROK family protein  26.74 
 
 		 402 aa  69.7  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.335233  normal  0.0971048 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3109  ROK family protein  32.27 
 
 		 303 aa  68.9  0.0000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1520  ROK family protein  29.79 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0198401  normal  0.0199627 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1064  ROK domain-containing protein  29.79 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.561211  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1544  ROK family protein  29.79 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0384623  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  27.85 
 
 		 400 aa  68.9  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  22.66 
 
 		 401 aa  68.2  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1656  ROK family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  32.1 
 
 		 403 aa  68.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  23.14 
 
 		 410 aa  68.2  0.0000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1426  ROK family protein  29.63 
 
 		 415 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.155028  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0198  ROK family protein  28.68 
 
 		 416 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4684  ROK family protein  29.26 
 
 		 415 aa  68.2  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00733962  normal  0.0776986 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  23.1 
 
 		 408 aa  67.8  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4861  ROK family protein  33.33 
 
 		 292 aa  67.8  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  26 
 
 		 323 aa  67.8  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0417  transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  20 
 
 		 373 aa  68.2  0.0000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0384  ROK family protein  31.75 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0398  ROK family protein  31.75 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0442  ROK family protein  31.75 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0378  ROK family protein  31.36 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  29.82 
 
 		 311 aa  67.4  0.0000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  28.62 
 
 		 503 aa  67  0.0000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  27.27 
 
 		 405 aa  67.4  0.0000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  31.33 
 
 		 392 aa  67  0.0000000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00660  transcriptional regulator/sugar kinase  32.08 
 
 		 385 aa  67  0.0000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.182982 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3373  ROK family protein  27.66 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.553535  n/a   
 
 
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NC_013172  Bfae_31650  transcriptional regulator/sugar kinase  34.32 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_6967  ROK family protein  28.25 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.553424  normal  1 
 
 
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NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  29.25 
 
 		 391 aa  66.2  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
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NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  28.33 
 
 		 400 aa  66.2  0.0000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal  1 
 
 
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NC_005957  BT9727_0375  ROK family protein; glucokinase  31.05 
 
 		 292 aa  65.9  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_007520  Tcr_0885  ROK  26.19 
 
 		 301 aa  65.9  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  32.4 
 
 		 418 aa  65.5  0.000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
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NC_010551  BamMC406_1466  ROK family protein  29.06 
 
 		 415 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.473934  normal  1 
 
 
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NC_011988  Avi_5514  transcriptional regulator ROK family  33.48 
 
 		 332 aa  66.2  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  25.21 
 
 		 399 aa  65.9  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
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