More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_31650 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_31650  transcriptional regulator/sugar kinase  100 
 
 
374 aa  715    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7454  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  34.83 
 
 
380 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.361463 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1583  ROK protein  37.65 
 
 
387 aa  159  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4991  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  34.62 
 
 
388 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0774439  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4687  ROK family protein  35.39 
 
 
391 aa  153  5e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.70275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7907  ROK family protein  32.77 
 
 
398 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1654  ROK family protein  39.82 
 
 
406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01870  transcriptional regulator/sugar kinase  35.21 
 
 
393 aa  135  9.999999999999999e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  29.69 
 
 
402 aa  120  3e-26  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  32.05 
 
 
392 aa  119  9.999999999999999e-26  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  33.33 
 
 
401 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  31.62 
 
 
389 aa  114  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  33.68 
 
 
396 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  31.22 
 
 
395 aa  109  6e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0868  ROK family protein  30.03 
 
 
400 aa  109  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.826865  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  31.18 
 
 
393 aa  107  3e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  30.23 
 
 
406 aa  107  4e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  31.32 
 
 
410 aa  106  5e-22  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  29.95 
 
 
399 aa  106  8e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  29.19 
 
 
398 aa  105  1e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  30.52 
 
 
422 aa  104  3e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  30.13 
 
 
403 aa  104  3e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  33.92 
 
 
420 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  32.46 
 
 
418 aa  103  4e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  28.64 
 
 
393 aa  102  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  30.48 
 
 
401 aa  101  2e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1585  transcriptional regulator/sugar kinase  28.57 
 
 
289 aa  99.4  1e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  31.25 
 
 
404 aa  97.4  3e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  29.64 
 
 
390 aa  96.7  5e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5256  ROK family protein  32.78 
 
 
415 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.516106  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  29.44 
 
 
402 aa  96.7  6e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  28.93 
 
 
503 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  33.53 
 
 
397 aa  94.7  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7348  ROK family protein  32.58 
 
 
393 aa  94.4  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  27.68 
 
 
396 aa  94.4  3e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  26.98 
 
 
393 aa  94  4e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2018  ROK family protein  31.03 
 
 
391 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.812225  normal  0.981457 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  30.4 
 
 
389 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  26.59 
 
 
435 aa  90.9  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  31.65 
 
 
387 aa  90.5  4e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4053  ROK family protein  27.65 
 
 
405 aa  90.5  5e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  30.98 
 
 
420 aa  90.1  5e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3063  ROK family protein  32.21 
 
 
392 aa  89.7  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.272039 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  29.41 
 
 
418 aa  89.4  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  30.77 
 
 
395 aa  89  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  25.97 
 
 
395 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  25.82 
 
 
315 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  25.82 
 
 
315 aa  88.2  2e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3042  ROK family protein  30.09 
 
 
400 aa  88.2  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.274143  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  28.73 
 
 
395 aa  88.2  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  23.68 
 
 
397 aa  88.2  2e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  30.77 
 
 
395 aa  88.2  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1672  ROK family protein  29.14 
 
 
429 aa  87.8  3e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0559193  normal  0.988218 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4775  ROK family protein  33.21 
 
 
321 aa  87.4  3e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0706  putative glucokinase  22.33 
 
 
311 aa  86.7  7e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.660435  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  26.58 
 
 
393 aa  85.9  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0880  ROK  30.25 
 
 
403 aa  85.1  0.000000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185175  normal  0.0528281 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  30.48 
 
 
429 aa  85.1  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  26.9 
 
 
405 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  29.81 
 
 
410 aa  84.7  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0176  ROK family protein  29.39 
 
 
379 aa  84.3  0.000000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  25.21 
 
 
397 aa  84.3  0.000000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3041  ROK family protein  24.13 
 
 
410 aa  84  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0418823 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  24.7 
 
 
398 aa  83.6  0.000000000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  27.22 
 
 
416 aa  82.8  0.000000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5819  putative transcriptional regulator protein, ROK family  30.48 
 
 
398 aa  82.4  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.87328 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  30.42 
 
 
400 aa  82.4  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  26.19 
 
 
409 aa  82  0.00000000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  25.17 
 
 
313 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  28.57 
 
 
396 aa  81.3  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4333  ROK family protein  32.14 
 
 
326 aa  81.6  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380756  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3061  transcriptional regulator, ROK family  31.79 
 
 
407 aa  81.6  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  0.372783 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1048  ROK family protein  22.02 
 
 
283 aa  81.6  0.00000000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  25.68 
 
 
414 aa  80.9  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7622  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  28.17 
 
 
380 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1406  ROK family protein  26.81 
 
 
282 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2047  ROK family protein  25.26 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  23.35 
 
 
400 aa  80.1  0.00000000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1741  ROK family protein  31.19 
 
 
392 aa  80.1  0.00000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00402921  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  27.85 
 
 
322 aa  79.7  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  31.75 
 
 
342 aa  79.7  0.00000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3264  ROK domain-containing protein  29.06 
 
 
404 aa  79  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2334  ROK family protein  24.65 
 
 
297 aa  79.3  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  27.5 
 
 
405 aa  79.3  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1397  ROK family protein  26.81 
 
 
280 aa  79  0.0000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.969879  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0384  ROK family protein  23.02 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0375  ROK family protein; glucokinase  23.43 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0398  ROK family protein  23.02 
 
 
292 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  25.79 
 
 
389 aa  78.2  0.0000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  22.04 
 
 
381 aa  78.6  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1433  ROK family protein  26.45 
 
 
280 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  29.92 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1680  transcriptional regulator  25.63 
 
 
300 aa  78.2  0.0000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  31.3 
 
 
408 aa  78.6  0.0000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2948  ROK family protein  26.81 
 
 
280 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.319818  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1044  ROK family protein  32.38 
 
 
383 aa  77.8  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.339449  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0174  ROK family protein  27.87 
 
 
406 aa  77.4  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1181  ROK family protein  24.54 
 
 
336 aa  77.8  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011773  BCAH820_0442  ROK family protein  23.4 
 
 
292 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
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NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  22.05 
 
 
396 aa  77.4  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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