More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_2517 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  100 
 
 
418 aa  802    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  71.72 
 
 
393 aa  535  1e-151  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  69.23 
 
 
401 aa  495  1e-139  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  65.08 
 
 
420 aa  478  1e-134  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  46.42 
 
 
402 aa  348  1e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  50.52 
 
 
401 aa  345  7e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  47.04 
 
 
389 aa  343  2e-93  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  45.89 
 
 
389 aa  289  8e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  43.56 
 
 
404 aa  268  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  41.21 
 
 
396 aa  248  1e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  42.93 
 
 
387 aa  245  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  40.67 
 
 
400 aa  238  1e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  38.8 
 
 
396 aa  236  8e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  38.79 
 
 
396 aa  226  7e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  39.53 
 
 
429 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  39.95 
 
 
397 aa  216  5.9999999999999996e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  37.4 
 
 
395 aa  206  6e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  35.34 
 
 
422 aa  206  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0256  ROK family protein  39.23 
 
 
393 aa  205  2e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  36.24 
 
 
391 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  40.05 
 
 
410 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  33.69 
 
 
409 aa  191  2e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  36.14 
 
 
402 aa  189  5.999999999999999e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  28.87 
 
 
397 aa  183  6e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  34.29 
 
 
418 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  35.03 
 
 
408 aa  177  2e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  36.81 
 
 
392 aa  178  2e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  36.54 
 
 
395 aa  177  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  29.9 
 
 
395 aa  172  9e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  35.18 
 
 
395 aa  170  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  34.51 
 
 
503 aa  167  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  32.45 
 
 
443 aa  164  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  32.88 
 
 
389 aa  163  5.0000000000000005e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28270  transcriptional regulator/sugar kinase  36 
 
 
434 aa  162  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3063  ROK family protein  35.36 
 
 
392 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.272039 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  31.28 
 
 
406 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2885  ROK family protein  33.25 
 
 
409 aa  160  5e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  34.44 
 
 
393 aa  159  9e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  29.49 
 
 
406 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  29.49 
 
 
406 aa  158  1e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  29.49 
 
 
406 aa  158  1e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  29.49 
 
 
406 aa  158  1e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  29.49 
 
 
406 aa  158  1e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  29.49 
 
 
406 aa  158  1e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  29.49 
 
 
406 aa  158  1e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  29.49 
 
 
406 aa  158  1e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  29.49 
 
 
406 aa  158  1e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  30.73 
 
 
398 aa  157  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  30.85 
 
 
406 aa  158  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  31.2 
 
 
372 aa  156  6e-37  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  25.31 
 
 
408 aa  156  6e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  33.15 
 
 
389 aa  156  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  26.14 
 
 
399 aa  156  8e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1896  ROK family protein  28.38 
 
 
405 aa  156  8e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  33.99 
 
 
410 aa  155  9e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  32.29 
 
 
406 aa  155  9e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  35.41 
 
 
403 aa  155  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  25 
 
 
410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  29.23 
 
 
406 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  29.23 
 
 
406 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  29.23 
 
 
406 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  29.23 
 
 
406 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  29.23 
 
 
406 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  34.36 
 
 
390 aa  152  1e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  27.37 
 
 
402 aa  151  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  36.6 
 
 
389 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  27.06 
 
 
404 aa  150  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  25.5 
 
 
364 aa  149  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  32.48 
 
 
315 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  32.48 
 
 
315 aa  149  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  28.1 
 
 
414 aa  149  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  31.71 
 
 
386 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  30.99 
 
 
410 aa  147  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0176  ROK family protein  32.37 
 
 
379 aa  147  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1919  ROK family protein  27.6 
 
 
407 aa  146  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2283  ROK family protein  29.81 
 
 
405 aa  146  6e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.060664 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  30.26 
 
 
408 aa  146  7.0000000000000006e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  26.55 
 
 
404 aa  146  7.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  25.45 
 
 
400 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  30.27 
 
 
427 aa  146  8.000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2044  ROK family protein  28.05 
 
 
405 aa  145  9e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463852  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  30.26 
 
 
408 aa  145  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  26.72 
 
 
434 aa  145  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  30.26 
 
 
408 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  26.91 
 
 
405 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  26.55 
 
 
404 aa  144  3e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1590  transcriptional regulator Mic  27.32 
 
 
406 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0384401 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  30.45 
 
 
397 aa  143  5e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1599  transcriptional regulator Mic  27.32 
 
 
406 aa  143  5e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.510024  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2133  ROK family protein  26.79 
 
 
405 aa  143  7e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  31.94 
 
 
395 aa  142  8e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1658  transcriptional regulator Mic  27.05 
 
 
406 aa  142  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2345  ROK family protein  29.1 
 
 
405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  26.46 
 
 
405 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  27.25 
 
 
405 aa  140  3e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1851  transcriptional regulator Mic  27.05 
 
 
406 aa  140  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  25.64 
 
 
391 aa  139  7e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  29.77 
 
 
315 aa  139  7e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  30 
 
 
420 aa  139  7e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1684  transcriptional regulator Mic  27.05 
 
 
406 aa  139  7e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.886112  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>