More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_3042 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008541  Arth_3042  ROK family protein  100 
 
 
400 aa  783    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.274143  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3299  ROK family protein  41.78 
 
 
428 aa  208  1e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.233562  normal  0.194548 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3599  ROK family protein  38.42 
 
 
402 aa  207  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24610  transcriptional regulator/sugar kinase  36.93 
 
 
394 aa  189  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.205431  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1583  ROK protein  34.11 
 
 
387 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.821608  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7454  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  32.45 
 
 
380 aa  155  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.361463 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4687  ROK family protein  33.51 
 
 
391 aa  153  5.9999999999999996e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.70275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1183  ROK family protein  34.66 
 
 
399 aa  143  4e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.159445  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4991  Transcriptional regulator/sugar kinase-like protein  32.74 
 
 
388 aa  142  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0774439  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01870  transcriptional regulator/sugar kinase  32.63 
 
 
393 aa  133  6e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  28.43 
 
 
393 aa  131  3e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  31.37 
 
 
420 aa  127  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  27.27 
 
 
393 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1654  ROK family protein  32.38 
 
 
406 aa  119  7e-26  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.295037  normal  0.201792 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0868  ROK family protein  28.53 
 
 
400 aa  119  9.999999999999999e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.826865  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7907  ROK family protein  28.99 
 
 
398 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7348  ROK family protein  28.79 
 
 
393 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0868629 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0660  ROK family protein  33.78 
 
 
404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.546685  normal  0.645841 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1932  ROK family protein  32.59 
 
 
390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.472567  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5412  transcriptional regulator ROK family  26.36 
 
 
396 aa  111  2.0000000000000002e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.125738  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1200  ROK family protein  31.21 
 
 
391 aa  111  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.680343  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  24.74 
 
 
381 aa  108  1e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  31.4 
 
 
403 aa  106  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  28.37 
 
 
389 aa  105  9e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2180  transcriptional regulator ROK family  30.3 
 
 
392 aa  105  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  28.11 
 
 
422 aa  105  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1101  ROK family protein  29.18 
 
 
392 aa  104  3e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.150829 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1507  ROK domain-containing protein  27.81 
 
 
393 aa  103  4e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31650  transcriptional regulator/sugar kinase  29.8 
 
 
374 aa  103  6e-21  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  28.5 
 
 
387 aa  102  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  26.29 
 
 
414 aa  102  1e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  24.94 
 
 
383 aa  101  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  28.53 
 
 
429 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  27.9 
 
 
322 aa  101  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  23.66 
 
 
387 aa  100  4e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  24.54 
 
 
381 aa  100  5e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  26.9 
 
 
418 aa  99.4  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  25.38 
 
 
389 aa  98.2  2e-19  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  30.39 
 
 
401 aa  98.6  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2445  ROK family protein  27.17 
 
 
417 aa  98.2  2e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  28.99 
 
 
390 aa  98.2  2e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  28.07 
 
 
395 aa  98.2  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  28.96 
 
 
404 aa  97.4  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  24.68 
 
 
397 aa  97.1  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  27.01 
 
 
401 aa  96.7  6e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  35.86 
 
 
314 aa  96.3  9e-19  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  35.86 
 
 
314 aa  96.3  9e-19  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  27.64 
 
 
389 aa  95.9  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0880  ROK  28.42 
 
 
403 aa  95.9  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.185175  normal  0.0528281 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  27.85 
 
 
386 aa  95.5  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  23.59 
 
 
406 aa  95.5  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  25.81 
 
 
395 aa  95.5  1e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3264  ROK domain-containing protein  28.12 
 
 
404 aa  95.1  2e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.228362 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  21.78 
 
 
391 aa  94.7  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1092  ROK family protein  27.84 
 
 
391 aa  94.4  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0163084  normal  0.226847 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  29.35 
 
 
397 aa  94  5e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2195  transcriptional regulator ROK family  31.41 
 
 
386 aa  93.6  6e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  28.37 
 
 
401 aa  93.2  7e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  30.23 
 
 
400 aa  93.2  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  23.43 
 
 
410 aa  92.4  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  28.97 
 
 
317 aa  92.8  1e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  23.73 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  23.73 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  28.61 
 
 
448 aa  92  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  23.73 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  23.73 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  23.73 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  29.3 
 
 
318 aa  91.7  2e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  23.73 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  28.02 
 
 
403 aa  92  2e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  23.73 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  23.73 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  23.73 
 
 
406 aa  91.7  2e-17  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  27.4 
 
 
327 aa  91.3  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  27.82 
 
 
327 aa  90.9  3e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  23.06 
 
 
406 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  27.05 
 
 
327 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  27.05 
 
 
327 aa  90.5  4e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  23.06 
 
 
406 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  23.06 
 
 
406 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  23.06 
 
 
406 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  23.06 
 
 
406 aa  90.9  4e-17  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  27.05 
 
 
327 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  27.05 
 
 
327 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  27.05 
 
 
327 aa  90.1  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  27.05 
 
 
327 aa  90.1  6e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  27.05 
 
 
327 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  27.05 
 
 
327 aa  90.1  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  28.87 
 
 
315 aa  90.1  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  28.87 
 
 
315 aa  90.1  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  27.05 
 
 
327 aa  90.1  6e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  25.5 
 
 
435 aa  90.1  7e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  26.49 
 
 
409 aa  89.7  7e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  26.82 
 
 
402 aa  89.7  9e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  29.79 
 
 
408 aa  89.4  9e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  30.03 
 
 
321 aa  89  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5256  ROK family protein  30.59 
 
 
415 aa  89  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.516106  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  28.17 
 
 
313 aa  89  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  27.53 
 
 
395 aa  88.2  2e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  26.4 
 
 
428 aa  88.6  2e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>