More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_3295 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  100 
 
 
428 aa  866    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1865  ROK family protein  35.38 
 
 
399 aa  226  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.579561 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  33.42 
 
 
435 aa  226  5.0000000000000005e-58  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2951  ROK family protein  36.73 
 
 
401 aa  225  9e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  36.73 
 
 
414 aa  218  1e-55  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  34.95 
 
 
425 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  34.41 
 
 
425 aa  212  1e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1684  ROK family protein  34.62 
 
 
391 aa  210  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.805279  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2620  ROK family protein  35.22 
 
 
425 aa  208  2e-52  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  28.82 
 
 
408 aa  202  9.999999999999999e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3115  ROK domain-containing protein  35.08 
 
 
442 aa  191  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.603125  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  30 
 
 
399 aa  191  1e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  33.16 
 
 
390 aa  186  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  31.85 
 
 
395 aa  186  7e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  30.08 
 
 
396 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  36.48 
 
 
404 aa  181  2e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  32.23 
 
 
425 aa  176  9e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  30.85 
 
 
398 aa  172  6.999999999999999e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  28.78 
 
 
405 aa  168  1e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  34.2 
 
 
402 aa  167  4e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  28.78 
 
 
434 aa  166  8e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  30.02 
 
 
418 aa  166  9e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  29.03 
 
 
409 aa  164  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  29.65 
 
 
383 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  26.63 
 
 
391 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  30.85 
 
 
399 aa  162  8.000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  28.32 
 
 
400 aa  162  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  31.41 
 
 
405 aa  162  1e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  31.11 
 
 
397 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  27.43 
 
 
396 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  31.95 
 
 
422 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  31.33 
 
 
410 aa  159  6e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  29.92 
 
 
410 aa  158  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  31.65 
 
 
386 aa  157  3e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  31.66 
 
 
404 aa  157  3e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  25.62 
 
 
410 aa  156  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  29.4 
 
 
402 aa  154  4e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  32.44 
 
 
414 aa  154  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  28.04 
 
 
405 aa  153  5e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  30.42 
 
 
378 aa  149  7e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  30.02 
 
 
400 aa  149  9e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  27.25 
 
 
404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  27.25 
 
 
404 aa  148  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  26.07 
 
 
406 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  26.07 
 
 
406 aa  147  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  26.07 
 
 
406 aa  147  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  26.07 
 
 
406 aa  147  3e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  26.07 
 
 
406 aa  147  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  26.07 
 
 
406 aa  147  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  26.07 
 
 
406 aa  147  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  26.07 
 
 
406 aa  147  3e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  26.07 
 
 
406 aa  147  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  28.21 
 
 
390 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  26.07 
 
 
406 aa  147  5e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  31.06 
 
 
406 aa  146  6e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  32.85 
 
 
315 aa  146  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  30.27 
 
 
417 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  29.32 
 
 
429 aa  145  1e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  31.49 
 
 
387 aa  145  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  28.64 
 
 
397 aa  143  5e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7220  ROK family protein  29.08 
 
 
402 aa  143  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.501197  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1201  ROK family protein  25.27 
 
 
407 aa  142  9.999999999999999e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0872056  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  26.77 
 
 
404 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1919  ROK family protein  24.94 
 
 
407 aa  142  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  24.81 
 
 
406 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  24.81 
 
 
406 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  31.05 
 
 
401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  24.81 
 
 
406 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  29.65 
 
 
448 aa  141  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  24.81 
 
 
406 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2283  ROK family protein  25.06 
 
 
405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.060664 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2345  ROK family protein  25.19 
 
 
405 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  24.81 
 
 
406 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  24.19 
 
 
407 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5104  ROK family protein  29.34 
 
 
404 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.288839  normal  0.92903 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  32.02 
 
 
390 aa  141  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  24.44 
 
 
407 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  29.82 
 
 
398 aa  140  3.9999999999999997e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  28.65 
 
 
401 aa  140  4.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  30.18 
 
 
417 aa  140  4.999999999999999e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  29.8 
 
 
395 aa  140  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  29.69 
 
 
320 aa  139  7.999999999999999e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
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NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  24.73 
 
 
407 aa  139  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  24.6 
 
 
404 aa  139  1e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6967  ROK family protein  30.95 
 
 
401 aa  139  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.553424  normal 
 
 
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NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  29.33 
 
 
396 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  29.93 
 
 
395 aa  138  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  24.88 
 
 
404 aa  138  2e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
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NC_011080  SNSL254_A1599  transcriptional regulator Mic  24.5 
 
 
406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.510024  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  25.45 
 
 
408 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
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NC_011083  SeHA_C1658  transcriptional regulator Mic  24.5 
 
 
406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011094  SeSA_A1590  transcriptional regulator Mic  24.5 
 
 
406 aa  137  3.0000000000000003e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0384401 
 
 
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NC_012917  PC1_2044  ROK family protein  24.07 
 
 
405 aa  137  4e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463852  n/a   
 
 
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NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  24.87 
 
 
406 aa  137  4e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
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NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  30 
 
 
389 aa  137  5e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011205  SeD_A1851  transcriptional regulator Mic  24.63 
 
 
406 aa  137  5e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_011149  SeAg_B1684  transcriptional regulator Mic  24.63 
 
 
406 aa  136  8e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.886112  n/a   
 
 
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NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  25.41 
 
 
408 aa  136  8e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
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NC_013093  Amir_1677  ROK family protein  29.41 
 
 
435 aa  136  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_014158  Tpau_4206  ROK family protein  29.52 
 
 
395 aa  135  9.999999999999999e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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