More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2629 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  100 
 
 		 409 aa  820    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  42.93 
 
 		 395 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  43.43 
 
 		 400 aa  296  4e-79  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  41.27 
 
 		 397 aa  289  6e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  40.38 
 
 		 364 aa  279  8e-74  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  41.5 
 
 		 418 aa  261  2e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  38.23 
 
 		 399 aa  260  3e-68  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  38.1 
 
 		 399 aa  239  5.999999999999999e-62  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  32.98 
 
 		 391 aa  238  2e-61  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  34.1 
 
 		 396 aa  229  6e-59  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  31.9 
 
 		 408 aa  222  7e-57  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  35.45 
 
 		 381 aa  217  2.9999999999999998e-55  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  32.55 
 
 		 383 aa  200  3e-50  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  34 
 
 		 397 aa  197  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  29.04 
 
 		 410 aa  196  5.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  30.95 
 
 		 396 aa  196  8.000000000000001e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  33.76 
 
 		 414 aa  195  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  31.03 
 
 		 396 aa  193  5e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  36.04 
 
 		 402 aa  191  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  29.67 
 
 		 399 aa  190  4e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  32.82 
 
 		 448 aa  189  5e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  33.07 
 
 		 398 aa  189  9e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  29.64 
 
 		 385 aa  188  1e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  33.59 
 
 		 417 aa  186  5e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  33.61 
 
 		 392 aa  186  5e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  34.13 
 
 		 404 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  32.91 
 
 		 401 aa  184  3e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  31.75 
 
 		 401 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  33.59 
 
 		 402 aa  179  9e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  33.69 
 
 		 408 aa  176  6e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  25.99 
 
 		 390 aa  176  8e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  31.04 
 
 		 402 aa  176  9.999999999999999e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  30.05 
 
 		 398 aa  174  2.9999999999999996e-42  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  29.29 
 
 		 400 aa  172  6.999999999999999e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  36.47 
 
 		 403 aa  172  1e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  34.19 
 
 		 322 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  33.24 
 
 		 395 aa  171  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  33.69 
 
 		 418 aa  171  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3783  ROK family protein  33.57 
 
 		 457 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00347065  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  31.71 
 
 		 389 aa  171  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  37.84 
 
 		 401 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0837  ROK family protein  30.95 
 
 		 378 aa  170  4e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  33.62 
 
 		 410 aa  169  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  30.79 
 
 		 406 aa  168  2e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  31.98 
 
 		 410 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  31.59 
 
 		 420 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  32.98 
 
 		 389 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  31.59 
 
 		 395 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  30.5 
 
 		 397 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  33.51 
 
 		 381 aa  166  5e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  30.48 
 
 		 397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0225  ROK family protein  31.01 
 
 		 398 aa  165  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.10258  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  31.35 
 
 		 410 aa  164  3e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  29.03 
 
 		 428 aa  164  3e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1271  ROK family protein  35.31 
 
 		 361 aa  163  5.0000000000000005e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0499308  normal  0.418273 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  30.42 
 
 		 393 aa  163  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  30.87 
 
 		 406 aa  163  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 405 aa  163  7e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  26.82 
 
 		 378 aa  162  8.000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  31.17 
 
 		 389 aa  162  9e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  31.38 
 
 		 443 aa  162  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  32.43 
 
 		 408 aa  162  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  29.02 
 
 		 408 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  31.63 
 
 		 425 aa  161  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  29.02 
 
 		 408 aa  161  2e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  29.02 
 
 		 408 aa  161  2e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  27.94 
 
 		 434 aa  161  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  31.22 
 
 		 429 aa  160  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  30.11 
 
 		 395 aa  159  6e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  31.61 
 
 		 503 aa  159  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4114  ROK family protein  28.08 
 
 		 406 aa  159  8e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  31.73 
 
 		 400 aa  159  8e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  30.95 
 
 		 416 aa  159  9e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  29.02 
 
 		 395 aa  159  9e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  29.65 
 
 		 389 aa  159  9e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  33.98 
 
 		 328 aa  159  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  32.39 
 
 		 382 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  30.26 
 
 		 406 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  30.26 
 
 		 406 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  32.74 
 
 		 400 aa  158  2e-37  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  30.26 
 
 		 406 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  28.79 
 
 		 405 aa  158  2e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  29.95 
 
 		 387 aa  158  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  30.26 
 
 		 406 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  30.26 
 
 		 406 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  31.5 
 
 		 405 aa  158  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  30.53 
 
 		 407 aa  158  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  28.42 
 
 		 404 aa  157  3e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  27.76 
 
 		 407 aa  157  3e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  31.75 
 
 		 406 aa  157  4e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  24.94 
 
 		 408 aa  157  4e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  30.39 
 
 		 427 aa  156  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  34.17 
 
 		 352 aa  156  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  29.47 
 
 		 406 aa  156  6e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  29.47 
 
 		 406 aa  156  6e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  29.47 
 
 		 406 aa  156  6e-37  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  29.47 
 
 		 406 aa  156  6e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  29.47 
 
 		 406 aa  156  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  29.47 
 
 		 406 aa  156  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  29.47 
 
 		 406 aa  156  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>