More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5222 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  100 
 
 
429 aa  818    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  50.37 
 
 
422 aa  356  5e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  46.27 
 
 
397 aa  294  2e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  43.26 
 
 
387 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  42.13 
 
 
404 aa  251  2e-65  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  41.12 
 
 
401 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  39.84 
 
 
400 aa  230  4e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  39.39 
 
 
420 aa  212  7.999999999999999e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  39.05 
 
 
393 aa  211  2e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  38.29 
 
 
389 aa  209  6e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  36.5 
 
 
402 aa  209  1e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  39.69 
 
 
418 aa  205  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  37.31 
 
 
401 aa  203  5e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  35.51 
 
 
395 aa  202  9e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  37.88 
 
 
396 aa  202  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  37.37 
 
 
396 aa  199  7.999999999999999e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  34.58 
 
 
391 aa  194  2e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  34.88 
 
 
389 aa  182  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  36.22 
 
 
395 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  35.55 
 
 
395 aa  179  7e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  33.66 
 
 
402 aa  179  7e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  28.75 
 
 
410 aa  177  4e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  35.4 
 
 
410 aa  176  6e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  34.35 
 
 
396 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  34.52 
 
 
406 aa  174  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  36.58 
 
 
408 aa  171  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  34.18 
 
 
392 aa  167  2e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  32.42 
 
 
395 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  32.81 
 
 
414 aa  163  4.0000000000000004e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0256  ROK family protein  32.97 
 
 
393 aa  162  1e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  29.82 
 
 
389 aa  162  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  33.16 
 
 
503 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  33.99 
 
 
403 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  26.67 
 
 
402 aa  159  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  33.54 
 
 
347 aa  157  4e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  28.82 
 
 
383 aa  155  1e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6292  ROK family protein  34.32 
 
 
372 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360789  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  28.75 
 
 
391 aa  155  2e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  31.74 
 
 
396 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10150  transcriptional regulator/sugar kinase  34.73 
 
 
429 aa  149  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.484549  normal  0.536351 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5336  ROK family protein  34.41 
 
 
392 aa  149  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  28.72 
 
 
395 aa  147  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  30.31 
 
 
386 aa  147  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4206  ROK family protein  33.42 
 
 
395 aa  146  6e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  33.33 
 
 
322 aa  145  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  31.39 
 
 
418 aa  145  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  32.69 
 
 
397 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  34.04 
 
 
390 aa  144  4e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  26.6 
 
 
399 aa  142  8e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  31.83 
 
 
320 aa  142  9e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  31.08 
 
 
409 aa  142  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  27.76 
 
 
397 aa  141  3e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  32.84 
 
 
395 aa  141  3e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  26.93 
 
 
399 aa  140  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  25.9 
 
 
408 aa  141  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  29.8 
 
 
427 aa  140  3.9999999999999997e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  30.47 
 
 
399 aa  140  3.9999999999999997e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  32.38 
 
 
400 aa  140  4.999999999999999e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  32.76 
 
 
410 aa  140  4.999999999999999e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  30.49 
 
 
410 aa  139  7e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  31.86 
 
 
443 aa  139  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  32.38 
 
 
327 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  32.71 
 
 
384 aa  139  7.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3063  ROK family protein  33.33 
 
 
392 aa  139  7.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.272039 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  26.28 
 
 
405 aa  139  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  32.06 
 
 
327 aa  139  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  32.06 
 
 
327 aa  139  1e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  32.38 
 
 
327 aa  139  1e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  32.06 
 
 
327 aa  138  2e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  27.41 
 
 
407 aa  138  2e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  32.06 
 
 
327 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  32.06 
 
 
327 aa  138  2e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  32.06 
 
 
327 aa  138  2e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  32.06 
 
 
327 aa  138  2e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  32.06 
 
 
327 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  32.06 
 
 
327 aa  138  2e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  31.58 
 
 
405 aa  138  2e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  36.7 
 
 
306 aa  137  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  28.07 
 
 
405 aa  137  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  32.19 
 
 
417 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  27.61 
 
 
401 aa  136  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4888  ROK family protein  34.02 
 
 
392 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  27.5 
 
 
405 aa  135  9.999999999999999e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_009953  Sare_4777  ROK family protein  29.5 
 
 
381 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
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NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  33.17 
 
 
390 aa  135  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
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NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  27.23 
 
 
405 aa  134  3.9999999999999996e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  28.53 
 
 
404 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal 
 
 
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NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  31.77 
 
 
321 aa  132  9e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
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NC_009380  Strop_4335  ROK family protein  29.24 
 
 
381 aa  132  9e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306469  normal  0.0512746 
 
 
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NC_004311  BRA1189  ROK family protein  31.56 
 
 
374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
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NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  31.72 
 
 
315 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
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NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  27.86 
 
 
420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal 
 
 
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NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  26.84 
 
 
434 aa  132  1.0000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  31.99 
 
 
328 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
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NC_013510  Tcur_1741  ROK family protein  33.76 
 
 
392 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00402921  n/a   
 
 
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NC_013131  Caci_6967  ROK family protein  31.41 
 
 
401 aa  132  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.553424  normal 
 
 
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NC_014210  Ndas_4053  ROK family protein  30.23 
 
 
405 aa  131  3e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  27.71 
 
 
428 aa  130  4.0000000000000003e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  34.18 
 
 
317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
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NC_013595  Sros_3061  transcriptional regulator, ROK family  32.59 
 
 
407 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  0.372783 
 
 
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