More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_10490 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  100 
 
 		 395 aa  762    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  76.04 
 
 		 392 aa  558  1e-158  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  64.12 
 
 		 406 aa  464  1e-129  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  63.06 
 
 		 410 aa  456  1e-127  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  64.34 
 
 		 403 aa  457  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  65 
 
 		 503 aa  457  1e-127  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4053  ROK family protein  62.37 
 
 		 405 aa  434  1e-120  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  57.56 
 
 		 395 aa  412  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  54.76 
 
 		 402 aa  400  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  48.53 
 
 		 390 aa  316  6e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5336  ROK family protein  49.48 
 
 		 392 aa  301  2e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  44.33 
 
 		 389 aa  299  5e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  43.42 
 
 		 395 aa  288  2e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  45.22 
 
 		 443 aa  285  1.0000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  45.6 
 
 		 427 aa  282  7.000000000000001e-75  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  42.78 
 
 		 405 aa  271  2e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  44.3 
 
 		 420 aa  270  2.9999999999999997e-71  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6292  ROK family protein  45.95 
 
 		 372 aa  257  2e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360789  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2885  ROK family protein  43.19 
 
 		 409 aa  250  4e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4206  ROK family protein  40.74 
 
 		 395 aa  249  7e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1741  ROK family protein  43.44 
 
 		 392 aa  240  2e-62  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00402921  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  42.9 
 
 		 393 aa  235  9e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  37.2 
 
 		 389 aa  227  3e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  43.52 
 
 		 389 aa  224  2e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4888  ROK family protein  39.58 
 
 		 392 aa  221  1.9999999999999999e-56  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0665  ROK family protein  37.93 
 
 		 392 aa  215  9.999999999999999e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  36.22 
 
 		 372 aa  214  2.9999999999999995e-54  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4777  ROK family protein  37.64 
 
 		 381 aa  207  2e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4335  ROK family protein  37.25 
 
 		 381 aa  207  3e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306469  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  35.7 
 
 		 384 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1841  ROK family protein  37.53 
 
 		 394 aa  196  6e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  39.01 
 
 		 404 aa  196  7e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  36.39 
 
 		 408 aa  191  2e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0174  ROK family protein  37.83 
 
 		 406 aa  187  3e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  36.73 
 
 		 401 aa  184  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  36.77 
 
 		 387 aa  182  8.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  37.81 
 
 		 401 aa  182  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  35.09 
 
 		 422 aa  179  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  36.34 
 
 		 393 aa  174  1.9999999999999998e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  31.34 
 
 		 414 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  34.64 
 
 		 400 aa  172  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  34.05 
 
 		 397 aa  172  1e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  29.79 
 
 		 395 aa  171  3e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  36.54 
 
 		 418 aa  166  8e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1672  ROK family protein  35.7 
 
 		 429 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0559193  normal  0.988218 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  33.9 
 
 		 402 aa  165  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1908  ROK family protein  32.38 
 
 		 391 aa  164  4.0000000000000004e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.477922  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  32.33 
 
 		 429 aa  162  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  35.41 
 
 		 420 aa  161  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  31.83 
 
 		 315 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  31.83 
 
 		 315 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  31.41 
 
 		 418 aa  160  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  28.18 
 
 		 391 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  32.89 
 
 		 391 aa  160  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  29.02 
 
 		 409 aa  159  8e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  26.16 
 
 		 402 aa  158  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  30.98 
 
 		 396 aa  156  7e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  27.78 
 
 		 410 aa  154  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  26.53 
 
 		 405 aa  153  5e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  28.72 
 
 		 399 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  31.58 
 
 		 396 aa  152  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  26.63 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  32.98 
 
 		 389 aa  149  6e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  25.66 
 
 		 408 aa  149  7e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  26.06 
 
 		 408 aa  146  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  30.35 
 
 		 315 aa  146  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  27.18 
 
 		 401 aa  145  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0256  ROK family protein  32.2 
 
 		 393 aa  143  5e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  27.11 
 
 		 396 aa  143  5e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  28.83 
 
 		 404 aa  143  6e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  33.42 
 
 		 396 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  27.08 
 
 		 397 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  25.94 
 
 		 400 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  27.95 
 
 		 396 aa  140  3e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  25.07 
 
 		 383 aa  140  6e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  28.06 
 
 		 404 aa  140  6e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  31.86 
 
 		 393 aa  139  7.999999999999999e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  32.19 
 
 		 410 aa  139  8.999999999999999e-32  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1304  ROK family protein  31.58 
 
 		 393 aa  137  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.445462  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  26.44 
 
 		 399 aa  138  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  28.57 
 
 		 404 aa  137  5e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  27.37 
 
 		 405 aa  136  8e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  28.89 
 
 		 399 aa  135  9.999999999999999e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  32.27 
 
 		 395 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  32.64 
 
 		 374 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4996  ROK family protein  33.24 
 
 		 420 aa  135  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.165382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  27.39 
 
 		 406 aa  134  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  26.05 
 
 		 407 aa  134  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3061  transcriptional regulator, ROK family  31.53 
 
 		 407 aa  133  6.999999999999999e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.756873  normal  0.372783 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  30.45 
 
 		 321 aa  132  7.999999999999999e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  27.66 
 
 		 406 aa  132  9e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  27.66 
 
 		 406 aa  132  9e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  27.66 
 
 		 406 aa  132  9e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  27.66 
 
 		 406 aa  132  9e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  27.66 
 
 		 406 aa  132  9e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  27.66 
 
 		 406 aa  132  9e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  27.66 
 
 		 406 aa  132  9e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  27.66 
 
 		 406 aa  132  9e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  27.66 
 
 		 406 aa  132  9e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  26.74 
 
 		 417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>