More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_0159 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  100 
 
 
400 aa  796    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  46.12 
 
 
395 aa  357  1.9999999999999998e-97  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  47.46 
 
 
399 aa  347  2e-94  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  43.43 
 
 
409 aa  342  8e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  50.26 
 
 
397 aa  341  1e-92  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  36.93 
 
 
418 aa  281  2e-74  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  39.13 
 
 
408 aa  265  1e-69  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  41.27 
 
 
364 aa  252  1e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  35.31 
 
 
399 aa  247  3e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  37.03 
 
 
396 aa  243  3.9999999999999997e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  31.79 
 
 
399 aa  228  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  34.08 
 
 
414 aa  227  3e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  33.93 
 
 
391 aa  223  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  32.24 
 
 
410 aa  218  1e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  32.99 
 
 
396 aa  215  9.999999999999999e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  35.84 
 
 
396 aa  207  3e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  33.5 
 
 
400 aa  205  9e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  34.96 
 
 
383 aa  204  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2381  ROK family protein  29.35 
 
 
398 aa  200  3.9999999999999996e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  31.19 
 
 
503 aa  199  5e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  33.08 
 
 
443 aa  197  3e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  30.65 
 
 
404 aa  196  5.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  29.12 
 
 
408 aa  193  6e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  28.83 
 
 
398 aa  192  9e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  29.97 
 
 
448 aa  192  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  28.88 
 
 
410 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  29.19 
 
 
401 aa  191  2e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  31.36 
 
 
405 aa  188  1e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  34.41 
 
 
402 aa  187  3e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  30.71 
 
 
408 aa  187  4e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  30.02 
 
 
428 aa  187  4e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  33.87 
 
 
315 aa  186  7e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  33.87 
 
 
315 aa  186  7e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  30.1 
 
 
395 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24360  transcriptional regulator/sugar kinase  28.53 
 
 
389 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.20601  normal  0.121694 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  30.81 
 
 
400 aa  184  3e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  29.85 
 
 
417 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  27.42 
 
 
404 aa  182  7e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  30.28 
 
 
402 aa  182  9.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  28.68 
 
 
390 aa  182  9.000000000000001e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  27.27 
 
 
406 aa  182  1e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  28.57 
 
 
402 aa  181  2e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  26.57 
 
 
387 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  28.98 
 
 
404 aa  180  4e-44  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  24.55 
 
 
401 aa  180  4e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  28.91 
 
 
414 aa  179  4.999999999999999e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0149  ROK family protein  37.36 
 
 
473 aa  179  9e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0514897 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  28.24 
 
 
414 aa  178  1e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  29.82 
 
 
434 aa  177  2e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  29.37 
 
 
417 aa  177  3e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  28.2 
 
 
404 aa  176  4e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0837  ROK family protein  32.41 
 
 
378 aa  176  7e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  25.72 
 
 
395 aa  176  9e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  32.47 
 
 
405 aa  174  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4114  ROK family protein  30.03 
 
 
406 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  25.77 
 
 
392 aa  174  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  31.86 
 
 
315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  27.42 
 
 
404 aa  173  5e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  29.97 
 
 
378 aa  173  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  29.29 
 
 
405 aa  172  6.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  27.6 
 
 
427 aa  172  9e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  35.14 
 
 
342 aa  171  1e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  28.97 
 
 
425 aa  172  1e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3783  ROK family protein  28.81 
 
 
457 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00347065  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  30.13 
 
 
381 aa  172  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  33.44 
 
 
322 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  32.76 
 
 
390 aa  171  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1215  ROK family protein  28.61 
 
 
393 aa  171  2e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  25.65 
 
 
393 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  32.38 
 
 
408 aa  171  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  29.01 
 
 
397 aa  170  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  31.16 
 
 
352 aa  169  6e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  27.2 
 
 
407 aa  169  6e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  25.45 
 
 
422 aa  169  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  27.78 
 
 
389 aa  169  9e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1432  ROK family protein  35.9 
 
 
381 aa  169  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00411657  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  28.12 
 
 
389 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  27.79 
 
 
397 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22700  transcriptional regulator/sugar kinase  29.9 
 
 
413 aa  168  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  29.95 
 
 
391 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  28.79 
 
 
416 aa  167  2.9999999999999998e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1129  ROK family protein  29.21 
 
 
436 aa  167  2.9999999999999998e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0571556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  27.82 
 
 
395 aa  166  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  28.92 
 
 
403 aa  166  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  29.24 
 
 
406 aa  166  5.9999999999999996e-40  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  28.54 
 
 
420 aa  166  9e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3041  ROK family protein  25.2 
 
 
410 aa  166  9e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0418823 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  29.24 
 
 
406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  29.24 
 
 
406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  29.24 
 
 
406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  29.24 
 
 
406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  31.12 
 
 
347 aa  165  1.0000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  28.46 
 
 
408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  28.76 
 
 
405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  25.45 
 
 
418 aa  165  1.0000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  29.24 
 
 
406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  26.65 
 
 
405 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  29.24 
 
 
406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  29.24 
 
 
406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  29.24 
 
 
406 aa  165  1.0000000000000001e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>