More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_14840 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  100 
 
 
443 aa  870    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  60.24 
 
 
427 aa  493  9.999999999999999e-139  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  58.82 
 
 
420 aa  444  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  46.02 
 
 
402 aa  332  1e-89  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  47.83 
 
 
503 aa  310  5e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  46.67 
 
 
390 aa  309  5e-83  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  45.88 
 
 
410 aa  303  3.0000000000000004e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  45.22 
 
 
395 aa  300  4e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  44.64 
 
 
395 aa  298  1e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  43.56 
 
 
406 aa  297  2e-79  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2885  ROK family protein  47.55 
 
 
409 aa  296  4e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  43.88 
 
 
389 aa  290  4e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4782  ROK family protein  38.21 
 
 
455 aa  290  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.203146  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  48.45 
 
 
389 aa  286  5.999999999999999e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  48.81 
 
 
393 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  42.78 
 
 
392 aa  280  4e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  41.65 
 
 
389 aa  276  7e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4053  ROK family protein  42.71 
 
 
405 aa  269  7e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  43.65 
 
 
395 aa  266  5.999999999999999e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  41.07 
 
 
372 aa  256  4e-67  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  40.41 
 
 
403 aa  251  1e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5336  ROK family protein  43.94 
 
 
392 aa  251  2e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6292  ROK family protein  42.15 
 
 
372 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360789  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4888  ROK family protein  39.54 
 
 
392 aa  223  4e-57  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  38.98 
 
 
408 aa  220  5e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4206  ROK family protein  38.27 
 
 
395 aa  218  2e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4335  ROK family protein  38.48 
 
 
381 aa  218  2e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306469  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1741  ROK family protein  42.96 
 
 
392 aa  216  8e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00402921  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1841  ROK family protein  37.5 
 
 
394 aa  211  2e-53  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4777  ROK family protein  38.22 
 
 
381 aa  211  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  36.38 
 
 
405 aa  209  5e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0665  ROK family protein  38.14 
 
 
392 aa  207  4e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  34.72 
 
 
401 aa  193  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  30.42 
 
 
414 aa  193  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  29.54 
 
 
402 aa  193  6e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  36.96 
 
 
404 aa  190  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  36.27 
 
 
389 aa  188  2e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  31.77 
 
 
402 aa  187  3e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  31.12 
 
 
396 aa  187  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  32.93 
 
 
395 aa  187  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  30.83 
 
 
401 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  33.93 
 
 
384 aa  182  1e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  33.25 
 
 
401 aa  182  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  30.23 
 
 
396 aa  180  4e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  34.85 
 
 
400 aa  180  4.999999999999999e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  29.05 
 
 
410 aa  179  8e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  31.13 
 
 
315 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  32.84 
 
 
422 aa  175  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  33.16 
 
 
393 aa  174  3.9999999999999995e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  33.08 
 
 
400 aa  173  5.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  30.41 
 
 
315 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  30.41 
 
 
315 aa  172  1e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  31.38 
 
 
409 aa  172  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  27.59 
 
 
408 aa  171  2e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_49  transcriptional regulator/sugar kinase  35.76 
 
 
334 aa  169  8e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0340377  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0049  ROK family protein  35.33 
 
 
336 aa  168  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  32.8 
 
 
321 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  31.51 
 
 
321 aa  168  2e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  32.42 
 
 
414 aa  165  1.0000000000000001e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  26.09 
 
 
408 aa  166  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  35.09 
 
 
387 aa  165  2.0000000000000002e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  32.45 
 
 
418 aa  164  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  29.31 
 
 
420 aa  163  6e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  36.78 
 
 
342 aa  163  6e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0046  glucokinase  34.07 
 
 
335 aa  163  7e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00210983  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  30.43 
 
 
327 aa  162  9e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  31.12 
 
 
418 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  33.55 
 
 
321 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  29.66 
 
 
327 aa  160  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  29.66 
 
 
327 aa  160  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  31.03 
 
 
399 aa  160  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  31.03 
 
 
320 aa  160  6e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  26.98 
 
 
405 aa  159  8e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  31.72 
 
 
318 aa  159  8e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  29.66 
 
 
327 aa  159  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  29.66 
 
 
327 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  29.66 
 
 
327 aa  159  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  29.66 
 
 
327 aa  159  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  29.66 
 
 
327 aa  159  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  29.66 
 
 
327 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  29.66 
 
 
327 aa  159  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  27.79 
 
 
389 aa  157  3e-37  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  29.36 
 
 
327 aa  156  7e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  30.15 
 
 
313 aa  154  2e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  29.59 
 
 
397 aa  154  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  32.61 
 
 
347 aa  153  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  32.38 
 
 
318 aa  152  8e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  29.4 
 
 
425 aa  152  1e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  27.34 
 
 
391 aa  151  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  33.86 
 
 
318 aa  150  3e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  31.17 
 
 
396 aa  151  3e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  28.75 
 
 
317 aa  150  3e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  30.4 
 
 
396 aa  150  4e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  33.07 
 
 
397 aa  150  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  32.4 
 
 
408 aa  150  6e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  32.39 
 
 
395 aa  149  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  32.08 
 
 
315 aa  149  8e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  34.47 
 
 
352 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  32.64 
 
 
405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  27.37 
 
 
383 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>