More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_4888 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_4888  ROK family protein  100 
 
 		 392 aa  765    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1841  ROK family protein  77.24 
 
 		 394 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4206  ROK family protein  62.44 
 
 		 395 aa  435  1e-121  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0665  ROK family protein  53.49 
 
 		 392 aa  344  1e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  46.13 
 
 		 395 aa  301  1e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  42.27 
 
 		 402 aa  293  5e-78  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  45.09 
 
 		 389 aa  290  3e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  38.6 
 
 		 410 aa  253  5.000000000000001e-66  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  41.54 
 
 		 503 aa  247  3e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  39.48 
 
 		 395 aa  241  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  37.34 
 
 		 406 aa  240  2.9999999999999997e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4053  ROK family protein  40 
 
 		 405 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  39.58 
 
 		 395 aa  239  5e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1741  ROK family protein  45.59 
 
 		 392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00402921  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  39.54 
 
 		 443 aa  231  2e-59  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  40.42 
 
 		 392 aa  231  2e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  38.68 
 
 		 390 aa  224  1e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  38.23 
 
 		 427 aa  218  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  35.95 
 
 		 420 aa  216  5e-55  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  37.17 
 
 		 384 aa  209  8e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  36.58 
 
 		 403 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5336  ROK family protein  38.1 
 
 		 392 aa  195  9e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3798  ROK family protein  34.99 
 
 		 405 aa  186  5e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  29.22 
 
 		 408 aa  185  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  35.79 
 
 		 401 aa  173  3.9999999999999995e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  31.56 
 
 		 389 aa  171  2e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  36.01 
 
 		 400 aa  168  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  36.94 
 
 		 397 aa  165  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6292  ROK family protein  34.58 
 
 		 372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360789  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  36.56 
 
 		 404 aa  163  5.0000000000000005e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  29.87 
 
 		 383 aa  162  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4335  ROK family protein  31.85 
 
 		 381 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306469  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  30.67 
 
 		 395 aa  158  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  34.05 
 
 		 389 aa  154  4e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4782  ROK family protein  29.29 
 
 		 455 aa  153  5.9999999999999996e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.203146  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1672  ROK family protein  32.73 
 
 		 429 aa  152  1e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0559193  normal  0.988218 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4777  ROK family protein  30.93 
 
 		 381 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  32.35 
 
 		 408 aa  150  4e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2885  ROK family protein  32.73 
 
 		 409 aa  149  7e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  34.52 
 
 		 429 aa  149  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  31.65 
 
 		 409 aa  149  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  28.54 
 
 		 410 aa  148  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  32.88 
 
 		 402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  31.95 
 
 		 389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  31.78 
 
 		 401 aa  147  3e-34  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  30.71 
 
 		 372 aa  147  3e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  34.65 
 
 		 387 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  33.96 
 
 		 393 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  28.12 
 
 		 414 aa  145  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  28.38 
 
 		 391 aa  145  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  26.28 
 
 		 402 aa  143  7e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  33.7 
 
 		 393 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  34.3 
 
 		 410 aa  142  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  33.59 
 
 		 422 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  28.12 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  30.73 
 
 		 396 aa  140  3e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  31.85 
 
 		 418 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  31.48 
 
 		 396 aa  140  3.9999999999999997e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  28.92 
 
 		 425 aa  139  7e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2781  ROK family protein  30.91 
 
 		 391 aa  139  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000000764975  hitchhiker  0.000282521 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4114  ROK family protein  26.04 
 
 		 406 aa  136  6.0000000000000005e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  34.26 
 
 		 418 aa  135  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  29.36 
 
 		 404 aa  135  1.9999999999999998e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  31.15 
 
 		 397 aa  134  1.9999999999999998e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  26.63 
 
 		 396 aa  134  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  25.91 
 
 		 388 aa  133  5e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  29.44 
 
 		 404 aa  133  6e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  31.75 
 
 		 417 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  30.34 
 
 		 396 aa  132  9e-30  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  29.73 
 
 		 395 aa  132  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  33.05 
 
 		 420 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  28.39 
 
 		 397 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  27.59 
 
 		 405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  29.12 
 
 		 428 aa  131  2.0000000000000002e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  27.59 
 
 		 434 aa  131  2.0000000000000002e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  33.02 
 
 		 402 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  25.56 
 
 		 408 aa  130  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  31.25 
 
 		 386 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  30.03 
 
 		 395 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2133  ROK family protein  28.46 
 
 		 417 aa  129  8.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000789832 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3063  ROK family protein  33.69 
 
 		 392 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272039 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  31.92 
 
 		 315 aa  128  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1908  ROK family protein  29.5 
 
 		 391 aa  128  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.477922  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  29.68 
 
 		 315 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  26.02 
 
 		 400 aa  127  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  26.65 
 
 		 385 aa  127  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  32.58 
 
 		 327 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  32.58 
 
 		 327 aa  127  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  27.83 
 
 		 387 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  27.47 
 
 		 405 aa  126  8.000000000000001e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  32.26 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  32.26 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  32.26 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  32.26 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  32.26 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  32.26 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  32.27 
 
 		 328 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1126  ROK family protein  31.18 
 
 		 371 aa  125  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  32.26 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  26.12 
 
 		 416 aa  124  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>