More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_2298 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  100 
 
 
389 aa  724    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2885  ROK family protein  60.68 
 
 
409 aa  427  1e-118  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  60.87 
 
 
393 aa  400  9.999999999999999e-111  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  45.24 
 
 
427 aa  298  2e-79  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  46.67 
 
 
389 aa  290  2e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  48.45 
 
 
443 aa  288  9e-77  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  46.48 
 
 
420 aa  278  1e-73  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  47.3 
 
 
390 aa  253  5.000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  42.58 
 
 
372 aa  250  3e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  43.04 
 
 
402 aa  239  5e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  44.27 
 
 
395 aa  239  6.999999999999999e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  44.27 
 
 
410 aa  238  1e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  44.09 
 
 
503 aa  236  7e-61  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  42.6 
 
 
406 aa  233  6e-60  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  44.94 
 
 
392 aa  229  8e-59  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  41.6 
 
 
395 aa  217  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5336  ROK family protein  42.16 
 
 
392 aa  205  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.955979 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4053  ROK family protein  40.66 
 
 
405 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1350  ROK family protein  42.11 
 
 
403 aa  196  7e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.763813 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  32.41 
 
 
414 aa  190  4e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  37.53 
 
 
408 aa  186  4e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  30.87 
 
 
396 aa  186  5e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  38.32 
 
 
389 aa  186  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  28.94 
 
 
396 aa  184  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  37.72 
 
 
395 aa  183  5.0000000000000004e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  37.89 
 
 
401 aa  183  5.0000000000000004e-45  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4777  ROK family protein  38.62 
 
 
381 aa  171  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  25.98 
 
 
391 aa  170  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  36.5 
 
 
387 aa  167  4e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  27.2 
 
 
402 aa  166  6.9999999999999995e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6292  ROK family protein  37.4 
 
 
372 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.360789  normal  0.0986994 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  35.69 
 
 
321 aa  165  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4782  ROK family protein  30.99 
 
 
455 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.203146  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  34.11 
 
 
321 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  33.33 
 
 
315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  33.33 
 
 
315 aa  163  4.0000000000000004e-39  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  34.65 
 
 
401 aa  162  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  35.22 
 
 
418 aa  161  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  34.38 
 
 
393 aa  161  2e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  34.04 
 
 
384 aa  160  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  26.79 
 
 
408 aa  160  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  32.59 
 
 
347 aa  160  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  28.17 
 
 
401 aa  159  6e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  33.33 
 
 
327 aa  159  8e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  33.33 
 
 
327 aa  159  8e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  33.33 
 
 
327 aa  159  9e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  33.33 
 
 
327 aa  159  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  33.33 
 
 
327 aa  159  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  33.33 
 
 
327 aa  159  9e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  33.33 
 
 
327 aa  159  9e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  33.33 
 
 
327 aa  159  9e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  31.94 
 
 
315 aa  159  9e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  33.44 
 
 
327 aa  159  9e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  33.33 
 
 
327 aa  159  9e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  33.93 
 
 
389 aa  158  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1672  ROK family protein  33.68 
 
 
429 aa  158  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0559193  normal  0.988218 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  33.66 
 
 
322 aa  157  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  33.02 
 
 
327 aa  157  4e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4335  ROK family protein  37.11 
 
 
381 aa  156  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306469  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  36.39 
 
 
404 aa  155  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  34.43 
 
 
321 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  35.9 
 
 
418 aa  155  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  32.48 
 
 
315 aa  154  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_49  transcriptional regulator/sugar kinase  34.73 
 
 
334 aa  155  2e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0340377  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  32.82 
 
 
409 aa  154  2.9999999999999998e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  29.53 
 
 
395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  32.59 
 
 
318 aa  154  4e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  34.91 
 
 
422 aa  152  8e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0049  ROK family protein  34.29 
 
 
336 aa  152  1e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  24.81 
 
 
399 aa  152  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  27.88 
 
 
410 aa  151  2e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0259  transcriptional regulator  36.66 
 
 
336 aa  151  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0046  glucokinase  33.76 
 
 
335 aa  151  2e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00210983  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  32.26 
 
 
332 aa  151  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  28.38 
 
 
408 aa  150  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  28.38 
 
 
408 aa  149  7e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  28.38 
 
 
408 aa  149  7e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  27.13 
 
 
404 aa  149  8e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  38.84 
 
 
352 aa  149  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  32.48 
 
 
323 aa  149  1.0000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  32.99 
 
 
400 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  30.55 
 
 
402 aa  149  1.0000000000000001e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  28.87 
 
 
406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  28.87 
 
 
406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  28.87 
 
 
406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  29.84 
 
 
407 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  28.53 
 
 
389 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  28.87 
 
 
406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  28.87 
 
 
406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  28.87 
 
 
406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  37.3 
 
 
318 aa  148  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  28.87 
 
 
406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  28.87 
 
 
406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  28.87 
 
 
406 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  28.68 
 
 
406 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  26.27 
 
 
404 aa  147  4.0000000000000006e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  28.68 
 
 
406 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  28.68 
 
 
406 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  28.68 
 
 
406 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  28.68 
 
 
406 aa  147  4.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>