More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2995 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  100 
 
 		 408 aa  814    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2994  ROK family protein  64.2 
 
 		 405 aa  543  1e-153  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.496258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  61.7 
 
 		 401 aa  509  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  52.33 
 
 		 402 aa  451  1e-125  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  34.49 
 
 		 407 aa  225  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3041  ROK family protein  30.37 
 
 		 410 aa  200  5e-50  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0418823 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  29.84 
 
 		 404 aa  178  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  31.53 
 
 		 396 aa  176  8e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  29.9 
 
 		 405 aa  173  5.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  29.32 
 
 		 410 aa  171  1e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  29.9 
 
 		 434 aa  171  2e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  28.03 
 
 		 397 aa  167  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  29.5 
 
 		 404 aa  164  3e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  25.91 
 
 		 422 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  28.72 
 
 		 383 aa  160  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  30.5 
 
 		 420 aa  160  5e-38  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  26.61 
 
 		 392 aa  158  1e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  28.53 
 
 		 396 aa  159  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  27.59 
 
 		 443 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  27.39 
 
 		 410 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  28.21 
 
 		 404 aa  157  4e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  25.84 
 
 		 389 aa  156  6e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  29.4 
 
 		 408 aa  156  7e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  29.83 
 
 		 405 aa  154  2e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  24.32 
 
 		 401 aa  154  2.9999999999999998e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  28.23 
 
 		 503 aa  152  8.999999999999999e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  29 
 
 		 396 aa  152  1e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  27.08 
 
 		 391 aa  152  1e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  27 
 
 		 404 aa  151  2e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  26.33 
 
 		 400 aa  150  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  27.66 
 
 		 402 aa  150  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  26.75 
 
 		 404 aa  149  7e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  29.32 
 
 		 399 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  26.12 
 
 		 406 aa  147  3e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  29.78 
 
 		 327 aa  147  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  25.39 
 
 		 396 aa  146  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  29.08 
 
 		 406 aa  146  6e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  26.06 
 
 		 395 aa  146  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  26.84 
 
 		 396 aa  145  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  29.03 
 
 		 407 aa  144  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  29.78 
 
 		 408 aa  144  2e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  29.78 
 
 		 408 aa  144  2e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  25.59 
 
 		 402 aa  144  3e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  24.87 
 
 		 401 aa  144  3e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  29.78 
 
 		 408 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  25.14 
 
 		 427 aa  144  3e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  29.09 
 
 		 416 aa  142  9e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  30.48 
 
 		 323 aa  142  9e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  29.69 
 
 		 327 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  29.69 
 
 		 327 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  29.69 
 
 		 327 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  29.69 
 
 		 327 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  29.69 
 
 		 327 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  29.69 
 
 		 327 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4335  ROK family protein  25.65 
 
 		 381 aa  142  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.306469  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  29.69 
 
 		 327 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1658  transcriptional regulator Mic  24.53 
 
 		 406 aa  141  1.9999999999999998e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  29.97 
 
 		 320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  28.76 
 
 		 407 aa  141  1.9999999999999998e-32  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  25.65 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1590  transcriptional regulator Mic  24.53 
 
 		 406 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0384401 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  26.91 
 
 		 408 aa  141  3e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  29.69 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1599  transcriptional regulator Mic  24.53 
 
 		 406 aa  141  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.510024  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  29.69 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  29.18 
 
 		 406 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2283  ROK family protein  25.41 
 
 		 405 aa  140  3e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.060664 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  28.85 
 
 		 317 aa  140  3e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2885  ROK family protein  29.47 
 
 		 409 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  23.83 
 
 		 414 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1919  ROK family protein  23.45 
 
 		 407 aa  139  7e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  29.38 
 
 		 327 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  28.14 
 
 		 406 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  28.14 
 
 		 406 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  28.14 
 
 		 406 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  28.14 
 
 		 406 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  28.14 
 
 		 406 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  28.14 
 
 		 406 aa  139  8.999999999999999e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  28.14 
 
 		 406 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  28.14 
 
 		 406 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  28.14 
 
 		 406 aa  139  8.999999999999999e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  28.18 
 
 		 406 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  25 
 
 		 393 aa  139  1e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  28.18 
 
 		 406 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  28.18 
 
 		 406 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  28.18 
 
 		 406 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  28.18 
 
 		 406 aa  139  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1851  transcriptional regulator Mic  24.26 
 
 		 406 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  30.03 
 
 		 321 aa  138  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  24.27 
 
 		 420 aa  138  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  32.38 
 
 		 400 aa  138  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  27.37 
 
 		 400 aa  138  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1896  ROK family protein  25.14 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  28.53 
 
 		 395 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  25.45 
 
 		 428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1684  transcriptional regulator Mic  24.26 
 
 		 406 aa  137  4e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.886112  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1201  ROK family protein  28.76 
 
 		 407 aa  137  5e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0872056  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  25.71 
 
 		 429 aa  137  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4777  ROK family protein  24.87 
 
 		 381 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000235996 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2304  transcriptional regulator Mic  23.99 
 
 		 406 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0485397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>