More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_01334 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  76.49 
 
 
404 aa  642    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  95.54 
 
 
404 aa  791    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  83.17 
 
 
404 aa  687    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  100 
 
 
404 aa  822    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  60.6 
 
 
406 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  60.6 
 
 
406 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  60.6 
 
 
406 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  62.59 
 
 
407 aa  502  1e-141  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  60.6 
 
 
406 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  60.6 
 
 
406 aa  503  1e-141  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  61.6 
 
 
406 aa  504  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  60.35 
 
 
406 aa  498  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  60.35 
 
 
406 aa  498  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  60.35 
 
 
406 aa  498  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  60.35 
 
 
406 aa  498  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  60.35 
 
 
406 aa  498  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  60.35 
 
 
406 aa  498  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  60.35 
 
 
406 aa  498  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  60.35 
 
 
406 aa  498  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  60.35 
 
 
406 aa  498  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  60.5 
 
 
407 aa  496  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1201  ROK family protein  62.09 
 
 
407 aa  495  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0872056  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  60.1 
 
 
407 aa  493  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  61.25 
 
 
408 aa  491  9.999999999999999e-139  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  61.25 
 
 
408 aa  491  9.999999999999999e-139  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  61 
 
 
408 aa  488  1e-137  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  60.67 
 
 
406 aa  486  1e-136  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  45.79 
 
 
405 aa  366  1e-100  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  45.3 
 
 
434 aa  362  5.0000000000000005e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  45.3 
 
 
405 aa  359  6e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  44.19 
 
 
408 aa  347  3e-94  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  42.82 
 
 
416 aa  333  2e-90  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1896  ROK family protein  36.88 
 
 
405 aa  305  9.000000000000001e-82  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2133  ROK family protein  36.91 
 
 
405 aa  299  5e-80  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1919  ROK family protein  37.41 
 
 
407 aa  298  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1780  transcriptional regulator Mic  36.91 
 
 
406 aa  294  1e-78  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2304  transcriptional regulator Mic  36.66 
 
 
406 aa  293  3e-78  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.0485397 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1606  transcriptional regulator Mic  36.66 
 
 
406 aa  293  3e-78  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1801  transcriptional regulator Mic  36.66 
 
 
406 aa  293  3e-78  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01563  DNA-binding transcriptional repressor  36.66 
 
 
406 aa  293  5e-78  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2049  ROK familiy protein  36.66 
 
 
406 aa  293  5e-78  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.688141  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2036  ROK family protein  36.66 
 
 
406 aa  293  5e-78  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01553  hypothetical protein  36.66 
 
 
406 aa  293  5e-78  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1668  transcriptional regulator Mic  36.66 
 
 
406 aa  293  5e-78  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2345  ROK family protein  36.39 
 
 
405 aa  290  4e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2283  ROK family protein  36.91 
 
 
405 aa  289  6e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.060664 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2044  ROK family protein  35.87 
 
 
405 aa  289  8e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463852  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1658  transcriptional regulator Mic  36.66 
 
 
406 aa  289  8e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1684  transcriptional regulator Mic  36.66 
 
 
406 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.886112  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1590  transcriptional regulator Mic  36.66 
 
 
406 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0384401 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1599  transcriptional regulator Mic  36.66 
 
 
406 aa  288  1e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.510024  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1851  transcriptional regulator Mic  36.66 
 
 
406 aa  288  2e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1981  ROK family protein  36.63 
 
 
405 aa  285  7e-76  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1869  Mlc protein  36.63 
 
 
405 aa  285  7e-76  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472832  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  28.07 
 
 
399 aa  187  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  32.88 
 
 
396 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  29.17 
 
 
408 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  29.07 
 
 
410 aa  179  8e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  28.38 
 
 
383 aa  176  8e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  29.59 
 
 
395 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  25.69 
 
 
400 aa  172  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  29.68 
 
 
396 aa  170  5e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  25.27 
 
 
391 aa  169  8e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3041  ROK family protein  27.08 
 
 
410 aa  168  2e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0418823 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  27.2 
 
 
407 aa  165  1.0000000000000001e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  30.2 
 
 
401 aa  164  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  28.86 
 
 
397 aa  161  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  29.67 
 
 
390 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  26.61 
 
 
388 aa  159  9e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  29.43 
 
 
386 aa  158  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  27.39 
 
 
393 aa  158  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  28.46 
 
 
420 aa  158  2e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  28.68 
 
 
399 aa  157  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  26.68 
 
 
385 aa  155  1e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  26.45 
 
 
418 aa  154  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  28.29 
 
 
398 aa  154  2.9999999999999998e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  27.3 
 
 
389 aa  152  7e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  27 
 
 
408 aa  151  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  27.63 
 
 
409 aa  151  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  30.23 
 
 
408 aa  151  2e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  31.19 
 
 
315 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  31.19 
 
 
315 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  29.72 
 
 
402 aa  149  8e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  27.03 
 
 
402 aa  149  8e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  27.25 
 
 
428 aa  148  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  29.23 
 
 
402 aa  147  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  27.34 
 
 
396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  29 
 
 
401 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  26.1 
 
 
404 aa  145  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  28.29 
 
 
405 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  26.54 
 
 
378 aa  143  5e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  28.49 
 
 
403 aa  143  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  28.53 
 
 
389 aa  142  8e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  29.62 
 
 
425 aa  142  9e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  26.88 
 
 
364 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  29.62 
 
 
425 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  25.64 
 
 
401 aa  141  1.9999999999999998e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  27.06 
 
 
418 aa  140  3e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  31.07 
 
 
408 aa  140  3.9999999999999997e-32  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  28.06 
 
 
395 aa  140  6e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>