More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeSA_A1590 on replicon NC_011094
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01563  DNA-binding transcriptional repressor  91.38 
 
 		 406 aa  767    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2049  ROK familiy protein  91.38 
 
 		 406 aa  767    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.688141  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1851  transcriptional regulator Mic  99.51 
 
 		 406 aa  825    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1684  transcriptional regulator Mic  99.75 
 
 		 406 aa  826    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.886112  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1599  transcriptional regulator Mic  100 
 
 		 406 aa  828    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.510024  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1780  transcriptional regulator Mic  91.13 
 
 		 406 aa  765    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.905565  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1606  transcriptional regulator Mic  91.38 
 
 		 406 aa  768    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2036  ROK family protein  91.38 
 
 		 406 aa  767    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2304  transcriptional regulator Mic  91.38 
 
 		 406 aa  769    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0485397 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1919  ROK family protein  87.19 
 
 		 407 aa  735    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01553  hypothetical protein  91.38 
 
 		 406 aa  767    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1658  transcriptional regulator Mic  99.75 
 
 		 406 aa  827    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1668  transcriptional regulator Mic  91.38 
 
 		 406 aa  767    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1801  transcriptional regulator Mic  91.38 
 
 		 406 aa  769    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1590  transcriptional regulator Mic  100 
 
 		 406 aa  828    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0384401 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2283  ROK family protein  75.37 
 
 		 405 aa  633  1e-180  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.060664 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1981  ROK family protein  73.15 
 
 		 405 aa  621  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1869  Mlc protein  73.15 
 
 		 405 aa  621  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0472832  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2345  ROK family protein  71.43 
 
 		 405 aa  617  1e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.397454  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2044  ROK family protein  71.67 
 
 		 405 aa  613  9.999999999999999e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.463852  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1896  ROK family protein  70.69 
 
 		 405 aa  610  1e-173  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.865808  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2133  ROK family protein  71.43 
 
 		 405 aa  607  9.999999999999999e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0581  protein mlc (making large colonies protein)  46.52 
 
 		 416 aa  399  9.999999999999999e-111  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.960707  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  46.4 
 
 		 405 aa  399  9.999999999999999e-111  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  45.91 
 
 		 434 aa  396  1e-109  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  44.42 
 
 		 405 aa  385  1e-106  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  40.9 
 
 		 406 aa  316  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  40.9 
 
 		 406 aa  316  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  40.9 
 
 		 406 aa  316  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  40.9 
 
 		 406 aa  316  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  40.9 
 
 		 406 aa  316  5e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00633  DNA-binding transcriptional dual regulator, repressor of N-acetylglucosamine  40.15 
 
 		 406 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00296536  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2961  ROK familiy protein  40.15 
 
 		 406 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00551957  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  40.15 
 
 		 406 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0696  N-acetylglucosamine repressor  40.15 
 
 		 406 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00225291  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00624  hypothetical protein  40.15 
 
 		 406 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00267666  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  40.15 
 
 		 406 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2980  ROK family protein  40.15 
 
 		 406 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00049785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  40.15 
 
 		 406 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  40.15 
 
 		 406 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  39.65 
 
 		 407 aa  310  4e-83  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  39.4 
 
 		 406 aa  309  5e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  39.74 
 
 		 406 aa  307  2.0000000000000002e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  39.6 
 
 		 404 aa  306  4.0000000000000004e-82  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  39.15 
 
 		 408 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  39.15 
 
 		 408 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  39.15 
 
 		 408 aa  304  2.0000000000000002e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  38.4 
 
 		 404 aa  296  4e-79  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  38.9 
 
 		 407 aa  296  6e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  37.91 
 
 		 404 aa  294  2e-78  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3130  ROK family protein  37.16 
 
 		 407 aa  293  3e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.224994  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  36.66 
 
 		 404 aa  288  1e-76  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1201  ROK family protein  36.66 
 
 		 407 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0872056  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  33.17 
 
 		 408 aa  259  9e-68  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  26.68 
 
 		 408 aa  168  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  24.32 
 
 		 410 aa  162  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  27.99 
 
 		 400 aa  162  1e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3041  ROK family protein  26.86 
 
 		 410 aa  153  5.9999999999999996e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0418823 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0757  NagC-like transcriptional regulator  26.41 
 
 		 405 aa  151  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00860509  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  26.69 
 
 		 401 aa  150  4e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  28.41 
 
 		 389 aa  149  6e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  28.5 
 
 		 420 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  25.41 
 
 		 402 aa  147  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  27.67 
 
 		 401 aa  147  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  28.53 
 
 		 386 aa  146  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  24.08 
 
 		 396 aa  146  6e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  26.24 
 
 		 407 aa  144  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  29.18 
 
 		 386 aa  142  9e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1302  ROK family protein  28.22 
 
 		 400 aa  142  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  24.67 
 
 		 396 aa  141  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  24.53 
 
 		 408 aa  141  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  26.03 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  25.33 
 
 		 383 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  25.98 
 
 		 393 aa  138  2e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  27.32 
 
 		 418 aa  138  2e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  26.55 
 
 		 396 aa  137  3.0000000000000003e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  24.63 
 
 		 428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  29.36 
 
 		 425 aa  135  9e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  23.3 
 
 		 391 aa  135  9.999999999999999e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  29.54 
 
 		 425 aa  135  9.999999999999999e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  24.52 
 
 		 389 aa  135  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  28.57 
 
 		 390 aa  133  5e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  27.25 
 
 		 387 aa  132  7.999999999999999e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0256  ROK family protein  27.05 
 
 		 393 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  31.4 
 
 		 320 aa  131  2.0000000000000002e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  27.92 
 
 		 404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  32.16 
 
 		 314 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  32.16 
 
 		 314 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  24.65 
 
 		 402 aa  130  3e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1126  ROK family protein  29.27 
 
 		 371 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  31.06 
 
 		 332 aa  130  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  24.18 
 
 		 401 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  29.14 
 
 		 340 aa  129  6e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  34.3 
 
 		 318 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2620  ROK family protein  30.42 
 
 		 425 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  26.93 
 
 		 401 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  26.38 
 
 		 390 aa  128  2.0000000000000002e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  27.95 
 
 		 435 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  24.21 
 
 		 398 aa  126  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  23.6 
 
 		 399 aa  126  7e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>