More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtur_1116 on replicon NC_011661
Organism: Dictyoglomus turgidum DSM 6724



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  100 
 
 
320 aa  648    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  40.71 
 
 
312 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  42.68 
 
 
322 aa  232  5e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  39.94 
 
 
312 aa  225  9e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  39.68 
 
 
316 aa  224  2e-57  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  40.91 
 
 
347 aa  218  2e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  37.58 
 
 
315 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  37.58 
 
 
315 aa  211  2e-53  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  40.81 
 
 
340 aa  207  3e-52  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  41.12 
 
 
332 aa  206  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  36.99 
 
 
352 aa  205  9e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  38.17 
 
 
342 aa  203  3e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  39.81 
 
 
318 aa  200  1.9999999999999998e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  38.17 
 
 
321 aa  199  5e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  37.54 
 
 
332 aa  198  9e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  39.56 
 
 
328 aa  196  3e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  33.65 
 
 
317 aa  196  6e-49  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  37.9 
 
 
315 aa  194  1e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  36.79 
 
 
323 aa  194  2e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  38.78 
 
 
314 aa  191  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  38.78 
 
 
314 aa  191  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  38.61 
 
 
323 aa  190  2.9999999999999997e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  36.36 
 
 
308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  36.91 
 
 
315 aa  189  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  40 
 
 
317 aa  189  5.999999999999999e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  37.09 
 
 
396 aa  186  5e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  36.92 
 
 
315 aa  186  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  37.85 
 
 
321 aa  185  9e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  34.8 
 
 
318 aa  182  7e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3238  putative glucokinase, ROK family  38.72 
 
 
360 aa  182  7e-45  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0755996  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  37.85 
 
 
313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  39.24 
 
 
361 aa  180  4e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  37.9 
 
 
317 aa  179  4e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  36.28 
 
 
322 aa  177  2e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  33.33 
 
 
321 aa  177  2e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  36.28 
 
 
313 aa  177  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  37.14 
 
 
321 aa  175  9e-43  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  35.38 
 
 
316 aa  175  9.999999999999999e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  37.15 
 
 
314 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  35.96 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0770  glucose kinase  36.91 
 
 
322 aa  173  2.9999999999999996e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000145403  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  34.49 
 
 
306 aa  172  5e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  39.05 
 
 
317 aa  172  9e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  32.81 
 
 
335 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  34.47 
 
 
396 aa  171  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  36.94 
 
 
318 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  37.58 
 
 
327 aa  171  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  34.36 
 
 
314 aa  170  3e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0889  glucokinase  36.31 
 
 
319 aa  169  4e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1263  ROK family protein  34.49 
 
 
303 aa  169  4e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000116273  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1639  glucokinase  34.49 
 
 
324 aa  169  6e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00474414  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1033  glucokinase  39.38 
 
 
315 aa  169  8e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  37.46 
 
 
320 aa  169  9e-41  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  31.7 
 
 
321 aa  168  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3506  ROK family glucokinase  37.89 
 
 
315 aa  167  2e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502776 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  35.85 
 
 
312 aa  167  2.9999999999999998e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1953  ROK family protein  36.68 
 
 
321 aa  167  2.9999999999999998e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109027  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  35.4 
 
 
313 aa  165  8e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  31.96 
 
 
408 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1206  glucokinase  36.39 
 
 
323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000192168  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  37.85 
 
 
327 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  37.85 
 
 
327 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  37.26 
 
 
327 aa  162  6e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  37.26 
 
 
327 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  37.26 
 
 
327 aa  162  6e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  37.26 
 
 
327 aa  162  6e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  37.26 
 
 
327 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  37.26 
 
 
327 aa  162  6e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  34.83 
 
 
404 aa  162  6e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  37.26 
 
 
327 aa  162  6e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  38.17 
 
 
327 aa  161  1e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  32.5 
 
 
389 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  36.11 
 
 
314 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  29.97 
 
 
399 aa  160  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2184  ROK family protein  35.38 
 
 
328 aa  159  4e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000268105  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  29.81 
 
 
314 aa  159  8e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3072  glucokinase, ROK family  34.28 
 
 
314 aa  158  9e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  33.76 
 
 
303 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  35.02 
 
 
323 aa  157  2e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  33.96 
 
 
311 aa  157  2e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  34.18 
 
 
306 aa  157  2e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0049  ROK family protein  33.44 
 
 
336 aa  157  3e-37  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2559  ROK family protein  34.57 
 
 
307 aa  157  3e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1181  ROK family protein  35.21 
 
 
336 aa  156  5.0000000000000005e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  31.38 
 
 
315 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  33.96 
 
 
302 aa  156  5.0000000000000005e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0046  glucokinase  33.23 
 
 
335 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00210983  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_49  transcriptional regulator/sugar kinase  33.12 
 
 
334 aa  155  8e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0340377  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  34.53 
 
 
322 aa  155  9e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  34.18 
 
 
298 aa  154  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  29.58 
 
 
314 aa  154  1e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0297  ROK family protein  41.14 
 
 
321 aa  155  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  35.62 
 
 
363 aa  154  2.9999999999999998e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  33.95 
 
 
316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  31.21 
 
 
410 aa  153  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  35.02 
 
 
363 aa  153  4e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  33.23 
 
 
313 aa  153  4e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3326  glucokinase, ROK family  35.22 
 
 
329 aa  152  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195671  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  31.87 
 
 
302 aa  152  5e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0161  glucokinase  33.23 
 
 
320 aa  152  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.510247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>