More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_1953 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008554  Sfum_1953  ROK family protein  100 
 
 
321 aa  634    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109027  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  41.96 
 
 
322 aa  228  1e-58  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  38.02 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  36.68 
 
 
320 aa  186  6e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  39.12 
 
 
315 aa  185  7e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  36.59 
 
 
315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  36.59 
 
 
315 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  36.56 
 
 
321 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  35.38 
 
 
347 aa  179  4.999999999999999e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  35.05 
 
 
312 aa  178  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  37.34 
 
 
313 aa  177  2e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0297  ROK family protein  43.53 
 
 
321 aa  172  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  36.84 
 
 
396 aa  172  5e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1103  ROK family protein  35.91 
 
 
316 aa  172  1e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251323  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  36.28 
 
 
327 aa  170  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  36.28 
 
 
327 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  36.28 
 
 
327 aa  170  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  36.28 
 
 
327 aa  170  3e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  36.28 
 
 
327 aa  170  3e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  36.28 
 
 
327 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  37.15 
 
 
363 aa  170  3e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  36.28 
 
 
327 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  36.28 
 
 
327 aa  169  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  36.28 
 
 
327 aa  169  4e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  37.42 
 
 
352 aa  169  6e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  34.94 
 
 
312 aa  168  9e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  36.28 
 
 
327 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  31.94 
 
 
396 aa  167  2e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  36.64 
 
 
342 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  35.33 
 
 
327 aa  166  4e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  35.33 
 
 
317 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  36.76 
 
 
322 aa  166  5.9999999999999996e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  38.05 
 
 
340 aa  165  8e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  37.46 
 
 
318 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  34.89 
 
 
314 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  37.07 
 
 
318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  38.36 
 
 
332 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  37.5 
 
 
312 aa  164  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  35.58 
 
 
314 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  35.58 
 
 
314 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  39.35 
 
 
314 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1421  ROK family protein  32.59 
 
 
287 aa  160  2e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  36.45 
 
 
321 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  33.85 
 
 
328 aa  160  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  39.1 
 
 
313 aa  160  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  35.02 
 
 
315 aa  159  4e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  34.38 
 
 
315 aa  159  5e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  37.38 
 
 
363 aa  159  6e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0179  ROK family protein  40.37 
 
 
320 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  32.06 
 
 
323 aa  158  1e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0168  ROK family protein  40.37 
 
 
320 aa  158  1e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0161  glucokinase  39.88 
 
 
320 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.510247  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  35.94 
 
 
313 aa  156  6e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3238  putative glucokinase, ROK family  37.93 
 
 
360 aa  155  7e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0755996  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  35.78 
 
 
321 aa  155  8e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  36.68 
 
 
318 aa  155  1e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2404  ROK family protein  33.67 
 
 
333 aa  154  1e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  37.46 
 
 
312 aa  155  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  34.59 
 
 
316 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  33.65 
 
 
321 aa  154  2e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0259  transcriptional regulator  35.14 
 
 
336 aa  154  2.9999999999999998e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  36.54 
 
 
311 aa  153  4e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  34.69 
 
 
323 aa  153  4e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  34.06 
 
 
335 aa  153  5e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  30.7 
 
 
399 aa  152  7e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  33.23 
 
 
308 aa  151  1e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  37.14 
 
 
315 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  39.17 
 
 
323 aa  149  6e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0889  glucokinase  39.3 
 
 
319 aa  149  6e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0167  ROK family protein  39.63 
 
 
319 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  28.8 
 
 
391 aa  149  9e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  37.97 
 
 
361 aa  147  3e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  34.67 
 
 
325 aa  146  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  31.35 
 
 
317 aa  146  5e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  34.38 
 
 
314 aa  145  7.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  36.1 
 
 
313 aa  145  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2241  ROK family protein  32.01 
 
 
330 aa  144  2e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  30.03 
 
 
404 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  32.4 
 
 
317 aa  144  2e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  31.96 
 
 
316 aa  144  2e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8260  ROK family protein  38.8 
 
 
393 aa  144  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00405696 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  34.38 
 
 
317 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  33.65 
 
 
389 aa  143  3e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3506  ROK family glucokinase  36.02 
 
 
315 aa  143  4e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502776 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  30.94 
 
 
396 aa  142  6e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0901  ROK family protein  33.33 
 
 
319 aa  142  8e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2002  glucokinase, ROK family  35.33 
 
 
314 aa  142  9e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14733  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  33.75 
 
 
372 aa  142  9.999999999999999e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1056  ROK family protein  36.59 
 
 
317 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  28.4 
 
 
410 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  33.02 
 
 
319 aa  140  1.9999999999999998e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1197  ROK family protein  30.63 
 
 
314 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3072  glucokinase, ROK family  33.33 
 
 
314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2885  ROK family protein  37.34 
 
 
409 aa  140  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  27.53 
 
 
313 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1206  glucokinase  33.33 
 
 
323 aa  139  3.9999999999999997e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000192168  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0314  ROK family protein  31.52 
 
 
332 aa  139  4.999999999999999e-32  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.796435  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7038  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  30.72 
 
 
315 aa  139  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1639  glucokinase  33.33 
 
 
324 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00474414  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  33.76 
 
 
300 aa  139  8.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>