More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3238 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3238  putative glucokinase, ROK family  100 
 
 
360 aa  700    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0755996  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  62.85 
 
 
342 aa  377  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  61.34 
 
 
363 aa  367  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  65.09 
 
 
361 aa  355  1e-96  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  60.34 
 
 
363 aa  348  1e-94  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  59.06 
 
 
352 aa  347  1e-94  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  60.25 
 
 
323 aa  335  5e-91  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  58.36 
 
 
315 aa  325  9e-88  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  55.21 
 
 
315 aa  323  2e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  53.63 
 
 
314 aa  323  4e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  57.59 
 
 
314 aa  310  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  55.66 
 
 
312 aa  301  1e-80  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3239  putative glucokinase, ROK family  55.86 
 
 
330 aa  298  7e-80  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0667748  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  54.43 
 
 
313 aa  298  8e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  56.43 
 
 
314 aa  295  6e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  52.37 
 
 
314 aa  290  2e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  51.1 
 
 
313 aa  285  9e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2002  glucokinase, ROK family  51.1 
 
 
314 aa  281  1e-74  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14733  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3326  glucokinase, ROK family  55.28 
 
 
329 aa  277  2e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195671  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  51.42 
 
 
311 aa  277  2e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3506  ROK family glucokinase  55.84 
 
 
315 aa  275  8e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502776 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3109  glucokinase  53 
 
 
313 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  50.63 
 
 
320 aa  267  2e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6063  glucokinase, ROK family  52.85 
 
 
312 aa  263  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1033  glucokinase  54.23 
 
 
315 aa  263  3e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3274  ROK family glucokinase  55.84 
 
 
315 aa  263  4e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.769765  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3108  glucokinase  52.2 
 
 
335 aa  254  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3129  glucokinase, ROK family  52.35 
 
 
315 aa  251  2e-65  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  43.55 
 
 
314 aa  244  1.9999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  47.15 
 
 
325 aa  243  3e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  41.91 
 
 
314 aa  236  4e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24860  glucokinase  44.16 
 
 
313 aa  219  7e-56  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.227158  normal  0.765013 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  42.14 
 
 
316 aa  212  7.999999999999999e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  37.54 
 
 
322 aa  207  2e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  38.48 
 
 
320 aa  206  7e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3041  ROK family protein  41.77 
 
 
354 aa  204  3e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  35.51 
 
 
312 aa  197  3e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  39.27 
 
 
347 aa  192  6e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  36.76 
 
 
312 aa  185  9e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  41.43 
 
 
318 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  37.81 
 
 
321 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  34.36 
 
 
315 aa  170  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  34.36 
 
 
315 aa  170  4e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0889  glucokinase  40.68 
 
 
319 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  30.65 
 
 
313 aa  162  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  34.46 
 
 
315 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  32.91 
 
 
316 aa  158  1e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  31.55 
 
 
396 aa  159  1e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  33.64 
 
 
321 aa  158  1e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1953  ROK family protein  38.56 
 
 
321 aa  157  2e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109027  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  40.06 
 
 
312 aa  157  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  32.21 
 
 
323 aa  157  4e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  33.84 
 
 
316 aa  157  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  36.09 
 
 
335 aa  155  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  37.58 
 
 
321 aa  155  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  33.44 
 
 
315 aa  154  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  28.8 
 
 
400 aa  153  5e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  34.57 
 
 
303 aa  153  5.9999999999999996e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  39.38 
 
 
340 aa  152  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  34.38 
 
 
318 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  34.05 
 
 
328 aa  151  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  36.14 
 
 
314 aa  150  3e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  36.14 
 
 
314 aa  150  3e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  36.08 
 
 
321 aa  150  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  36 
 
 
327 aa  150  4e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  31.79 
 
 
311 aa  149  5e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  32.82 
 
 
409 aa  150  5e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5264  ROK family protein  40.37 
 
 
325 aa  149  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  33.85 
 
 
322 aa  149  7e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  36.73 
 
 
318 aa  149  8e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  38.39 
 
 
313 aa  149  8e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  32.31 
 
 
319 aa  149  8e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  34.91 
 
 
313 aa  149  9e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  30.38 
 
 
299 aa  148  2.0000000000000003e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  31.4 
 
 
395 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  32.62 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0046  glucokinase  35.47 
 
 
335 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00210983  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  34.74 
 
 
323 aa  147  3e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  31.55 
 
 
298 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  39.08 
 
 
332 aa  147  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0049  ROK family protein  36.06 
 
 
336 aa  146  5e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_49  transcriptional regulator/sugar kinase  36.06 
 
 
334 aa  145  8.000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0340377  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  36.45 
 
 
332 aa  145  9e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  32.72 
 
 
321 aa  145  1e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2372  ROK family protein  35.19 
 
 
332 aa  145  1e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.26662  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  32.41 
 
 
300 aa  144  3e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  34.38 
 
 
308 aa  144  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1181  ROK family protein  33.77 
 
 
336 aa  143  5e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  34.46 
 
 
322 aa  142  6e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  35.08 
 
 
327 aa  142  6e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  32.21 
 
 
396 aa  143  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  33.02 
 
 
316 aa  142  9e-33  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  34.77 
 
 
327 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  34.77 
 
 
327 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  34.77 
 
 
327 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  34.77 
 
 
327 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  34.77 
 
 
327 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  34.77 
 
 
327 aa  142  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3170  ROK family protein  39.01 
 
 
314 aa  142  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  28.62 
 
 
402 aa  142  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>