More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cthe_2938 on replicon NC_009012
Organism: Clostridium thermocellum ATCC 27405



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  100 
 
 		 317 aa  641    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  61.08 
 
 		 316 aa  360  2e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  51.29 
 
 		 312 aa  326  4.0000000000000003e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  51.61 
 
 		 312 aa  304  1.0000000000000001e-81  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0700  ROK family protein  47.45 
 
 		 325 aa  288  7e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00119336  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  38.83 
 
 		 322 aa  217  2e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  34.18 
 
 		 342 aa  212  5.999999999999999e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  37.9 
 
 		 320 aa  205  7e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  36.1 
 
 		 315 aa  202  5e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  35.26 
 
 		 315 aa  202  7e-51  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  35.26 
 
 		 315 aa  202  7e-51  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  36.86 
 
 		 317 aa  199  5e-50  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  40.38 
 
 		 314 aa  192  6e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  40.38 
 
 		 314 aa  192  6e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  40 
 
 		 313 aa  192  8e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  37.85 
 
 		 327 aa  189  4e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  37.85 
 
 		 327 aa  189  4e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  37.54 
 
 		 327 aa  189  7e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  37.54 
 
 		 327 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  37.54 
 
 		 327 aa  189  7e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  37.54 
 
 		 327 aa  189  7e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  37.54 
 
 		 327 aa  189  7e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  37.54 
 
 		 327 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  37.54 
 
 		 327 aa  189  7e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  34.69 
 
 		 314 aa  187  2e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  34.29 
 
 		 352 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  37.5 
 
 		 316 aa  187  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  37.7 
 
 		 315 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  37.54 
 
 		 327 aa  186  5e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  37.46 
 
 		 321 aa  186  6e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  38.99 
 
 		 317 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  37.22 
 
 		 327 aa  185  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  34.92 
 
 		 315 aa  183  4.0000000000000006e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  32.5 
 
 		 315 aa  181  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  34.92 
 
 		 361 aa  181  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3072  glucokinase, ROK family  38.46 
 
 		 314 aa  179  4e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  38.06 
 
 		 313 aa  179  4e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  34.8 
 
 		 325 aa  180  4e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  36.74 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  36.08 
 
 		 363 aa  178  1e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  36.08 
 
 		 363 aa  177  2e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  36.71 
 
 		 318 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  33.12 
 
 		 311 aa  174  9.999999999999999e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  34.29 
 
 		 323 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  34.29 
 
 		 313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  36.28 
 
 		 314 aa  172  5e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  33.75 
 
 		 347 aa  171  1e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  35.65 
 
 		 340 aa  171  1e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  32.69 
 
 		 321 aa  170  3e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  32.8 
 
 		 314 aa  169  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  33.23 
 
 		 328 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  37.5 
 
 		 313 aa  167  2e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  35.53 
 
 		 332 aa  166  5e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  36.11 
 
 		 321 aa  165  8e-40  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  35.71 
 
 		 308 aa  165  8e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  32.15 
 
 		 313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  32.59 
 
 		 318 aa  164  2.0000000000000002e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  33.44 
 
 		 335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  32.8 
 
 		 302 aa  162  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  32.61 
 
 		 300 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  33.45 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  34.49 
 
 		 318 aa  160  3e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  36.83 
 
 		 322 aa  160  3e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0512  ROK family protein  32.26 
 
 		 292 aa  159  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  32.49 
 
 		 313 aa  159  5e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  30.39 
 
 		 404 aa  159  6e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3506  ROK family glucokinase  36.71 
 
 		 315 aa  159  6e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502776 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  32.17 
 
 		 396 aa  159  8e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  32.29 
 
 		 332 aa  159  9e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  33.54 
 
 		 291 aa  158  1e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  32.28 
 
 		 298 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  31.83 
 
 		 400 aa  158  1e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  30.25 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1206  glucokinase  38.92 
 
 		 323 aa  157  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000192168  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2002  glucokinase, ROK family  34.98 
 
 		 314 aa  157  3e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14733  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  34.71 
 
 		 320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  32.48 
 
 		 317 aa  155  6e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  33.02 
 
 		 312 aa  155  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  30.62 
 
 		 314 aa  154  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0512  ROK family protein  31.61 
 
 		 292 aa  154  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.111021  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  35.03 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3109  glucokinase  36.59 
 
 		 313 aa  154  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0431  fructokinase  33.33 
 
 		 302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0449  fructokinase  33.33 
 
 		 302 aa  153  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0430  fructokinase  33.12 
 
 		 302 aa  154  2.9999999999999998e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  34.06 
 
 		 314 aa  153  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3108  glucokinase  30.89 
 
 		 335 aa  153  4e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0436  fructokinase  33.33 
 
 		 302 aa  153  4e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0491  fructokinase  33.12 
 
 		 302 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24860  glucokinase  32.92 
 
 		 313 aa  152  8e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.227158  normal  0.765013 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  33.76 
 
 		 300 aa  152  8.999999999999999e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4861  ROK family protein  30 
 
 		 292 aa  151  1e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2459  ROK family protein  32.23 
 
 		 313 aa  151  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.0122294  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0901  ROK family protein  32.47 
 
 		 319 aa  151  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  29.37 
 
 		 314 aa  150  3e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  33.59 
 
 		 396 aa  150  3e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0770  glucose kinase  36.16 
 
 		 322 aa  149  6e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000145403  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0469  fructokinase  32.19 
 
 		 302 aa  149  6e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3214  ROK familiy protein  32.19 
 
 		 302 aa  149  8e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00347  hypothetical protein  32.19 
 
 		 302 aa  149  8e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>