More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3109 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3109  glucokinase  100 
 
 		 313 aa  612  9.999999999999999e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  54.52 
 
 		 352 aa  325  5e-88  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  55.59 
 
 		 314 aa  324  9e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  54.46 
 
 		 315 aa  321  9.999999999999999e-87  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  51.76 
 
 		 342 aa  313  2.9999999999999996e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  50.64 
 
 		 314 aa  310  2e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  54.49 
 
 		 315 aa  307  1.0000000000000001e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  53.35 
 
 		 314 aa  296  2e-79  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  55.27 
 
 		 320 aa  295  8e-79  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  52.58 
 
 		 323 aa  293  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3238  putative glucokinase, ROK family  53 
 
 		 360 aa  292  5e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0755996  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3239  putative glucokinase, ROK family  54.14 
 
 		 330 aa  292  5e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0667748  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  50.48 
 
 		 313 aa  290  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3506  ROK family glucokinase  53.82 
 
 		 315 aa  289  5.0000000000000004e-77  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502776 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  52.58 
 
 		 311 aa  288  8e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  51.28 
 
 		 361 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  54.05 
 
 		 312 aa  285  1.0000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  51.92 
 
 		 314 aa  283  2.0000000000000002e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  49.84 
 
 		 313 aa  283  3.0000000000000004e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2002  glucokinase, ROK family  52.24 
 
 		 314 aa  282  5.000000000000001e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14733  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3274  ROK family glucokinase  53.5 
 
 		 315 aa  274  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.769765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  51.47 
 
 		 363 aa  268  7e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  49.35 
 
 		 363 aa  267  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6063  glucokinase, ROK family  52.24 
 
 		 312 aa  263  3e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3326  glucokinase, ROK family  50 
 
 		 329 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195671  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  47.1 
 
 		 325 aa  254  2.0000000000000002e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1033  glucokinase  48.57 
 
 		 315 aa  242  5e-63  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24860  glucokinase  44.16 
 
 		 313 aa  238  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.227158  normal  0.765013 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  40.66 
 
 		 314 aa  237  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3108  glucokinase  46.35 
 
 		 335 aa  237  2e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3129  glucokinase, ROK family  48.09 
 
 		 315 aa  236  4e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  40.98 
 
 		 314 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  42.31 
 
 		 316 aa  231  1e-59  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  40.26 
 
 		 322 aa  213  1.9999999999999998e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  38.66 
 
 		 312 aa  210  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3041  ROK family protein  38.59 
 
 		 354 aa  206  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  39.75 
 
 		 312 aa  202  5e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  37.9 
 
 		 315 aa  193  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  40.06 
 
 		 321 aa  185  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  33.94 
 
 		 347 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  39.87 
 
 		 318 aa  182  5.0000000000000004e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  39.42 
 
 		 321 aa  179  4.999999999999999e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  38.63 
 
 		 316 aa  177  3e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  31.85 
 
 		 299 aa  176  3e-43  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  34.47 
 
 		 320 aa  174  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  34.95 
 
 		 400 aa  174  9.999999999999999e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  36.59 
 
 		 317 aa  171  1e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  39.51 
 
 		 332 aa  171  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  37.38 
 
 		 322 aa  170  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  38.68 
 
 		 332 aa  169  4e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  38.14 
 
 		 321 aa  168  9e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  33.65 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  33.65 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0167  ROK family protein  37.96 
 
 		 319 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  38.08 
 
 		 340 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  34.28 
 
 		 315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  38.87 
 
 		 327 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  29.87 
 
 		 313 aa  160  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0889  glucokinase  42.17 
 
 		 319 aa  159  6e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  37.26 
 
 		 308 aa  159  7e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  35.69 
 
 		 316 aa  158  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  32.36 
 
 		 316 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  37.93 
 
 		 327 aa  156  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  37.93 
 
 		 327 aa  156  4e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  37.93 
 
 		 327 aa  156  4e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  37.93 
 
 		 327 aa  156  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  37.93 
 
 		 327 aa  156  4e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  37.93 
 
 		 327 aa  156  4e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  37.93 
 
 		 327 aa  156  4e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  36.77 
 
 		 313 aa  156  5.0000000000000005e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  37.62 
 
 		 327 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  37.62 
 
 		 327 aa  156  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  34.17 
 
 		 328 aa  155  6e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  33.44 
 
 		 317 aa  154  1e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  36 
 
 		 325 aa  154  1e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  37.54 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  32.6 
 
 		 323 aa  154  2.9999999999999998e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  37.42 
 
 		 313 aa  153  5e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0700  ROK family protein  30.82 
 
 		 325 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00119336  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  37.62 
 
 		 327 aa  151  1e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1953  ROK family protein  36.66 
 
 		 321 aa  152  1e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109027  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  31.85 
 
 		 298 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  33.75 
 
 		 318 aa  150  3e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  33.33 
 
 		 303 aa  150  3e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0112  ROK family protein  36.54 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  35.56 
 
 		 315 aa  149  4e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  33.33 
 
 		 300 aa  149  5e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  33.6 
 
 		 396 aa  149  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5264  ROK family protein  40.31 
 
 		 325 aa  148  9e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  31.92 
 
 		 396 aa  148  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  36.16 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  32.81 
 
 		 321 aa  147  2.0000000000000003e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  40.82 
 
 		 398 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  33.76 
 
 		 311 aa  147  3e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  40.65 
 
 		 418 aa  147  3e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  36.42 
 
 		 306 aa  146  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  33.23 
 
 		 335 aa  145  9e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2404  ROK family protein  34.39 
 
 		 333 aa  145  9e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0179  ROK family protein  36.36 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0168  ROK family protein  36.36 
 
 		 320 aa  145  1e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>