More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GYMC61_0217 on replicon NC_013411
Organism: Geobacillus sp. Y412MC61



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  100 
 
 
395 aa  796    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  68.18 
 
 
397 aa  536  1e-151  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  46.12 
 
 
400 aa  310  2e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  42.93 
 
 
409 aa  300  2e-80  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  40.1 
 
 
399 aa  275  7e-73  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  35.99 
 
 
364 aa  250  3e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  37.7 
 
 
399 aa  248  1e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  33.33 
 
 
408 aa  236  4e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  36.02 
 
 
418 aa  233  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  34.78 
 
 
396 aa  226  7e-58  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  32.81 
 
 
391 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  36.13 
 
 
414 aa  217  2.9999999999999998e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  32.74 
 
 
396 aa  216  5.9999999999999996e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  34.18 
 
 
383 aa  213  5.999999999999999e-54  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  31.77 
 
 
399 aa  208  1e-52  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  32.03 
 
 
400 aa  207  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  32.32 
 
 
410 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  30.31 
 
 
390 aa  204  3e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  33.33 
 
 
410 aa  193  3e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2407  ROK family protein  35.9 
 
 
403 aa  190  4e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.200641  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  33.93 
 
 
408 aa  189  5.999999999999999e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  29.41 
 
 
378 aa  188  1e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1294  transcriptional repressor of the xylose operon  37.08 
 
 
401 aa  187  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  31.85 
 
 
428 aa  186  6e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  35.09 
 
 
405 aa  186  6e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  31.87 
 
 
405 aa  186  7e-46  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  33.93 
 
 
400 aa  184  2.0000000000000003e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  33.16 
 
 
381 aa  185  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  31.33 
 
 
434 aa  184  3e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  30.73 
 
 
401 aa  183  5.0000000000000004e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1794  ROK family protein  33.76 
 
 
382 aa  179  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00140797  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  31.96 
 
 
398 aa  179  9e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  32.45 
 
 
395 aa  178  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0829  N-acetylglucosamine repressor  30.1 
 
 
404 aa  178  1e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.933569  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  30.65 
 
 
393 aa  177  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  32.04 
 
 
389 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  31.17 
 
 
405 aa  176  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  30.59 
 
 
404 aa  176  7e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  31.15 
 
 
397 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  31.13 
 
 
503 aa  174  2.9999999999999996e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01334  transcriptional regulator  29.59 
 
 
404 aa  174  2.9999999999999996e-42  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0575  ROK family protein  33.25 
 
 
420 aa  173  3.9999999999999995e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.193602  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  34.62 
 
 
312 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  31.82 
 
 
402 aa  173  5.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0352  ROK family protein  32.22 
 
 
391 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09540  transcriptional regulator/sugar kinase  29.66 
 
 
427 aa  172  5.999999999999999e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.208854 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  32.42 
 
 
396 aa  172  9e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  29.08 
 
 
404 aa  171  1e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0258  ROK family protein  29.89 
 
 
406 aa  171  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  29.08 
 
 
404 aa  171  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  29.6 
 
 
392 aa  171  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  32.26 
 
 
390 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3275  ROK family protein  30.96 
 
 
372 aa  170  3e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.545553  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0837  ROK family protein  30.57 
 
 
378 aa  171  3e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  29.79 
 
 
395 aa  171  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  33.14 
 
 
386 aa  170  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3783  ROK family protein  32.15 
 
 
457 aa  170  5e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00347065  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  31.43 
 
 
401 aa  169  7e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  32.32 
 
 
395 aa  169  8e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  32.93 
 
 
443 aa  169  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  33.76 
 
 
404 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  33.6 
 
 
402 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  32.98 
 
 
408 aa  166  9e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5569  ROK family protein  33.52 
 
 
448 aa  164  2.0000000000000002e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.575796  normal  0.481694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  28.61 
 
 
422 aa  164  2.0000000000000002e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1608  putative xylose repressor  32.23 
 
 
416 aa  164  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000726705  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1923  putative transcriptional repressor protein  30.47 
 
 
389 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.585113  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  31.72 
 
 
322 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2999  ROK family protein  31.17 
 
 
408 aa  163  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.609089  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1225  ROK family protein  31.43 
 
 
406 aa  162  8.000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.619428  normal  0.0842391 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0336  N-acetylglucosamine repressor  31.17 
 
 
408 aa  162  9e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0129193  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  30.33 
 
 
406 aa  162  9e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2911  N-acetylglucosamine repressor  31.17 
 
 
408 aa  162  9e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0186288  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2468  ROK family protein  29.87 
 
 
395 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.873832  normal  0.265065 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  31.33 
 
 
425 aa  161  2e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5345  ROK family protein  28.69 
 
 
417 aa  161  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  33.51 
 
 
395 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  30.19 
 
 
315 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  30.19 
 
 
315 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  30.59 
 
 
397 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  35.39 
 
 
312 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5021  ROK family protein  33.04 
 
 
387 aa  160  3e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  32.04 
 
 
402 aa  160  3e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1605  putative xylose repressor  30.81 
 
 
417 aa  160  4e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0688  ROK family protein  28.97 
 
 
387 aa  160  4e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  29.49 
 
 
406 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  29.49 
 
 
406 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  29.49 
 
 
406 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  29.49 
 
 
406 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  29.49 
 
 
406 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  28.54 
 
 
385 aa  159  8e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2765  ROK family protein  30.88 
 
 
410 aa  159  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0825037  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  35.56 
 
 
303 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1730  transcriptional repressor of the xylose operon  32.95 
 
 
396 aa  157  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.332399  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0814  ROK family protein  30.49 
 
 
379 aa  157  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00162994  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0267  ROK family protein  30.85 
 
 
414 aa  157  4e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.234434  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0767  N-acetylglucosamine repressor  28.39 
 
 
406 aa  156  6e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000547022  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0575  N-acetylglucosamine repressor  28.39 
 
 
406 aa  156  6e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.20725  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0720  N-acetylglucosamine repressor  28.39 
 
 
406 aa  156  6e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00253244  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0701  N-acetylglucosamine repressor  28.39 
 
 
406 aa  156  6e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000639309  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>