More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_3239 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_3239  putative glucokinase, ROK family  100 
 
 
330 aa  639    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0667748  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  55.86 
 
 
352 aa  328  5.0000000000000004e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  58.62 
 
 
315 aa  323  3e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  53 
 
 
314 aa  310  2e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3238  putative glucokinase, ROK family  55.86 
 
 
360 aa  310  2.9999999999999997e-83  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0755996  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  52.38 
 
 
342 aa  308  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  57.32 
 
 
311 aa  300  2e-80  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  58.54 
 
 
312 aa  295  8e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  53.03 
 
 
323 aa  292  6e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  52.7 
 
 
361 aa  291  1e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  54.57 
 
 
314 aa  288  1e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3109  glucokinase  54.14 
 
 
313 aa  283  3.0000000000000004e-75  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  53.33 
 
 
320 aa  283  4.0000000000000003e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  51.91 
 
 
315 aa  282  5.000000000000001e-75  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2002  glucokinase, ROK family  53 
 
 
314 aa  276  5e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14733  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  52.53 
 
 
314 aa  273  2.0000000000000002e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  52.4 
 
 
314 aa  273  2.0000000000000002e-72  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  51.57 
 
 
363 aa  271  1e-71  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  51.12 
 
 
313 aa  269  5.9999999999999995e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  50.64 
 
 
363 aa  263  2e-69  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  50 
 
 
313 aa  263  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3506  ROK family glucokinase  52.08 
 
 
315 aa  262  6.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3274  ROK family glucokinase  52.4 
 
 
315 aa  250  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.769765  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3108  glucokinase  50.16 
 
 
335 aa  249  6e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  49.52 
 
 
325 aa  248  1e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3129  glucokinase, ROK family  52.68 
 
 
315 aa  237  2e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1033  glucokinase  50.16 
 
 
315 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6063  glucokinase, ROK family  49.04 
 
 
312 aa  234  2.0000000000000002e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3326  glucokinase, ROK family  50.32 
 
 
329 aa  233  2.0000000000000002e-60  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195671  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  43.83 
 
 
314 aa  230  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  41.58 
 
 
314 aa  225  7e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24860  glucokinase  44.73 
 
 
313 aa  215  7e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.227158  normal  0.765013 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  43.08 
 
 
316 aa  202  8e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3041  ROK family protein  39.62 
 
 
354 aa  195  1e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  38.24 
 
 
322 aa  192  1e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  35.96 
 
 
312 aa  186  6e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  36.53 
 
 
347 aa  176  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  35.85 
 
 
312 aa  171  2e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  36.16 
 
 
315 aa  169  6e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  34.06 
 
 
320 aa  168  1e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0889  glucokinase  42.77 
 
 
319 aa  166  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  33.65 
 
 
316 aa  166  5e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  37.35 
 
 
318 aa  165  9e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  33.54 
 
 
321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  35 
 
 
318 aa  157  2e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  35.94 
 
 
300 aa  157  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  36.88 
 
 
327 aa  155  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  35.62 
 
 
303 aa  154  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  34.8 
 
 
316 aa  152  5.9999999999999996e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  34.07 
 
 
321 aa  152  1e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  35.13 
 
 
311 aa  151  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  34.8 
 
 
298 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  38.08 
 
 
332 aa  149  8e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  36.56 
 
 
327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  36.56 
 
 
327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  36.56 
 
 
327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  36.56 
 
 
327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  36.56 
 
 
327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  36.56 
 
 
327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  34.58 
 
 
302 aa  147  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  34.58 
 
 
300 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  32.72 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  36.56 
 
 
327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  33.33 
 
 
317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  36.56 
 
 
327 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  28.8 
 
 
313 aa  146  6e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  36.25 
 
 
327 aa  145  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  32.5 
 
 
315 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  32.5 
 
 
315 aa  145  1e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  35.13 
 
 
297 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  35.13 
 
 
297 aa  145  1e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  36.25 
 
 
327 aa  145  1e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  35.74 
 
 
308 aa  144  1e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  33.96 
 
 
315 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  32.52 
 
 
396 aa  143  3e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  36.97 
 
 
340 aa  143  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  34.89 
 
 
321 aa  143  5e-33  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  35.38 
 
 
321 aa  141  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  35.56 
 
 
313 aa  140  1.9999999999999998e-32  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0046  glucokinase  35.02 
 
 
335 aa  140  3e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00210983  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  35 
 
 
314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  27.52 
 
 
402 aa  140  3.9999999999999997e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  35 
 
 
314 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0167  ROK family protein  36.96 
 
 
319 aa  140  3.9999999999999997e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  31.11 
 
 
299 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  35.29 
 
 
322 aa  138  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  38.68 
 
 
398 aa  138  1e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0242  ROK domain-containing protein  36.45 
 
 
320 aa  137  3.0000000000000003e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.981562  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  35.76 
 
 
418 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  31.59 
 
 
410 aa  136  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  29.25 
 
 
317 aa  137  4e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  34.66 
 
 
321 aa  136  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  36.92 
 
 
302 aa  136  5e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  38.36 
 
 
312 aa  136  5e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  34.27 
 
 
319 aa  136  5e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1206  glucokinase  35 
 
 
323 aa  136  5e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000192168  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  31.78 
 
 
328 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  32.41 
 
 
302 aa  135  8e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  37.54 
 
 
315 aa  135  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3072  glucokinase, ROK family  31.93 
 
 
314 aa  135  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>