More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1308 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  100 
 
 
313 aa  617  1e-176  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  71.97 
 
 
314 aa  416  9.999999999999999e-116  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  61.59 
 
 
315 aa  357  9.999999999999999e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  56.13 
 
 
352 aa  329  3e-89  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  58.39 
 
 
323 aa  323  3e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  54.14 
 
 
342 aa  307  1.0000000000000001e-82  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  54.78 
 
 
314 aa  298  7e-80  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6063  glucokinase, ROK family  56.09 
 
 
312 aa  296  3e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1033  glucokinase  56.83 
 
 
315 aa  294  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3238  putative glucokinase, ROK family  54.43 
 
 
360 aa  291  1e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0755996  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3129  glucokinase, ROK family  55.1 
 
 
315 aa  285  5.999999999999999e-76  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  47.91 
 
 
314 aa  283  3.0000000000000004e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  51.45 
 
 
315 aa  280  2e-74  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  51.94 
 
 
363 aa  276  2e-73  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  51.13 
 
 
325 aa  275  9e-73  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  54.31 
 
 
361 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2002  glucokinase, ROK family  50.48 
 
 
314 aa  270  2.9999999999999997e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14733  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  52.6 
 
 
312 aa  268  8e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  50.65 
 
 
363 aa  268  1e-70  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  48.24 
 
 
313 aa  267  2e-70  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  47.59 
 
 
314 aa  263  2e-69  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  50.65 
 
 
311 aa  261  6.999999999999999e-69  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3506  ROK family glucokinase  51.91 
 
 
315 aa  261  6.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3274  ROK family glucokinase  51.91 
 
 
315 aa  254  2.0000000000000002e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.769765  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3109  glucokinase  49.84 
 
 
313 aa  253  4.0000000000000004e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24860  glucokinase  48.54 
 
 
313 aa  251  9.000000000000001e-66  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.227158  normal  0.765013 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3239  putative glucokinase, ROK family  51.12 
 
 
330 aa  250  2e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0667748  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  44.26 
 
 
314 aa  250  2e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  44.33 
 
 
314 aa  242  5e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  46.65 
 
 
320 aa  239  5e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3326  glucokinase, ROK family  47.27 
 
 
329 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195671  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3108  glucokinase  45.22 
 
 
335 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  38.85 
 
 
312 aa  219  7e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3041  ROK family protein  44.23 
 
 
354 aa  218  2e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  42.49 
 
 
316 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  39.68 
 
 
312 aa  210  3e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  35.05 
 
 
316 aa  184  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  35.4 
 
 
320 aa  180  2e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  38.17 
 
 
318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  39.23 
 
 
314 aa  178  1e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  39.23 
 
 
314 aa  178  1e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0889  glucokinase  46.6 
 
 
319 aa  175  8e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  36.08 
 
 
315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  37.38 
 
 
321 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  35.46 
 
 
322 aa  172  5e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  40.32 
 
 
306 aa  172  9e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  34.38 
 
 
323 aa  168  9e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  39.75 
 
 
312 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  36.54 
 
 
308 aa  167  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  35.96 
 
 
300 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  37.54 
 
 
322 aa  166  6.9999999999999995e-40  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  33.65 
 
 
315 aa  165  8e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  33.65 
 
 
315 aa  165  8e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  36.19 
 
 
316 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  32.17 
 
 
317 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  38.29 
 
 
321 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  36.62 
 
 
328 aa  163  4.0000000000000004e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  36.31 
 
 
347 aa  162  7e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  28.52 
 
 
313 aa  162  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  37.38 
 
 
313 aa  162  8.000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  34.29 
 
 
317 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  31.63 
 
 
299 aa  161  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  34.73 
 
 
298 aa  160  3e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  36.33 
 
 
315 aa  159  6e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  38.92 
 
 
313 aa  158  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3072  glucokinase, ROK family  38.24 
 
 
314 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  39.48 
 
 
321 aa  157  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1953  ROK family protein  39.1 
 
 
321 aa  155  6e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109027  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  35.35 
 
 
302 aa  155  8e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3170  ROK family protein  37.85 
 
 
314 aa  154  1e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  33.96 
 
 
319 aa  154  2e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  34.74 
 
 
297 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  35.42 
 
 
316 aa  153  4e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  34.74 
 
 
297 aa  153  4e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  36.22 
 
 
297 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  28.57 
 
 
400 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  33.44 
 
 
311 aa  150  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  32.37 
 
 
409 aa  150  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  34.49 
 
 
318 aa  150  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  36.19 
 
 
306 aa  149  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  35.33 
 
 
335 aa  148  1.0000000000000001e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  33.23 
 
 
302 aa  148  1.0000000000000001e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1181  ROK family protein  35.25 
 
 
336 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5102  ROK family protein  36.1 
 
 
307 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  34.18 
 
 
327 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0167  ROK family protein  37.19 
 
 
319 aa  146  4.0000000000000006e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  33.76 
 
 
300 aa  146  5e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  29.6 
 
 
317 aa  146  6e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0390  ROK domain-containing protein  32.75 
 
 
404 aa  145  6e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  28.43 
 
 
396 aa  145  8.000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  33.44 
 
 
303 aa  145  1e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  37.31 
 
 
332 aa  145  1e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  37.78 
 
 
315 aa  144  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  36.83 
 
 
306 aa  144  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  31.5 
 
 
396 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5264  ROK family protein  38.59 
 
 
325 aa  143  4e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  33.54 
 
 
327 aa  143  4e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  33.54 
 
 
327 aa  143  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1643  glucokinase  29.51 
 
 
313 aa  142  6e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  35.03 
 
 
302 aa  142  6e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>