More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_15770 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  100 
 
 
314 aa  615  1e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  72.29 
 
 
314 aa  456  1e-127  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2002  glucokinase, ROK family  73.89 
 
 
314 aa  431  1e-120  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14733  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  72.93 
 
 
315 aa  428  1e-119  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  60.7 
 
 
312 aa  331  1e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  53.23 
 
 
352 aa  314  1.9999999999999998e-84  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  56.87 
 
 
311 aa  311  7.999999999999999e-84  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  51.44 
 
 
342 aa  310  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  55.95 
 
 
314 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  53.7 
 
 
323 aa  300  1e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  52.73 
 
 
314 aa  293  4e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  53.67 
 
 
361 aa  290  2e-77  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  50.64 
 
 
313 aa  290  3e-77  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3238  putative glucokinase, ROK family  52.35 
 
 
360 aa  290  3e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0755996  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3506  ROK family glucokinase  54.17 
 
 
315 aa  288  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502776 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  51.12 
 
 
315 aa  285  5.999999999999999e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3239  putative glucokinase, ROK family  54.57 
 
 
330 aa  284  1.0000000000000001e-75  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0667748  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  52.73 
 
 
363 aa  283  3.0000000000000004e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  49.84 
 
 
316 aa  282  4.0000000000000003e-75  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3274  ROK family glucokinase  55.13 
 
 
315 aa  278  7e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.769765  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6063  glucokinase, ROK family  54.52 
 
 
312 aa  274  1.0000000000000001e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  47.59 
 
 
313 aa  269  5e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  50.32 
 
 
363 aa  268  7e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  51.6 
 
 
320 aa  268  7e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3109  glucokinase  51.92 
 
 
313 aa  267  2e-70  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  47.28 
 
 
325 aa  258  8e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24860  glucokinase  46.33 
 
 
313 aa  243  3e-63  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.227158  normal  0.765013 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3326  glucokinase, ROK family  48.1 
 
 
329 aa  243  3e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195671  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3129  glucokinase, ROK family  48.73 
 
 
315 aa  241  2e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  42.57 
 
 
314 aa  240  2e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1033  glucokinase  47.45 
 
 
315 aa  238  1e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  40.13 
 
 
314 aa  226  3e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3108  glucokinase  46.01 
 
 
335 aa  225  9e-58  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3041  ROK family protein  39.55 
 
 
354 aa  202  4e-51  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  35.35 
 
 
312 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  35.51 
 
 
322 aa  179  5.999999999999999e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  35.2 
 
 
315 aa  174  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  35.08 
 
 
347 aa  170  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  33.75 
 
 
320 aa  170  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  36.25 
 
 
318 aa  170  3e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  34.15 
 
 
323 aa  170  3e-41  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  34.92 
 
 
312 aa  169  6e-41  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0889  glucokinase  41.82 
 
 
319 aa  166  5e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  35.96 
 
 
321 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  36.88 
 
 
321 aa  162  5.0000000000000005e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  34.06 
 
 
317 aa  162  9e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  36.96 
 
 
328 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  34.38 
 
 
316 aa  160  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  33.65 
 
 
316 aa  160  2e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  40.19 
 
 
312 aa  160  3e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  32.62 
 
 
321 aa  159  5e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  36.1 
 
 
321 aa  159  8e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3072  glucokinase, ROK family  33.96 
 
 
314 aa  157  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  30.84 
 
 
313 aa  156  3e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  36.28 
 
 
318 aa  157  3e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  33.33 
 
 
327 aa  155  7e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  34.82 
 
 
300 aa  155  7e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  35.76 
 
 
313 aa  155  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  36.79 
 
 
332 aa  154  2e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  34.27 
 
 
321 aa  153  2.9999999999999998e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  33.97 
 
 
308 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  29.97 
 
 
315 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  29.97 
 
 
315 aa  150  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  32.71 
 
 
327 aa  149  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  32.71 
 
 
327 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  32.71 
 
 
327 aa  149  5e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  32.71 
 
 
327 aa  149  5e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  32.71 
 
 
327 aa  149  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  32.71 
 
 
327 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  32.71 
 
 
327 aa  149  5e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  35.33 
 
 
335 aa  149  6e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  36.99 
 
 
332 aa  149  8e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  33.02 
 
 
327 aa  149  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  29.71 
 
 
400 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7038  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  35.51 
 
 
315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  32.71 
 
 
327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  32.71 
 
 
327 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  32.37 
 
 
298 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1953  ROK family protein  34.38 
 
 
321 aa  147  3e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109027  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  36.68 
 
 
340 aa  146  4.0000000000000006e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  34.81 
 
 
313 aa  145  8.000000000000001e-34  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  29.5 
 
 
317 aa  144  2e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  30.96 
 
 
299 aa  144  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  34.92 
 
 
297 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  34.92 
 
 
297 aa  144  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  33.02 
 
 
322 aa  144  3e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  34.7 
 
 
315 aa  144  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1507  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  38.12 
 
 
319 aa  143  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453151  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  32.81 
 
 
303 aa  142  5e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  35.13 
 
 
418 aa  142  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1206  glucokinase  34.98 
 
 
323 aa  142  9e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000192168  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1643  glucokinase  30.84 
 
 
313 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  34.19 
 
 
302 aa  141  1.9999999999999998e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  31.87 
 
 
323 aa  140  3e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  35.29 
 
 
317 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  35.58 
 
 
302 aa  140  3.9999999999999997e-32  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2974  ROK family protein  35.78 
 
 
300 aa  139  6e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.678034  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  33.02 
 
 
311 aa  139  7e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  35.2 
 
 
318 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  33.12 
 
 
325 aa  137  2e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>