More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_6210 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  100 
 
 
302 aa  592  1e-168  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0287  ROK family protein  57.84 
 
 
320 aa  294  1e-78  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.490636 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0246  ROK family protein  56.44 
 
 
321 aa  278  8e-74  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5908  ROK family protein  51.35 
 
 
322 aa  256  4e-67  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.704405 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7038  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  48.47 
 
 
315 aa  235  6e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  49.33 
 
 
315 aa  224  2e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0112  ROK family protein  44.26 
 
 
313 aa  212  7e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2360  ROK family protein  52.3 
 
 
302 aa  209  5e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.107325 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6923  ROK family protein  48.53 
 
 
299 aa  208  1e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  35.37 
 
 
312 aa  195  6e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00680  transcriptional regulator/sugar kinase  43.14 
 
 
310 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4333  ROK family protein  42.44 
 
 
326 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380756  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  36.33 
 
 
312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4775  ROK family protein  42.07 
 
 
321 aa  181  2e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16630  transcriptional regulator/sugar kinase  44.26 
 
 
335 aa  180  2e-44  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.535989  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1710  ROK family protein  42.24 
 
 
320 aa  176  6e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0238  ROK family protein  36.51 
 
 
323 aa  169  6e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  36.94 
 
 
352 aa  169  8e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  37.22 
 
 
315 aa  168  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01960  transcriptional regulator/sugar kinase  40.21 
 
 
322 aa  168  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.739718  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  34.75 
 
 
298 aa  165  8e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  33.12 
 
 
303 aa  159  7e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  30.77 
 
 
315 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  30.77 
 
 
315 aa  158  1e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  34.67 
 
 
302 aa  157  2e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  35.02 
 
 
342 aa  156  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  32.7 
 
 
322 aa  156  4e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  33.96 
 
 
320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  35.43 
 
 
297 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  35.43 
 
 
297 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3538  ROK family protein  42.86 
 
 
317 aa  154  1e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  0.368494 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  33.01 
 
 
316 aa  154  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  31.61 
 
 
313 aa  153  4e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  34.43 
 
 
311 aa  151  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  35.94 
 
 
318 aa  150  2e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  37.62 
 
 
323 aa  150  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  38.56 
 
 
313 aa  149  5e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  36.51 
 
 
315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  38.03 
 
 
306 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  36.86 
 
 
325 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  27.65 
 
 
313 aa  144  3e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  35.35 
 
 
313 aa  143  3e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  29.9 
 
 
300 aa  144  3e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  31.95 
 
 
315 aa  143  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  32.57 
 
 
308 aa  143  3e-33  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  31.33 
 
 
321 aa  143  4e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  36.02 
 
 
332 aa  143  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  33.97 
 
 
313 aa  142  6e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  34.08 
 
 
321 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  32.09 
 
 
327 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  32.09 
 
 
327 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  32.09 
 
 
327 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  32.09 
 
 
327 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  32.09 
 
 
327 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  31.78 
 
 
327 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  32.09 
 
 
327 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  32.09 
 
 
327 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  31.37 
 
 
322 aa  140  1.9999999999999998e-32  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  30.74 
 
 
317 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  32.8 
 
 
317 aa  139  4.999999999999999e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  31.46 
 
 
327 aa  139  6e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  31.46 
 
 
327 aa  139  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  34.08 
 
 
363 aa  139  7e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  34.84 
 
 
311 aa  139  7.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  34.7 
 
 
317 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5102  ROK family protein  36.46 
 
 
307 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  32.49 
 
 
328 aa  138  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  32.48 
 
 
314 aa  137  2e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  31.99 
 
 
300 aa  137  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  32.48 
 
 
314 aa  137  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  34.17 
 
 
340 aa  137  2e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  37.06 
 
 
361 aa  137  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  32.89 
 
 
321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  35.6 
 
 
363 aa  136  4e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  31.58 
 
 
327 aa  136  4e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  34.19 
 
 
314 aa  136  4e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  29.86 
 
 
396 aa  136  5e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  34.43 
 
 
314 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  31.95 
 
 
317 aa  135  8e-31  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3170  ROK family protein  34.85 
 
 
314 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  32.48 
 
 
318 aa  133  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  34.74 
 
 
312 aa  133  3e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  34.6 
 
 
314 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  29.31 
 
 
299 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  35.29 
 
 
410 aa  133  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2974  ROK family protein  35.4 
 
 
300 aa  132  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.678034  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  33.78 
 
 
302 aa  132  6.999999999999999e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  31.55 
 
 
316 aa  132  7.999999999999999e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  33.65 
 
 
318 aa  132  9e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  34.2 
 
 
297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  33.33 
 
 
404 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  33 
 
 
405 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1643  glucokinase  28.21 
 
 
313 aa  130  3e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  36.25 
 
 
312 aa  129  6e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_49  transcriptional regulator/sugar kinase  36.14 
 
 
334 aa  129  7.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0340377  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  30.42 
 
 
316 aa  129  7.000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  31.55 
 
 
347 aa  128  1.0000000000000001e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  30.99 
 
 
396 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24860  glucokinase  35.03 
 
 
313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.227158  normal  0.765013 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  33.01 
 
 
315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>