More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_1206 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_1206  glucokinase  100 
 
 		 323 aa  657    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000192168  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  75.79 
 
 		 321 aa  479  1e-134  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  67.82 
 
 		 323 aa  436  1e-121  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  62.89 
 
 		 323 aa  419  1e-116  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  62.7 
 
 		 322 aa  394  1e-108  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0770  glucose kinase  62.78 
 
 		 322 aa  386  1e-106  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000145403  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  50.77 
 
 		 317 aa  286  2e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  51.1 
 
 		 318 aa  279  4e-74  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  49.21 
 
 		 327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  49.21 
 
 		 327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  49.21 
 
 		 327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  49.21 
 
 		 327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  49.21 
 
 		 327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  49.21 
 
 		 327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  49.21 
 
 		 327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  49.21 
 
 		 327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  49.21 
 
 		 327 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  48.26 
 
 		 327 aa  272  5.000000000000001e-72  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  48.26 
 
 		 327 aa  269  5e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  40.62 
 
 		 347 aa  222  4.9999999999999996e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  37.34 
 
 		 322 aa  218  1e-55  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1605  ROK family glucokinase  40.68 
 
 		 328 aa  211  9e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.143197  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1639  ROK family glucokinase  40.68 
 
 		 328 aa  211  9e-54  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.352647  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  38.14 
 
 		 317 aa  206  3e-52  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0329  ROK family glucokinase  42.63 
 
 		 312 aa  200  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  36.39 
 
 		 320 aa  196  6e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1112  glucokinase  39.75 
 
 		 328 aa  195  7e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.689445  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  37.85 
 
 		 308 aa  193  3e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  36.94 
 
 		 315 aa  190  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3072  glucokinase, ROK family  40.19 
 
 		 314 aa  186  4e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  34.59 
 
 		 342 aa  184  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  35.13 
 
 		 315 aa  183  3e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  35.13 
 
 		 315 aa  183  3e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  35.2 
 
 		 328 aa  182  6e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  31.96 
 
 		 313 aa  180  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  38.78 
 
 		 312 aa  178  9e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  35.74 
 
 		 314 aa  176  5e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  35.74 
 
 		 314 aa  176  5e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  35.96 
 
 		 352 aa  172  5e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  34.91 
 
 		 313 aa  171  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  38.92 
 
 		 317 aa  169  4e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  36.99 
 
 		 313 aa  168  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  35 
 
 		 314 aa  168  1e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  39.3 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  31.76 
 
 		 332 aa  167  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  37.03 
 
 		 315 aa  166  5e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  36.25 
 
 		 318 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  31.96 
 
 		 321 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  33.55 
 
 		 316 aa  165  1.0000000000000001e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  36.71 
 
 		 321 aa  164  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  32.26 
 
 		 321 aa  163  4.0000000000000004e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  35.03 
 
 		 317 aa  163  5.0000000000000005e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  33.86 
 
 		 300 aa  162  8.000000000000001e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  34.7 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  35.6 
 
 		 321 aa  160  2e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  38.54 
 
 		 320 aa  160  2e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  33.02 
 
 		 325 aa  160  2e-38  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  35.42 
 
 		 361 aa  160  3e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  35.13 
 
 		 316 aa  160  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  33.65 
 
 		 315 aa  159  7e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  33.44 
 
 		 311 aa  159  7e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  34.38 
 
 		 302 aa  158  1e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  33.55 
 
 		 317 aa  157  2e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1263  ROK family protein  34.6 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000116273  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  34.57 
 
 		 303 aa  156  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  34.58 
 
 		 313 aa  155  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  31.15 
 
 		 316 aa  155  7e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2714  ROK family protein  35.83 
 
 		 318 aa  155  7e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  33.75 
 
 		 311 aa  155  8e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1643  glucokinase  31.96 
 
 		 313 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  34.19 
 
 		 323 aa  154  2e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0259  transcriptional regulator  32.36 
 
 		 336 aa  154  2e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1702  ROK family protein  35.46 
 
 		 318 aa  151  1e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38694  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1953  ROK family protein  33.33 
 
 		 321 aa  151  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109027  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  32.15 
 
 		 300 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  32.08 
 
 		 315 aa  150  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  31.31 
 
 		 400 aa  150  4e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1507  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  37.62 
 
 		 319 aa  149  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453151  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  29.49 
 
 		 408 aa  149  6e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3238  putative glucokinase, ROK family  33.85 
 
 		 360 aa  149  6e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0755996  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  28.9 
 
 		 399 aa  149  7e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3506  ROK family glucokinase  37.3 
 
 		 315 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502776 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0320  ROK family protein  36.83 
 
 		 322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.0261245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  32.28 
 
 		 395 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5264  ROK family protein  33.54 
 
 		 325 aa  147  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  33.12 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  33.12 
 
 		 297 aa  147  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  32.82 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  28.62 
 
 		 386 aa  147  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  34.37 
 
 		 314 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1639  glucokinase  35.11 
 
 		 324 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00474414  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  31.5 
 
 		 410 aa  145  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  30.91 
 
 		 325 aa  144  2e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  35.13 
 
 		 363 aa  144  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  29.11 
 
 		 402 aa  144  2e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  32.8 
 
 		 297 aa  143  3e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  33.33 
 
 		 418 aa  143  3e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  31.41 
 
 		 318 aa  143  3e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  34.7 
 
 		 340 aa  143  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  33.33 
 
 		 302 aa  143  5e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>