More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_24860 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_24860  glucokinase  100 
 
 		 313 aa  601  1.0000000000000001e-171  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.227158  normal  0.765013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  73.46 
 
 		 325 aa  421  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  58.64 
 
 		 314 aa  346  3e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3041  ROK family protein  61.36 
 
 		 354 aa  337  1.9999999999999998e-91  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  57.86 
 
 		 314 aa  324  1e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  48.54 
 
 		 313 aa  256  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  45.37 
 
 		 314 aa  255  8e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  45.66 
 
 		 342 aa  246  3e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  45.31 
 
 		 352 aa  244  1.9999999999999999e-63  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  46.33 
 
 		 314 aa  239  2.9999999999999997e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6063  glucokinase, ROK family  46.84 
 
 		 312 aa  233  3e-60  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  45.34 
 
 		 315 aa  233  3e-60  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  45.81 
 
 		 314 aa  232  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  47.1 
 
 		 314 aa  231  1e-59  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  47.57 
 
 		 361 aa  231  2e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  42.86 
 
 		 313 aa  226  4e-58  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  44.62 
 
 		 311 aa  222  8e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  43.77 
 
 		 315 aa  220  3e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3326  glucokinase, ROK family  47.32 
 
 		 329 aa  218  8.999999999999998e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195671  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3109  glucokinase  44.16 
 
 		 313 aa  218  1e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  44.34 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3238  putative glucokinase, ROK family  43.85 
 
 		 360 aa  212  4.9999999999999996e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0755996  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2002  glucokinase, ROK family  44.27 
 
 		 314 aa  211  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14733  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1033  glucokinase  46.43 
 
 		 315 aa  211  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  41.32 
 
 		 320 aa  204  1e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3239  putative glucokinase, ROK family  44.73 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0667748  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  44.19 
 
 		 312 aa  202  5e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3506  ROK family glucokinase  44.16 
 
 		 315 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502776 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3129  glucokinase, ROK family  45.71 
 
 		 315 aa  196  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  41.23 
 
 		 363 aa  196  4.0000000000000005e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3274  ROK family glucokinase  43.18 
 
 		 315 aa  193  4e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.769765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  40.72 
 
 		 363 aa  191  2e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  37.14 
 
 		 316 aa  189  4e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3108  glucokinase  41.48 
 
 		 335 aa  185  1.0000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  31.83 
 
 		 312 aa  172  6.999999999999999e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  32.19 
 
 		 321 aa  166  4e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  33.55 
 
 		 315 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  38.24 
 
 		 328 aa  161  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  39.68 
 
 		 318 aa  161  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  35 
 
 		 347 aa  161  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  33.85 
 
 		 300 aa  159  4e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  32.27 
 
 		 312 aa  160  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  34.27 
 
 		 322 aa  159  8e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  34.26 
 
 		 315 aa  158  9e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  30.67 
 
 		 322 aa  155  6e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  31.68 
 
 		 320 aa  154  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  28.03 
 
 		 317 aa  153  4e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  32.92 
 
 		 317 aa  150  2e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  25.57 
 
 		 313 aa  150  3e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  29.06 
 
 		 317 aa  150  3e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  31.86 
 
 		 316 aa  149  6e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  31.01 
 
 		 298 aa  149  8e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  28.01 
 
 		 299 aa  148  1.0000000000000001e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  31.56 
 
 		 300 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0889  glucokinase  39.49 
 
 		 319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  31.25 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  38.24 
 
 		 398 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  31.37 
 
 		 316 aa  147  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  34.08 
 
 		 319 aa  144  2e-33  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  36.53 
 
 		 321 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0901  ROK family protein  33.23 
 
 		 319 aa  142  5e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0046  glucokinase  34.48 
 
 		 335 aa  142  6e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00210983  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  35.03 
 
 		 302 aa  142  7e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  38.54 
 
 		 312 aa  142  7e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2957  ROK family protein  37.05 
 
 		 306 aa  142  8e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  36.3 
 
 		 321 aa  142  8e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5264  ROK family protein  38.22 
 
 		 325 aa  142  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0700  ROK family protein  32.3 
 
 		 325 aa  141  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00119336  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  38.35 
 
 		 306 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  31.77 
 
 		 316 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  30.38 
 
 		 315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  30.38 
 
 		 315 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  26.45 
 
 		 408 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  32.08 
 
 		 318 aa  139  6e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  32.3 
 
 		 407 aa  139  7.999999999999999e-32  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  30.43 
 
 		 409 aa  139  8.999999999999999e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  25.8 
 
 		 400 aa  137  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  32.73 
 
 		 396 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  35.8 
 
 		 313 aa  138  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3072  glucokinase, ROK family  32.17 
 
 		 314 aa  137  3.0000000000000003e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  29.47 
 
 		 303 aa  137  3.0000000000000003e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_002936  DET0049  ROK family protein  34.48 
 
 		 336 aa  136  4e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  30.03 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  34.29 
 
 		 325 aa  135  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2404  ROK family protein  34.53 
 
 		 333 aa  135  9.999999999999999e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  28.67 
 
 		 396 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  27.56 
 
 		 407 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_49  transcriptional regulator/sugar kinase  34.17 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0340377  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  34.48 
 
 		 443 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  37.74 
 
 		 418 aa  134  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  31.01 
 
 		 313 aa  133  3.9999999999999996e-30  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  31.03 
 
 		 308 aa  132  6e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1112  ROK family protein  30.63 
 
 		 407 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0112  ROK family protein  36.31 
 
 		 313 aa  132  1.0000000000000001e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  31.41 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  31.41 
 
 		 297 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1263  ROK family protein  33.44 
 
 		 303 aa  130  3e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000116273  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2005  ROK family protein  30.04 
 
 		 255 aa  130  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0056597  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0167  ROK family protein  34.56 
 
 		 319 aa  130  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.332557 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  28.85 
 
 		 327 aa  129  5.0000000000000004e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>