More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_6562 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  100 
 
 		 321 aa  654    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  40.69 
 
 		 328 aa  186  3e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  37.85 
 
 		 320 aa  185  9e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  37.62 
 
 		 321 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  35.87 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  35.22 
 
 		 318 aa  172  7.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  37.88 
 
 		 327 aa  169  6e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  37.88 
 
 		 327 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  37.88 
 
 		 327 aa  169  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  37.88 
 
 		 327 aa  169  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  37.88 
 
 		 327 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  37.88 
 
 		 327 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  37.88 
 
 		 327 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  37.58 
 
 		 327 aa  168  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  32.29 
 
 		 352 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  36.67 
 
 		 327 aa  166  5.9999999999999996e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  36.54 
 
 		 315 aa  165  6.9999999999999995e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  37.27 
 
 		 327 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  37.27 
 
 		 327 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  35.8 
 
 		 347 aa  163  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  32.6 
 
 		 342 aa  161  2e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  34.56 
 
 		 323 aa  159  5e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  34.48 
 
 		 322 aa  159  8e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  35.85 
 
 		 318 aa  157  2e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  33.96 
 
 		 303 aa  157  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  34.47 
 
 		 332 aa  155  7e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  37.85 
 
 		 317 aa  155  8e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  34.17 
 
 		 298 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  33.12 
 
 		 315 aa  152  7e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  33.12 
 
 		 315 aa  152  7e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  33.44 
 
 		 323 aa  152  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  36.62 
 
 		 321 aa  149  5e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  36.33 
 
 		 313 aa  148  9e-35  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24860  glucokinase  32.39 
 
 		 313 aa  146  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.227158  normal  0.765013 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  31.66 
 
 		 314 aa  146  6e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  33.86 
 
 		 313 aa  145  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  30.89 
 
 		 325 aa  145  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  30.7 
 
 		 321 aa  143  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  31.19 
 
 		 315 aa  143  4e-33  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  33.23 
 
 		 302 aa  142  6e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  30.87 
 
 		 408 aa  142  6e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  31.45 
 
 		 312 aa  142  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  32.29 
 
 		 317 aa  142  9.999999999999999e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  29.21 
 
 		 317 aa  141  1.9999999999999998e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  33.75 
 
 		 315 aa  139  6e-32  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  34.38 
 
 		 322 aa  139  7e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  31.65 
 
 		 315 aa  139  7e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0770  glucose kinase  34.37 
 
 		 322 aa  139  8.999999999999999e-32  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000145403  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  32.31 
 
 		 314 aa  138  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  30.16 
 
 		 321 aa  138  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  30.56 
 
 		 311 aa  137  3.0000000000000003e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3108  glucokinase  32.38 
 
 		 335 aa  137  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2184  ROK family protein  33.64 
 
 		 328 aa  136  6.0000000000000005e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000268105  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2002  glucokinase, ROK family  31.97 
 
 		 314 aa  135  7.000000000000001e-31  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14733  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3239  putative glucokinase, ROK family  33.54 
 
 		 330 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0667748  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  34.8 
 
 		 363 aa  134  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  33.74 
 
 		 323 aa  133  5e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  32.59 
 
 		 314 aa  132  6e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  32.59 
 
 		 314 aa  132  6e-30  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  32.7 
 
 		 308 aa  132  7.999999999999999e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  29.65 
 
 		 313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3506  ROK family glucokinase  32.81 
 
 		 315 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502776 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3072  glucokinase, ROK family  33.65 
 
 		 314 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  32.28 
 
 		 361 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1639  glucokinase  34.94 
 
 		 324 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00474414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0335  ROK family protein  33.64 
 
 		 327 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3238  putative glucokinase, ROK family  33.33 
 
 		 360 aa  130  4.0000000000000003e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0755996  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  35.6 
 
 		 398 aa  129  6e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  31.63 
 
 		 302 aa  129  7.000000000000001e-29  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  30.89 
 
 		 319 aa  129  7.000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1875  glucokinase  31.45 
 
 		 302 aa  129  8.000000000000001e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.173781  hitchhiker  0.00131381 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  34.24 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2372  ROK family protein  32.11 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.26662  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1206  glucokinase  35.6 
 
 		 323 aa  127  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000192168  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  34.06 
 
 		 332 aa  126  4.0000000000000003e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  32.92 
 
 		 312 aa  126  6e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  28.05 
 
 		 314 aa  125  7e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  33.84 
 
 		 340 aa  125  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1507  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  32.92 
 
 		 319 aa  125  9e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453151  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  31.35 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  31.35 
 
 		 297 aa  125  1e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  29.58 
 
 		 401 aa  125  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  32.41 
 
 		 312 aa  124  2e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  32.09 
 
 		 313 aa  124  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  32.75 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  31.23 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1702  ROK family protein  35.02 
 
 		 318 aa  123  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.38694  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  31.43 
 
 		 297 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  32.35 
 
 		 396 aa  124  3e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1094  ROK family protein  29.34 
 
 		 332 aa  124  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.000124678  hitchhiker  0.000000000129961 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2241  ROK family protein  32.63 
 
 		 330 aa  123  4e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  34.27 
 
 		 363 aa  123  5e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  33.23 
 
 		 320 aa  123  5e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0112  ROK family protein  32.27 
 
 		 313 aa  123  5e-27  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  28.21 
 
 		 402 aa  122  6e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1913  ROK family protein  34.29 
 
 		 326 aa  122  9e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.435171  unclonable  0.00000844821 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  32.98 
 
 		 325 aa  121  9.999999999999999e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3274  ROK family glucokinase  32.49 
 
 		 315 aa  122  9.999999999999999e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.769765  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  29.69 
 
 		 306 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  34.07 
 
 		 313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>