More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0098 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  100 
 
 
315 aa  629  1e-179  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  100 
 
 
315 aa  629  1e-179  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  45.57 
 
 
322 aa  263  2e-69  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  45.71 
 
 
315 aa  259  3e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  44.51 
 
 
317 aa  236  3e-61  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  43.04 
 
 
321 aa  230  3e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  43.99 
 
 
318 aa  229  5e-59  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  37.79 
 
 
315 aa  222  6e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  38.17 
 
 
321 aa  218  1e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  37.58 
 
 
321 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  36.57 
 
 
312 aa  213  3.9999999999999995e-54  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0297  ROK family protein  44.34 
 
 
321 aa  211  1e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  37.58 
 
 
320 aa  211  2e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  42.63 
 
 
317 aa  209  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  37.7 
 
 
323 aa  201  1.9999999999999998e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  41.21 
 
 
340 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  36.1 
 
 
318 aa  196  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  37.42 
 
 
312 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  39.05 
 
 
327 aa  195  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  39.03 
 
 
318 aa  195  1e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  39.05 
 
 
327 aa  195  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  40 
 
 
313 aa  194  2e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  38.73 
 
 
327 aa  193  3e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  38.73 
 
 
327 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  38.73 
 
 
327 aa  193  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  38.73 
 
 
327 aa  193  3e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  38.73 
 
 
327 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  38.73 
 
 
327 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  38.73 
 
 
327 aa  193  3e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  40.19 
 
 
332 aa  193  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  35.99 
 
 
342 aa  192  6e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  38.73 
 
 
327 aa  192  8e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  38.1 
 
 
327 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  37.5 
 
 
316 aa  187  2e-46  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  40.76 
 
 
300 aa  187  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  36.74 
 
 
312 aa  186  4e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  32.18 
 
 
317 aa  185  8e-46  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  34.77 
 
 
347 aa  185  1.0000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0259  transcriptional regulator  36.6 
 
 
336 aa  184  1.0000000000000001e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0049  ROK family protein  36.13 
 
 
336 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  35.26 
 
 
322 aa  182  5.0000000000000004e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  36.91 
 
 
322 aa  181  1e-44  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  33.01 
 
 
316 aa  181  1e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_49  transcriptional regulator/sugar kinase  34.95 
 
 
334 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0340377  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  35.26 
 
 
317 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  36.04 
 
 
396 aa  178  9e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  35.13 
 
 
316 aa  177  2e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  36.33 
 
 
313 aa  177  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0046  glucokinase  35.13 
 
 
335 aa  177  3e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00210983  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  35.78 
 
 
328 aa  177  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  36.76 
 
 
396 aa  176  5e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2404  ROK family protein  34.01 
 
 
333 aa  171  1e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  31.45 
 
 
335 aa  170  2e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  33.23 
 
 
352 aa  169  4e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4867  ROK family protein  31.21 
 
 
389 aa  169  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2974  ROK family protein  36.98 
 
 
300 aa  169  5e-41  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.678034  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3072  glucokinase, ROK family  36.94 
 
 
314 aa  169  6e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0770  glucose kinase  36.59 
 
 
322 aa  169  7e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000145403  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1953  ROK family protein  36.59 
 
 
321 aa  169  8e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109027  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  30.5 
 
 
391 aa  168  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  31.56 
 
 
414 aa  167  2e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  35.48 
 
 
314 aa  167  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  35.48 
 
 
314 aa  167  2e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  35.92 
 
 
308 aa  166  4e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0901  ROK family protein  33.33 
 
 
319 aa  166  5e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1181  ROK family protein  31.88 
 
 
336 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1103  ROK family protein  37.97 
 
 
316 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251323  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  33.87 
 
 
399 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  31.72 
 
 
408 aa  162  5.0000000000000005e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  32.17 
 
 
317 aa  162  5.0000000000000005e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  37.26 
 
 
313 aa  162  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  35.87 
 
 
323 aa  162  7e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0314  ROK family protein  32.61 
 
 
332 aa  162  1e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.796435  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_10490  transcriptional regulator/sugar kinase  31.83 
 
 
395 aa  160  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  32.38 
 
 
400 aa  161  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  30.19 
 
 
395 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2402  ROK family protein  34.94 
 
 
392 aa  160  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1197  ROK family protein  32.69 
 
 
314 aa  161  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0329  ROK family glucokinase  36.1 
 
 
312 aa  160  3e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  31.82 
 
 
397 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3170  ROK family protein  34.5 
 
 
314 aa  159  4e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0514  N-acetylglucosamine repressor  30.27 
 
 
404 aa  159  7e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  30.77 
 
 
302 aa  158  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0580  ROK family protein  31.91 
 
 
410 aa  156  3e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5102  ROK family protein  31.23 
 
 
307 aa  157  3e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1206  glucokinase  35.13 
 
 
323 aa  156  3e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000192168  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  32.47 
 
 
319 aa  156  4e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  33.65 
 
 
306 aa  156  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  35.67 
 
 
302 aa  155  9e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2944  ROK family protein  31.17 
 
 
407 aa  155  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0669477  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1690  ROK family protein  31.58 
 
 
332 aa  155  1e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  31.92 
 
 
404 aa  154  1e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0242  ROK domain-containing protein  37.38 
 
 
320 aa  154  2e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.981562  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5264  ROK family protein  35.14 
 
 
325 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1191  ROK family protein  31.27 
 
 
406 aa  154  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.417916  hitchhiker  0.000194034 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  33.97 
 
 
400 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  29.97 
 
 
313 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14840  transcriptional regulator/sugar kinase  30.41 
 
 
443 aa  153  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  33.23 
 
 
315 aa  153  4e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3048  ROK family protein  32.7 
 
 
323 aa  152  5.9999999999999996e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000252732 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>