More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1389 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  100 
 
 		 325 aa  621  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24860  glucokinase  73.46 
 
 		 313 aa  415  9.999999999999999e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.227158  normal  0.765013 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  62.58 
 
 		 314 aa  370  1e-101  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  57.48 
 
 		 314 aa  333  2e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3041  ROK family protein  59.35 
 
 		 354 aa  326  3e-88  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  51.13 
 
 		 313 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  48.24 
 
 		 342 aa  273  2.0000000000000002e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  45.54 
 
 		 314 aa  268  5.9999999999999995e-71  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  47.42 
 
 		 352 aa  268  7e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  50 
 
 		 315 aa  262  4.999999999999999e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  50.31 
 
 		 361 aa  262  6e-69  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  50.97 
 
 		 314 aa  258  1e-67  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  47.28 
 
 		 314 aa  256  3e-67  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  48.71 
 
 		 314 aa  254  2.0000000000000002e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2002  glucokinase, ROK family  48.56 
 
 		 314 aa  251  9.000000000000001e-66  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14733  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  47.45 
 
 		 315 aa  251  1e-65  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  49.52 
 
 		 311 aa  251  1e-65  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6063  glucokinase, ROK family  48.54 
 
 		 312 aa  243  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  47.27 
 
 		 323 aa  241  1e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  44.84 
 
 		 313 aa  240  2.9999999999999997e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3239  putative glucokinase, ROK family  49.52 
 
 		 330 aa  236  5.0000000000000005e-61  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0667748  normal  0.0321561 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3238  putative glucokinase, ROK family  46.84 
 
 		 360 aa  233  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0755996  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  49.52 
 
 		 312 aa  231  9e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  45.81 
 
 		 363 aa  229  6e-59  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3326  glucokinase, ROK family  47.42 
 
 		 329 aa  228  1e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.195671  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3506  ROK family glucokinase  47.59 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502776 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3274  ROK family glucokinase  47.91 
 
 		 315 aa  228  1e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.769765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3109  glucokinase  47.1 
 
 		 313 aa  224  1e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1033  glucokinase  46.47 
 
 		 315 aa  218  7.999999999999999e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  44.16 
 
 		 363 aa  213  3.9999999999999995e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3129  glucokinase, ROK family  47.13 
 
 		 315 aa  211  1e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  41.4 
 
 		 320 aa  207  1e-52  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3108  glucokinase  44.73 
 
 		 335 aa  207  2e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1856  NagC family Transcriptional regulator  38.85 
 
 		 316 aa  202  4e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  34.49 
 
 		 312 aa  198  9e-50  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  35.33 
 
 		 312 aa  187  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  35.44 
 
 		 315 aa  172  5e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  34.8 
 
 		 317 aa  169  6e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  31.63 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  34.39 
 
 		 323 aa  162  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  33.44 
 
 		 316 aa  161  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  31.01 
 
 		 320 aa  159  5e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  36.86 
 
 		 302 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  38.29 
 
 		 318 aa  157  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  34.39 
 
 		 300 aa  157  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  33.01 
 
 		 298 aa  155  8e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  39.75 
 
 		 312 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  32.81 
 
 		 316 aa  154  2e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  30.89 
 
 		 321 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  31.53 
 
 		 316 aa  153  2.9999999999999998e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  35.96 
 
 		 321 aa  153  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  35.53 
 
 		 318 aa  152  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  31.43 
 
 		 300 aa  152  8.999999999999999e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  33.13 
 
 		 347 aa  150  4e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0889  glucokinase  40.58 
 
 		 319 aa  150  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  32.17 
 
 		 396 aa  150  4e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  33.12 
 
 		 328 aa  149  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  28.75 
 
 		 317 aa  149  7e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1566  ROK family protein  32.71 
 
 		 322 aa  147  2.0000000000000003e-34  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  37.96 
 
 		 321 aa  147  3e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  25.89 
 
 		 313 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  36.36 
 
 		 335 aa  147  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  32.39 
 
 		 327 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_49  transcriptional regulator/sugar kinase  33.94 
 
 		 334 aa  144  2e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0340377  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  31.01 
 
 		 315 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  31.01 
 
 		 315 aa  144  3e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0046  glucokinase  33.64 
 
 		 335 aa  143  3e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00210983  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0049  ROK family protein  34.49 
 
 		 336 aa  143  4e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  28.34 
 
 		 299 aa  143  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  26.98 
 
 		 317 aa  143  5e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  37.27 
 
 		 315 aa  143  5e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1639  glucokinase  35.33 
 
 		 324 aa  142  7e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00474414  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5264  ROK family protein  38.34 
 
 		 325 aa  142  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.482994 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  32.37 
 
 		 313 aa  142  9e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  31.13 
 
 		 315 aa  142  9e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3170  ROK family protein  38.29 
 
 		 314 aa  142  9e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  32.18 
 
 		 303 aa  141  9.999999999999999e-33  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5908  ROK family protein  34.17 
 
 		 322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.704405 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  35.87 
 
 		 313 aa  141  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  35.62 
 
 		 306 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  35.55 
 
 		 398 aa  140  1.9999999999999998e-32  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  30.82 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  30.82 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  30.82 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  30.82 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  31.45 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  30.82 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  30.82 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  33.54 
 
 		 319 aa  140  3e-32  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  30.82 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  31.45 
 
 		 327 aa  140  3e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1636  transcriptional regulator/sugar kinase  27.3 
 
 		 300 aa  140  3.9999999999999997e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.582275  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1953  ROK family protein  34.57 
 
 		 321 aa  140  3.9999999999999997e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  29.06 
 
 		 323 aa  139  8.999999999999999e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  34.8 
 
 		 321 aa  138  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0471  glucokinase  32.29 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7038  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  33.55 
 
 		 315 aa  138  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  32.19 
 
 		 318 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  30.67 
 
 		 409 aa  139  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0112  ROK family protein  35.69 
 
 		 313 aa  139  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0430819 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>