More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_0112 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_0112  ROK family protein  100 
 
 		 313 aa  587  1e-167  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4775  ROK family protein  54 
 
 		 321 aa  241  1e-62  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4333  ROK family protein  51.64 
 
 		 326 aa  234  1.0000000000000001e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380756  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  44.26 
 
 		 302 aa  223  4e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7038  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  47.16 
 
 		 315 aa  214  1.9999999999999998e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  46.43 
 
 		 315 aa  195  8.000000000000001e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00680  transcriptional regulator/sugar kinase  43.96 
 
 		 310 aa  189  5e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5908  ROK family protein  45.58 
 
 		 322 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.704405 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0238  ROK family protein  41.85 
 
 		 323 aa  183  3e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6923  ROK family protein  45.82 
 
 		 299 aa  179  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2360  ROK family protein  48.48 
 
 		 302 aa  176  5e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.107325 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0287  ROK family protein  45.28 
 
 		 320 aa  170  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.490636 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0246  ROK family protein  46.13 
 
 		 321 aa  169  8e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16630  transcriptional regulator/sugar kinase  43.33 
 
 		 335 aa  159  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.535989  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  39.81 
 
 		 342 aa  158  9e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01960  transcriptional regulator/sugar kinase  40.28 
 
 		 322 aa  156  5.0000000000000005e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.739718  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  29.18 
 
 		 313 aa  155  9e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  31.94 
 
 		 312 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  34.73 
 
 		 315 aa  151  1e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1710  ROK family protein  39.93 
 
 		 320 aa  150  2e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  30.25 
 
 		 322 aa  150  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  34.32 
 
 		 298 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  39.74 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  41.21 
 
 		 323 aa  146  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  32.48 
 
 		 312 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  37.78 
 
 		 352 aa  145  1e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  37.3 
 
 		 311 aa  145  1e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  36.94 
 
 		 315 aa  145  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1643  glucokinase  29.18 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  32.91 
 
 		 327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  32.91 
 
 		 327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  33.12 
 
 		 327 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  39.18 
 
 		 361 aa  140  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  32.59 
 
 		 327 aa  139  7e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  32.59 
 
 		 327 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  32.59 
 
 		 327 aa  139  7e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  32.59 
 
 		 327 aa  139  7e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  32.59 
 
 		 327 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  32.59 
 
 		 327 aa  139  7e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  32.59 
 
 		 327 aa  139  7e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  29.77 
 
 		 316 aa  138  1e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  34.01 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  34.01 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  32.8 
 
 		 323 aa  136  4e-31  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  32.91 
 
 		 327 aa  136  4e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  36.31 
 
 		 320 aa  135  8e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  33.99 
 
 		 311 aa  135  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  32.67 
 
 		 303 aa  135  9.999999999999999e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  33.23 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  40.26 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  36.83 
 
 		 315 aa  135  9.999999999999999e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  30.79 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  35.02 
 
 		 321 aa  134  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  33.55 
 
 		 302 aa  133  3e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  35.29 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  35.76 
 
 		 314 aa  132  9e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  34.39 
 
 		 319 aa  132  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1197  ROK family protein  34.5 
 
 		 314 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  36.71 
 
 		 313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  39.12 
 
 		 312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  35.58 
 
 		 313 aa  131  2.0000000000000002e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  28.85 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  28.85 
 
 		 315 aa  130  3e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  30.53 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  33.02 
 
 		 328 aa  130  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  30.41 
 
 		 317 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  31.65 
 
 		 314 aa  129  6e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  31.65 
 
 		 314 aa  129  6e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  35.69 
 
 		 325 aa  129  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  32.98 
 
 		 386 aa  128  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  34.17 
 
 		 321 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  33.76 
 
 		 314 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  34.31 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  31.53 
 
 		 313 aa  127  2.0000000000000002e-28  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  28.73 
 
 		 391 aa  127  3e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  28.43 
 
 		 317 aa  127  3e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  32.61 
 
 		 321 aa  127  3e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  25.57 
 
 		 400 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  26.44 
 
 		 300 aa  126  6e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3538  ROK family protein  40.71 
 
 		 317 aa  125  8.000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  0.368494 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  30 
 
 		 315 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  32.24 
 
 		 409 aa  125  9e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1507  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  37.99 
 
 		 319 aa  125  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000453151  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  33.97 
 
 		 363 aa  125  1e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0887  N-acylmannosamine kinase  29.9 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2002  glucokinase, ROK family  36.45 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.14733  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  34.92 
 
 		 363 aa  124  2e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  26.38 
 
 		 408 aa  124  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0046  glucokinase  31.11 
 
 		 335 aa  124  2e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00210983  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  27.65 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  34.9 
 
 		 297 aa  124  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3506  ROK family glucokinase  36.59 
 
 		 315 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00502776 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24860  glucokinase  36.08 
 
 		 313 aa  123  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.227158  normal  0.765013 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3109  glucokinase  36.74 
 
 		 313 aa  123  4e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  33.65 
 
 		 317 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3108  glucokinase  35.22 
 
 		 335 aa  122  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2151  ROK family protein  37.13 
 
 		 316 aa  123  5e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  31.78 
 
 		 347 aa  122  7e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0049  ROK family protein  32.38 
 
 		 336 aa  122  9e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_49  transcriptional regulator/sugar kinase  32.06 
 
 		 334 aa  122  9.999999999999999e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0340377  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>