More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2360 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2360  ROK family protein  100 
 
 		 302 aa  565  1e-160  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.107325 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6923  ROK family protein  54.61 
 
 		 299 aa  242  5e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  52.3 
 
 		 302 aa  241  1e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16630  transcriptional regulator/sugar kinase  49 
 
 		 335 aa  211  9e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.535989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5908  ROK family protein  48.18 
 
 		 322 aa  208  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.704405 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0246  ROK family protein  52.96 
 
 		 321 aa  208  1e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0287  ROK family protein  52.27 
 
 		 320 aa  206  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.490636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7038  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  47.47 
 
 		 315 aa  200  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0112  ROK family protein  48.82 
 
 		 313 aa  193  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1710  ROK family protein  40.27 
 
 		 320 aa  187  1e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01960  transcriptional regulator/sugar kinase  44.72 
 
 		 322 aa  179  7e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.739718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00680  transcriptional regulator/sugar kinase  44.08 
 
 		 310 aa  176  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  45.33 
 
 		 315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  37.1 
 
 		 315 aa  166  4e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4775  ROK family protein  43.29 
 
 		 321 aa  166  4e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  38.85 
 
 		 352 aa  162  6e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  31.94 
 
 		 312 aa  162  6e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3538  ROK family protein  46.84 
 
 		 317 aa  161  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  0.368494 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0238  ROK family protein  38.29 
 
 		 323 aa  157  1e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4333  ROK family protein  41.95 
 
 		 326 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380756  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  38.8 
 
 		 342 aa  154  2e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  32.8 
 
 		 312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  41.48 
 
 		 323 aa  152  5e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  41.53 
 
 		 306 aa  146  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  39.47 
 
 		 313 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  38.54 
 
 		 312 aa  142  5e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  26.54 
 
 		 313 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  31.25 
 
 		 327 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  31.25 
 
 		 327 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  33 
 
 		 298 aa  139  3.9999999999999997e-32  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  39.24 
 
 		 325 aa  139  6e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  29.49 
 
 		 322 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  30.94 
 
 		 327 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  32.69 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  30.63 
 
 		 327 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  30.63 
 
 		 327 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  30.63 
 
 		 327 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  30.63 
 
 		 327 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  30.63 
 
 		 327 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  30.63 
 
 		 327 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  30.63 
 
 		 327 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  35.97 
 
 		 401 aa  135  7.000000000000001e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  30.63 
 
 		 327 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  38.49 
 
 		 314 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  29.83 
 
 		 391 aa  135  8e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  31.55 
 
 		 316 aa  135  8e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  33.23 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  33.23 
 
 		 314 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  35.42 
 
 		 315 aa  132  6e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5102  ROK family protein  37.41 
 
 		 307 aa  132  6e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  29.18 
 
 		 300 aa  132  6.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  37.7 
 
 		 311 aa  132  9e-30  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  29.94 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  29.94 
 
 		 315 aa  131  1.0000000000000001e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  31.46 
 
 		 303 aa  131  1.0000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  31.25 
 
 		 313 aa  129  4.0000000000000003e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1643  glucokinase  26.86 
 
 		 313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  35.06 
 
 		 314 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  33.83 
 
 		 396 aa  129  4.0000000000000003e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  30.67 
 
 		 317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  28.53 
 
 		 317 aa  130  4.0000000000000003e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  32.66 
 
 		 300 aa  129  5.0000000000000004e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  37.01 
 
 		 361 aa  129  7.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  33.11 
 
 		 311 aa  129  7.000000000000001e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  37.35 
 
 		 313 aa  128  9.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  43.35 
 
 		 422 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  33.54 
 
 		 313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  30.79 
 
 		 316 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  37.26 
 
 		 363 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3108  glucokinase  38.08 
 
 		 335 aa  127  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  30.67 
 
 		 308 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  35.02 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  33.55 
 
 		 318 aa  123  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0049  ROK family protein  33.12 
 
 		 336 aa  122  5e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.331576  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2260  ROK family protein  41.86 
 
 		 304 aa  123  5e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.149856 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  33.22 
 
 		 302 aa  122  5e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2675  ROK family protein  34.27 
 
 		 314 aa  122  7e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.233527  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  30.38 
 
 		 315 aa  122  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  34.7 
 
 		 315 aa  122  8e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  32.41 
 
 		 314 aa  122  9e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  35.88 
 
 		 401 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  33.99 
 
 		 418 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1197  ROK family protein  33.01 
 
 		 314 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  35.09 
 
 		 340 aa  121  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_49  transcriptional regulator/sugar kinase  32.81 
 
 		 334 aa  120  3e-26  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0340377  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  30.63 
 
 		 320 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2476  transcriptional regulator protein  43.84 
 
 		 363 aa  119  4.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.117612  normal  0.0568321 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  32.24 
 
 		 297 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  32.24 
 
 		 297 aa  119  7e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2160  ROK family protein  41.28 
 
 		 298 aa  119  7e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  33.21 
 
 		 386 aa  118  9.999999999999999e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  33.33 
 
 		 297 aa  118  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0661  ROK family protein  36.75 
 
 		 321 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6063  glucokinase, ROK family  33.96 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  35.85 
 
 		 314 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  27.21 
 
 		 400 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  31.89 
 
 		 320 aa  118  1.9999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  27.3 
 
 		 317 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  31.44 
 
 		 396 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3170  ROK family protein  36.31 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>