More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5908 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5908  ROK family protein  100 
 
 		 322 aa  617  1e-176  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.704405 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  51.69 
 
 		 302 aa  278  1e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0287  ROK family protein  52.12 
 
 		 320 aa  243  5e-63  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.490636 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7038  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  49.33 
 
 		 315 aa  236  5.0000000000000005e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0246  ROK family protein  49.49 
 
 		 321 aa  230  2e-59  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2360  ROK family protein  48.18 
 
 		 302 aa  197  3e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.107325 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0112  ROK family protein  45.58 
 
 		 313 aa  193  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6923  ROK family protein  45.75 
 
 		 299 aa  189  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  40.27 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4775  ROK family protein  41.79 
 
 		 321 aa  181  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01960  transcriptional regulator/sugar kinase  40.85 
 
 		 322 aa  177  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.739718  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4333  ROK family protein  41.07 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380756  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16630  transcriptional regulator/sugar kinase  37.7 
 
 		 335 aa  171  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.535989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00680  transcriptional regulator/sugar kinase  39.73 
 
 		 310 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  32.04 
 
 		 312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1710  ROK family protein  38 
 
 		 320 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  32.9 
 
 		 312 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  36.31 
 
 		 342 aa  156  4e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  36.51 
 
 		 352 aa  155  8e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  34.19 
 
 		 315 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0238  ROK family protein  37.2 
 
 		 323 aa  139  8.999999999999999e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  37 
 
 		 313 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3538  ROK family protein  41.7 
 
 		 317 aa  137  3.0000000000000003e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  0.368494 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  30.97 
 
 		 316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  35.96 
 
 		 313 aa  136  6.0000000000000005e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  34.91 
 
 		 325 aa  136  6.0000000000000005e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  36.59 
 
 		 323 aa  135  9.999999999999999e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  29.94 
 
 		 320 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  28.8 
 
 		 315 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  28.8 
 
 		 315 aa  134  3e-30  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  35.14 
 
 		 363 aa  133  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  33.01 
 
 		 328 aa  132  5e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  32.8 
 
 		 314 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  35.35 
 
 		 311 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  31.02 
 
 		 298 aa  130  3e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  30.62 
 
 		 303 aa  130  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  30.41 
 
 		 396 aa  129  6e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  29.87 
 
 		 322 aa  129  8.000000000000001e-29  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  32.51 
 
 		 405 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0088  ROK family protein  32.04 
 
 		 313 aa  129  9.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  33.54 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  36.39 
 
 		 314 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  34.02 
 
 		 404 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  24.43 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  33.01 
 
 		 422 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  32.92 
 
 		 314 aa  126  6e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  38.17 
 
 		 398 aa  125  8.000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  31.91 
 
 		 311 aa  125  9e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  31.88 
 
 		 347 aa  125  9e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1251  ROK family protein  36.69 
 
 		 306 aa  125  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.25299  normal  0.282751 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  34.49 
 
 		 314 aa  125  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  27.07 
 
 		 400 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1363  ROK family protein  34.74 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0520337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1323  ROK family protein  34.74 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000170604  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  31.45 
 
 		 386 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  32.38 
 
 		 313 aa  123  5e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  35.24 
 
 		 340 aa  122  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3188  ROK family protein  30 
 
 		 318 aa  122  9e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00496766  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  34.19 
 
 		 363 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2151  ROK family protein  34.87 
 
 		 316 aa  121  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  31.37 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  31.37 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  28.67 
 
 		 299 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  30.26 
 
 		 291 aa  120  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4056  ROK family protein  30.69 
 
 		 302 aa  120  3e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0168  ROK family protein  35.02 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0179  ROK family protein  35.02 
 
 		 320 aa  120  3e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  35.24 
 
 		 332 aa  120  3.9999999999999996e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  31.86 
 
 		 317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  35.15 
 
 		 361 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0161  glucokinase  34.49 
 
 		 320 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.510247  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5102  ROK family protein  35.31 
 
 		 307 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0545007 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  27.88 
 
 		 317 aa  117  3e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  27.91 
 
 		 300 aa  116  5e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5336  glucokinase  29.84 
 
 		 478 aa  116  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  34.31 
 
 		 312 aa  116  6.9999999999999995e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  31.15 
 
 		 302 aa  115  8.999999999999998e-25  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  28.9 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  33.33 
 
 		 320 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  30.42 
 
 		 319 aa  114  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  32.29 
 
 		 315 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24860  glucokinase  33.96 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.227158  normal  0.765013 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6562  ROK family protein  28.12 
 
 		 321 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  32.44 
 
 		 321 aa  114  3e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2139  ROK family protein  31.95 
 
 		 316 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2404  ROK family protein  32.46 
 
 		 333 aa  113  5e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.9022  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  29.77 
 
 		 321 aa  112  6e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  29.3 
 
 		 317 aa  112  7.000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  32.19 
 
 		 318 aa  112  9e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  32.31 
 
 		 300 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  29.3 
 
 		 318 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1643  glucokinase  24.76 
 
 		 313 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  31.68 
 
 		 306 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  29.54 
 
 		 316 aa  110  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  30.89 
 
 		 388 aa  110  3e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  28.21 
 
 		 317 aa  110  3e-23  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1953  ROK family protein  31.85 
 
 		 321 aa  110  5e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  29.9 
 
 		 321 aa  109  7.000000000000001e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0297  ROK family protein  35.02 
 
 		 321 aa  109  8.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  32.93 
 
 		 401 aa  108  9.000000000000001e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>