More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2653 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



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Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_2328  ROK family protein  93.6 
 
 
404 aa  741    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0550455  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2653  ROK family protein  100 
 
 
405 aa  816    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.296978  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0752  ROK family protein  28.21 
 
 
408 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000087715  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  29.4 
 
 
400 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  28.35 
 
 
391 aa  183  5.0000000000000004e-45  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  34.54 
 
 
401 aa  181  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0421  ROK  27.32 
 
 
410 aa  179  8e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0799462 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3295  ROK family protein  31.41 
 
 
428 aa  177  4e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3727  transcriptional repressor of the xylose operon  32.64 
 
 
397 aa  172  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00469917  normal  0.342647 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0217  ROK family protein  30.23 
 
 
395 aa  168  2e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2553  ROK family protein  32.69 
 
 
390 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22750  ROK family protein  28.94 
 
 
396 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4286  ROK family protein  33.64 
 
 
402 aa  166  5e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.333911  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  27.97 
 
 
409 aa  166  8e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3173  ROK domain-containing protein  30.29 
 
 
435 aa  165  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.66636  normal  0.682387 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2656  ROK family protein  30.03 
 
 
418 aa  164  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20690  ROK family protein  26.6 
 
 
383 aa  163  5.0000000000000005e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1089  ROK family protein  28.68 
 
 
396 aa  162  1e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2512  ROK family protein  30.68 
 
 
401 aa  162  1e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1772  ROK family protein  29.35 
 
 
386 aa  159  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.415249  normal  0.404833 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2995  ROK family protein  30.97 
 
 
393 aa  159  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4635  ROK family protein  34.09 
 
 
401 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.892035  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00770  ROK family protein  29.49 
 
 
378 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000483979  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2001  putative xylose repressor  29.13 
 
 
414 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244297  normal  0.176601 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2357  ROK family protein  26.89 
 
 
397 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0693  ROK family protein  29.28 
 
 
402 aa  153  5.9999999999999996e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0617  ROK family protein  29.48 
 
 
399 aa  153  5.9999999999999996e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4743  ROK family protein  33.07 
 
 
395 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4279  ROK family protein  35.01 
 
 
390 aa  151  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.141771 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  28.85 
 
 
386 aa  150  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3199  ROK family protein  28.45 
 
 
407 aa  150  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.845236 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1677  ROK family protein  32.05 
 
 
435 aa  149  7e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0477  ROK family protein  28.12 
 
 
405 aa  149  8e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.514713  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4247  ROK family protein  27.99 
 
 
408 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.120914  normal  0.401593 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27730  transcriptional regulator/sugar kinase  29.48 
 
 
410 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.514205 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003012  Mlc transcriptional repressor of MalT (the transcriptional activator of maltose regulon) and manXYZ operon  25 
 
 
405 aa  147  4.0000000000000006e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3430  ROK family protein  23.79 
 
 
399 aa  146  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1181  xylose operon repressor  27.75 
 
 
425 aa  145  1e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0159  ROK family protein  26.45 
 
 
400 aa  145  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5303  transcriptional regulator ROK family  31.32 
 
 
379 aa  144  2e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0169  ROK family protein  30.37 
 
 
397 aa  144  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.951139  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02870  hypothetical protein  25 
 
 
434 aa  144  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1491  ROK family protein  30.83 
 
 
410 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4652  ROK family protein  29.65 
 
 
422 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.219121  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2843  ROK family protein  27.75 
 
 
425 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5335  ROK family protein  26.48 
 
 
401 aa  144  4e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.123634  normal  0.740513 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2150  ROK family protein  30.81 
 
 
395 aa  142  8e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2208  xylose repressor  27.27 
 
 
364 aa  142  9e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.308125  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4416  ROK family protein  28.88 
 
 
396 aa  142  9.999999999999999e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0286  ROK family protein  25 
 
 
402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.162895  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4562  ROK family protein  29.82 
 
 
414 aa  140  3e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3539  transcriptional repressor of the xylose operon  29.47 
 
 
395 aa  140  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.689033  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2620  ROK family protein  28.69 
 
 
425 aa  140  6e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.92 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1858  NagC family Transcriptional regulator  28.19 
 
 
389 aa  139  7.999999999999999e-32  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.00000905056  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3375  ROK family protein  30.06 
 
 
389 aa  138  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0937322  normal  0.711006 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32910  transcriptional regulator/sugar kinase  31.3 
 
 
400 aa  138  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.235985  normal  0.423272 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1760  ROK family protein  30.86 
 
 
425 aa  137  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.533551  normal  0.0181472 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0855  ROK family protein  28.37 
 
 
385 aa  137  3.0000000000000003e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2298  ROK family protein  30.43 
 
 
389 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  unclonable  0.0000000166992  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0488  ROK family protein  23.5 
 
 
408 aa  136  5e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0318886  normal  0.538791 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3420  ROK family protein  25.13 
 
 
381 aa  136  6.0000000000000005e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000111395  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5222  ROK family protein  27.78 
 
 
429 aa  136  7.000000000000001e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27980  transcriptional regulator/sugar kinase  29.31 
 
 
420 aa  136  7.000000000000001e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0812883  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5341  ROK family protein  30 
 
 
404 aa  135  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17010  transcriptional regulator/sugar kinase  32.94 
 
 
386 aa  135  9.999999999999999e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00455461  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4041  ROK family protein  25.8 
 
 
390 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.787367  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0116  ROK family protein  28.46 
 
 
398 aa  135  1.9999999999999998e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0579  ROK family protein  25.87 
 
 
388 aa  134  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.255348  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3852  ROK family protein  30.31 
 
 
390 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1260  ROK family protein  30.32 
 
 
397 aa  134  3e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00464207 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2995  ROK family protein  24.43 
 
 
408 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.403237  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5676  ROK family protein  30.03 
 
 
400 aa  133  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0716593  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3264  ROK family protein  31.53 
 
 
387 aa  133  5e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.198191  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  27.49 
 
 
312 aa  133  6e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  29.55 
 
 
352 aa  133  6.999999999999999e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1189  ROK family protein  29.91 
 
 
374 aa  132  1.0000000000000001e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.126055  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1105  ROK family protein  29.49 
 
 
396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.348719  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2486  ROK family protein  29.08 
 
 
417 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1809  ROK family protein  29.5 
 
 
396 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2304  ROK family protein  30.79 
 
 
399 aa  131  2.0000000000000002e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0399  ROK domain-containing protein  27.66 
 
 
402 aa  131  3e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.00000118651  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2683  ROK domain-containing protein  28.21 
 
 
400 aa  130  4.0000000000000003e-29  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2855  ROK family protein  27.55 
 
 
396 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.133469  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  33 
 
 
302 aa  130  4.0000000000000003e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0801  N-acetylglucosamine repressor  24.23 
 
 
406 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0837  N-acetylglucosamine repressor  24.23 
 
 
406 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0729  N-acetylglucosamine repressor  24.23 
 
 
406 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0110065  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0741  N-acetylglucosamine repressor  24.23 
 
 
406 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.388075  normal  0.560523 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0788  N-acetylglucosamine repressor  24.23 
 
 
406 aa  130  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  0.447439 
 
 
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NC_013456  VEA_004130  N-acetylglucosamine-6P-responsive transcriptional repressor NagC ROK family  24.94 
 
 
404 aa  129  7.000000000000001e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  30.45 
 
 
342 aa  129  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
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NC_014151  Cfla_2517  ROK family protein  29.23 
 
 
418 aa  129  8.000000000000001e-29  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_012848  Rleg_4946  ROK family protein  31.97 
 
 
424 aa  129  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
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NC_009457  VC0395_A1593  ROK family transcriptional regulator  23.58 
 
 
405 aa  129  9.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_012858  Rleg_6619  ROK family protein  29.1 
 
 
400 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.326282  normal  0.212393 
 
 
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NC_013947  Snas_4658  ROK family protein  30.36 
 
 
503 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00909635  hitchhiker  0.00487921 
 
 
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NC_011886  Achl_1182  ROK family protein  29.46 
 
 
396 aa  129  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000198514 
 
 
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NC_009664  Krad_3729  ROK family protein  31.87 
 
 
390 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.201606  normal  0.0168592 
 
 
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NC_013530  Xcel_0256  ROK family protein  29.13 
 
 
393 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_013159  Svir_34830  transcriptional regulator/sugar kinase  30.88 
 
 
384 aa  128  2.0000000000000002e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.134022 
 
 
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