More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4775 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4775  ROK family protein  100 
 
 
321 aa  617  1e-175  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4333  ROK family protein  90.03 
 
 
326 aa  504  9.999999999999999e-143  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380756  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0112  ROK family protein  54.21 
 
 
313 aa  253  4.0000000000000004e-66  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7038  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  45.72 
 
 
315 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  41.38 
 
 
302 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00680  transcriptional regulator/sugar kinase  40.33 
 
 
310 aa  182  6e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5908  ROK family protein  41.36 
 
 
322 aa  180  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.704405 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0246  ROK family protein  43.96 
 
 
321 aa  178  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0287  ROK family protein  43.14 
 
 
320 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.490636 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  38.75 
 
 
342 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01960  transcriptional regulator/sugar kinase  42.51 
 
 
322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.739718  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  41.39 
 
 
315 aa  165  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0238  ROK family protein  39.48 
 
 
323 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6923  ROK family protein  43.62 
 
 
299 aa  160  2e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  37.66 
 
 
352 aa  160  4e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2360  ROK family protein  43.29 
 
 
302 aa  155  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.107325 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  34.82 
 
 
315 aa  152  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  31.1 
 
 
300 aa  150  4e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16630  transcriptional regulator/sugar kinase  40.91 
 
 
335 aa  146  5e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.535989  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  32.25 
 
 
298 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19960  transcriptional regulator/sugar kinase  35.5 
 
 
325 aa  141  1.9999999999999998e-32  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.606323  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  31.39 
 
 
316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  37.38 
 
 
311 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  29.03 
 
 
322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  28.43 
 
 
312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  36.16 
 
 
323 aa  134  3e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  32.97 
 
 
328 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  26.07 
 
 
313 aa  133  5e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  37.22 
 
 
314 aa  132  6.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  36.07 
 
 
302 aa  132  9e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4866  glucokinase ROK family  35.85 
 
 
313 aa  131  1.0000000000000001e-29  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0395352 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  35.11 
 
 
314 aa  132  1.0000000000000001e-29  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3108  glucokinase  34.27 
 
 
335 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  33.44 
 
 
303 aa  130  4.0000000000000003e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  31.46 
 
 
321 aa  129  5.0000000000000004e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  35.35 
 
 
314 aa  129  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  33.95 
 
 
313 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  33.13 
 
 
361 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  35.33 
 
 
315 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1116  ROK family protein  29.97 
 
 
320 aa  127  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0146441  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  35.13 
 
 
313 aa  127  3e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1902  glucokinase, ROK family  39.17 
 
 
312 aa  127  3e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.132143  hitchhiker  0.000235661 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1710  ROK family protein  36.67 
 
 
320 aa  127  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2938  glucokinase  30.79 
 
 
317 aa  126  6e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2265  ROK  33.11 
 
 
311 aa  125  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4339  glucokinase  31.58 
 
 
316 aa  125  7e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3649  ROK family protein  31.79 
 
 
297 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3538  ROK family protein  40.36 
 
 
317 aa  125  8.000000000000001e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  0.368494 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3703  ROK family protein  31.79 
 
 
297 aa  125  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.428812  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  34.63 
 
 
320 aa  125  1e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  32.91 
 
 
321 aa  125  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  31.94 
 
 
327 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  31.94 
 
 
327 aa  124  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  31.94 
 
 
327 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  31.94 
 
 
327 aa  124  2e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  31.94 
 
 
327 aa  124  2e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  32.28 
 
 
327 aa  124  2e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  31.94 
 
 
327 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  32.28 
 
 
327 aa  124  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  29.91 
 
 
347 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  33.86 
 
 
315 aa  124  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  31.94 
 
 
327 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  32.28 
 
 
327 aa  124  3e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1181  ROK family protein  34.18 
 
 
336 aa  124  3e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  29.35 
 
 
312 aa  123  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1197  ROK family protein  31.72 
 
 
314 aa  123  5e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3573  ROK family protein  32.81 
 
 
299 aa  122  7e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.406671  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  30.56 
 
 
327 aa  122  7e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  29.78 
 
 
323 aa  122  8e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  34.34 
 
 
321 aa  122  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  36.5 
 
 
313 aa  122  9e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  31.87 
 
 
386 aa  122  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  35.37 
 
 
363 aa  122  9.999999999999999e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0282  glucokinase  31.27 
 
 
335 aa  121  1.9999999999999998e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  27.78 
 
 
315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  27.78 
 
 
315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1636  transcriptional regulator/sugar kinase  28.95 
 
 
300 aa  120  3e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.582275  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  31.4 
 
 
409 aa  120  3e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3238  putative glucokinase, ROK family  33.73 
 
 
360 aa  120  3.9999999999999996e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0755996  normal  0.0350926 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0696  ROK family protein  28.42 
 
 
306 aa  119  6e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0763542  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0676  glucokinase  32.7 
 
 
321 aa  119  7e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  31.46 
 
 
300 aa  119  7e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  35.41 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  30.56 
 
 
307 aa  118  9.999999999999999e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  32.6 
 
 
318 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5336  glucokinase  34.7 
 
 
478 aa  118  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1056  ROK family protein  37.25 
 
 
317 aa  118  9.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1643  glucokinase  27.21 
 
 
313 aa  118  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0150  ROK family protein  35.69 
 
 
312 aa  118  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.403108 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  32.17 
 
 
323 aa  118  1.9999999999999998e-25  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3506  ROK family glucokinase  34.49 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00502776 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  34.49 
 
 
314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  29.17 
 
 
315 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6063  glucokinase, ROK family  33.44 
 
 
312 aa  117  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  25.24 
 
 
400 aa  117  3e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2559  ROK family protein  30.43 
 
 
307 aa  117  3e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  32.73 
 
 
318 aa  117  3e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  35.26 
 
 
363 aa  116  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0552  glucokinase, ROK family  27.48 
 
 
316 aa  116  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  32.84 
 
 
317 aa  116  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>