More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_00680 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_00680  transcriptional regulator/sugar kinase  100 
 
 		 310 aa  592  1e-168  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0728022 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0238  ROK family protein  53.46 
 
 		 323 aa  293  2e-78  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6210  ROK family protein  43.14 
 
 		 302 aa  191  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.115608  normal  0.43177 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4775  ROK family protein  43.01 
 
 		 321 aa  174  9.999999999999999e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000119415 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0112  ROK family protein  43.96 
 
 		 313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0430819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6923  ROK family protein  41.5 
 
 		 299 aa  168  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4333  ROK family protein  40.93 
 
 		 326 aa  163  3e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.380756  normal  0.0512746 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5908  ROK family protein  39.73 
 
 		 322 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.704405 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7038  ROK (repressor, ORF, kinase) family protein  40 
 
 		 315 aa  156  3e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5641  ROK family protein  41.86 
 
 		 315 aa  152  8.999999999999999e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.544428  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2360  ROK family protein  44.08 
 
 		 302 aa  145  9e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.107325 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3092  glucokinase  36.16 
 
 		 352 aa  144  2e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2897  ROK family protein  37.74 
 
 		 312 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3230  ROK family protein  35.92 
 
 		 314 aa  143  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00029412  hitchhiker  0.000117185 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1710  ROK family protein  37.7 
 
 		 320 aa  141  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0493  ROK family protein  34.42 
 
 		 300 aa  135  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.241953 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16630  transcriptional regulator/sugar kinase  41.05 
 
 		 335 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.535989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0246  ROK family protein  38.85 
 
 		 321 aa  135  9.999999999999999e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3170  ROK family protein  36.39 
 
 		 314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1441  glucokinase, ROK family  33.23 
 
 		 314 aa  133  3e-30  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.255203  normal  0.184628 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0992  ROK family glucokinase  30.13 
 
 		 312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1825  ROK family glucokinase  35.81 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.064318  normal  0.188614 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1308  ROK family glucokinase  33.44 
 
 		 313 aa  130  4.0000000000000003e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.301963  normal  0.189583 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01960  transcriptional regulator/sugar kinase  42.53 
 
 		 322 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.739718  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2378  glucokinase, ROK family  34.63 
 
 		 318 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0832  glucokinase  32.79 
 
 		 315 aa  128  1.0000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.618047 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0287  ROK family protein  41.3 
 
 		 320 aa  127  2.0000000000000002e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.490636 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0049  ROK family glucokinase  32.59 
 
 		 315 aa  127  3e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00642511  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0086  glucokinase, ROK family  37.58 
 
 		 313 aa  127  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2991  ROK family glucokinase  32.06 
 
 		 327 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.922063  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16050  glucokinase  29.81 
 
 		 322 aa  126  5e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1821  ROK family protein  33.33 
 
 		 318 aa  125  6e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2512  ROK family protein  33.02 
 
 		 340 aa  125  7e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.615457  normal  0.876353 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0857  glucokinase  31.75 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4377  glucokinase  31.75 
 
 		 327 aa  125  1e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0076  putative glucokinase  30.62 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0098  glucose kinase  30.62 
 
 		 315 aa  124  2e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14240  glucokinase  37.61 
 
 		 311 aa  124  2e-27  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.443484  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1217  ROK family protein  30.31 
 
 		 316 aa  124  2e-27  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0037  ROK family protein  29.81 
 
 		 317 aa  124  2e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  31.68 
 
 		 313 aa  124  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0904  ROK domain-containing protein  35.62 
 
 		 408 aa  123  3e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5161  glucokinase, ROK family  33.12 
 
 		 342 aa  124  3e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.515306 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4116  ROK family glucokinase  31.75 
 
 		 327 aa  123  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1061  ROK family glucokinase  30.45 
 
 		 312 aa  123  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.204957  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0894  ROK family protein  27.63 
 
 		 300 aa  122  5e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3047  glucokinase, ROK family  31.73 
 
 		 315 aa  122  6e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00154361  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4343  glucokinase  31.43 
 
 		 327 aa  122  9e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4165  glucokinase  31.43 
 
 		 327 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131693  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4004  glucokinase  31.43 
 
 		 327 aa  122  9e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4014  glucokinase  31.43 
 
 		 327 aa  122  9e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0552724  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4283  glucokinase  31.43 
 
 		 327 aa  122  9e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4396  glucokinase  31.43 
 
 		 327 aa  122  9e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4487  glucokinase  31.43 
 
 		 327 aa  122  9e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.693624  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0979  glucokinase  35.67 
 
 		 314 aa  122  9e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.191151  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0799  glucokinase, ROK family  31.6 
 
 		 317 aa  121  9.999999999999999e-27  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1908  glucokinase, putative  26.71 
 
 		 313 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2309  glucokinase  29.75 
 
 		 323 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00114411  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2629  ROK family protein  29.97 
 
 		 409 aa  120  1.9999999999999998e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0195  glucokinase, ROK family  36.25 
 
 		 317 aa  120  3e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1389  ROK family protein  34.69 
 
 		 325 aa  120  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.167589  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1684  ROK family protein  29.2 
 
 		 400 aa  119  4.9999999999999996e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2754  ROK family protein  32.59 
 
 		 332 aa  119  9e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5188  ROK family protein  35.69 
 
 		 401 aa  118  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6063  glucokinase, ROK family  33.02 
 
 		 312 aa  117  3e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.428087  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2701  ROK family protein  33.65 
 
 		 314 aa  117  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0819401  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16120  glucokinase  33.23 
 
 		 320 aa  116  3.9999999999999997e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0534228  normal  0.671814 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1141  ROK family protein  28.38 
 
 		 308 aa  116  6e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19540  ROK family protein  31.49 
 
 		 391 aa  115  7.999999999999999e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5226  ROK family protein  31.13 
 
 		 321 aa  115  7.999999999999999e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.515111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2875  ROK domain-containing protein  29.87 
 
 		 303 aa  115  1.0000000000000001e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0985025 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5352  ROK family protein  29.9 
 
 		 298 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  35 
 
 		 313 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1421  ROK family protein  28.47 
 
 		 287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1548  glucokinase  33.65 
 
 		 363 aa  113  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0569057  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2333  ROK family protein  31.35 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.391774 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0273  glucokinase  32.69 
 
 		 361 aa  112  6e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.878639  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1326  ROK family protein  34.52 
 
 		 306 aa  112  6e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0533007  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3108  glucokinase  35.35 
 
 		 335 aa  112  6e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0018  ROK family protein  32.17 
 
 		 321 aa  112  7.000000000000001e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0179  ROK family protein  34.6 
 
 		 320 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0168  ROK family protein  34.6 
 
 		 320 aa  112  8.000000000000001e-24  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1197  ROK family protein  32.1 
 
 		 314 aa  112  9e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3865  glucokinase  36.98 
 
 		 347 aa  112  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2550  ROK family protein  33.22 
 
 		 297 aa  112  9e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0920  glucokinase  29.34 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.635044  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1182  ROK family protein  31.14 
 
 		 386 aa  111  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2069  glucokinase, ROK family  35.18 
 
 		 315 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.222452  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1953  ROK family protein  31.78 
 
 		 321 aa  111  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.109027  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0097  ROK family protein  31.17 
 
 		 319 aa  111  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2111  xylose repressor  35.83 
 
 		 302 aa  110  3e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.044241  normal  0.767119 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15770  glucokinase  36.32 
 
 		 314 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.137107  normal  0.317496 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5489  ROK family protein  30.74 
 
 		 321 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.269543 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1549  glucokinase, ROK family  32.9 
 
 		 363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.158501 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4482  ROK family protein  37.01 
 
 		 385 aa  109  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0138376  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2075  ROK family protein  30.12 
 
 		 328 aa  109  5e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000214155  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0161  glucokinase  33.96 
 
 		 320 aa  109  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.510247  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2646  N-acetylglucosamine kinase  34.15 
 
 		 306 aa  109  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  27.3 
 
 		 291 aa  109  6e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3538  ROK family protein  37.55 
 
 		 317 aa  109  7.000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  0.368494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>